Allexiviruses – pathogens of garlic plants Allexiwirusy – patogeny czosnku pospolitego

Journal Title: Progress in Plant Protection - Year 2016, Vol 56, Issue 3

Abstract

Garlic (Allium sativum L.) is one of the most important culinary herbs in Poland. Viral diseases are among the most serious threats to garlic cultivation. As garlic is vegetatively propagated, virus infections are transmitted from one crop cycle to another through infected cloves. The most commons viruses infecting garlic plants are members of three families: Potyviridae (genus Potyvirus), Betaflexiviridae (genus Carlavirus) and Alphaflexiviridae (genus Allexivirus). These viruses have similar morphological properties and often similar biology, thus it is very difficult to distinguish them. Eight virus species belong to the genus Allexivirus: Garlic mite-borne filamentous virus (GarMbFV), Garlic virus A (GarV-A), Garlic virus B (GarV-B), Garlic virus C (GarV-C), Garlic virus D (GarV-D), Garlic virus E (GarV-E), Garlic virus X (GarV-X) and Shallot virus X (ShVX). Infections of allexiviruses can cause severe losses in garlic production fields such as – decrease in bulbs’ weight (14–32%) and reduction of their diameter (6–11%). Phylogenetic analysis based on nucleotide, as well as amino acid sequences of different genome fragments, has revealed genetic diversity within populations of allexiviruses. Furthermore, the diagnostic methods used for detection of viruses that belong to the genus Allexivirus occurring in garlic plants are described. Czosnek pospolity (Allium sativum L.) jest jedną z najważniejszych roślin przyprawowych uprawianych w Polsce. Ze względu na to, że jest to roślina rozmnażana jedynie w sposób wegetatywny, wirusy przenoszone są z jednego cyklu uprawy na kolejny wraz z zainfekowanymi cebulami. Czosnek jest porażany przede wszystkim przez wirusy należące do trzech rodzin: Potyviridae (rodzaj Potyvirus), Betaflexiviridae (rodzaj Carlavirus) i Alphaflexiviridae (rodzaj Allexivirus). Są to wirusy o zbliżonej morfologii oraz właściwościach biologicznych, dlatego istnieją trudności w rozdzieleniu kompleksu tych wirusów. Do rodzaju Allexivirus należy osiem gatunków wirusów: przenoszony przez szpeciele nitkowaty wirus czosnku (Garlic mite-borne filamentous virus, GarMbFV), wirus A czosnku (Garlic virus A, GarV-A), wirus B czosnku (Garlic virus B, GarV-B), wirus C czosnku (Garlic virus C, GarV-C), wirus D czosnku (Garlic virus D, GarV-D), wirus E czosnku (Garlic virus E, GarV-E), wirus X czosnku (Garlic virus X, GarV-X) i wirus X szalotki (Shallot virus X, ShVX). Obecność allexiwirusów w roślinach czosnku jest przyczyną spadku plonu – redukcja ciężaru cebul (14–32%) oraz ich średnicy (6–11%). Na podstawie wyników przeprowadzonych analiz filogenetycznych, opartych na budowie sekwencji nukleotydów i amino-kwasów różnych fragmentów genomu poszczególnych gatunków ustalono, że allexiwirusy są zróżnicowane genetycznie. Ponadto przedstawiono metody diagnostyczne wykorzystywane do wykrywania i identyfikacji allexiwirusów w roślinach czosnku pospolitego.

Authors and Affiliations

Maria Bereda, Elżbieta Paduch-Cichal

Keywords

Related Articles

Bean seed maggot (Hylemyia florilega Zett.) a threat to green bean production in Masovian voivodeship Zagrożenie uprawy fasoli szparagowej przez śmietkę kiełkówkę (Hylemyia florilega Zett.) w województwie mazowieckim

Two-year observations were carried out on the occurrence and damages caused by bean seed maggot (Hylemyia florilega Zett.) in the area of extensive cultivation of green beans, in Masovian region. The pest was monitored b...

Adiuwanty jako czynnik modyfikujący wpływ herbicydu na aktywność mikrobiologiczną gleby zanieczyszczonej miedzią i cynkiem Adjuvants as a factor modifying the effect of herbicide on microbial activity of soil polluted with copper and zinc

Celem pracy była ocena wpływu adiuwantów stosowanych łącznie z herbicydem na aktywność mikrobiologiczną gleby. Badania prowadzono w warunkach kontrolowanych. Herbicyd zawierający chlorotoluron stosowany łącznie z adiuwan...

Reakcja genotypów kukurydzy na infekcję wybranymi izolatami grzybów z rodzaju Fusarium sekcji Liseola Response of maize genotypes to the infection by selected Fusarium isolates from Liseola section

Fuzarioza kolb kukurydzy powodowana przez grzyby z rodzaju Fusarium spp. wpływa ujemnie na wielkość plonu, jak i na jego jakość, a metabolity wtórne wytwarzane przez te grzyby powodują groźne choroby ludzi i zwierząt. Ob...

Występowanie oraz możliwość zwalczania nawłoci późnej (Solidago gigantea Aiton) Occurrence and the possibility of late goldenrod (Solidago gigantea Aiton) control

Nawłoć późna (Solidago gigantea Aiton) pochodzi z Ameryki Północnej i została zawleczona do Europy. Jest gatunkiem inwazyjnym, który doskonale zaaklimatyzował się w Polsce i wypiera gatunki rodzime. Obecnie nawłoć późna...

The effect of microencapsulated essential oils on the initial growth of maize (Zea mays) and common weeds (Echinochloa crus-galli and Chenopodium album) Wpływ mikrokapsułkowanych olejków eterycznych na początkowy wzrost kukurydzy (Zea mays) i chwastów (Echinochloa crus-galli i Chenopodium album)

The aim of the study was to determine the effect of soil-maltodextrin (MDX) and MDX microencapsulated essential oils (EOs, 12%) of peppermint (Mentha × piperita L.), caraway (Carum carvi L.) or calamus (Acorus calamus L....

Download PDF file
  • EP ID EP173826
  • DOI 10.14199/ppp-2016-049
  • Views 73
  • Downloads 0

How To Cite

Maria Bereda, Elżbieta Paduch-Cichal (2016). Allexiviruses – pathogens of garlic plants Allexiwirusy – patogeny czosnku pospolitego. Progress in Plant Protection, 56(3), 302-311. https://europub.co.uk/articles/-A-173826