Aspects of hereditary angioedema genotyping in the era of NGS: The case of F12 gene
Journal Title: Alergia Astma Immunologia - przegląd kliniczny - Year 2018, Vol 23, Issue 4
Abstract
Objective. To screen a cohort of patients diagnosed with non-FXII angioedema for carriage of variants of F12 gene. Material and methods. DNA samples from 191 patients suffering from primary angioedema with normal C1-INH, 54 samples from non- -affected family members, and 161 samples from C1-INH-HAE (154 type I, 7 type II) patients were included in the study. The F12 gene was genotyped by targeted NGS (100% coverage of translated regions). Sanger sequencing was performed for the verification of all identified variants and family segregation studies. Results. The pathogenic F12 variant c.983C>A was detected in three patients from two unrelated families initially diagnosed as U-HAE. Six additional mutations were identified, four of which were characterized as benign (c.41T>C, c.418C>G, c.1025C>T, c.530C>T) and two of uncertain significance (c.1530G>C, c.1768T>G). Two synonymous variants (c.756C>T and c.711C>T), the common polymorphism c.619G>C, and the functional polymorphism c.-4T>C were detected in allele frequencies similar to those presented in the ExAC database for the European population. One more not yet reported synonymous variant (c. 1599A>G) was also found. Conclusion. Analyzing the entire translated region of F12 gene is important in order to identify new variants that possibly affect HAE expressivity. Interestingly, genetic analysis of F12 supports not only the diagnosis of FXII-HAE but also the correct exclusion diagnosis of U-HAE.
Authors and Affiliations
Sofia Vatsiou, Maria Zamanakou, Gedeon Loules, Teresa González - Quevedo, Grzegorz Porębski, Aldona Juchacz, Chiara Suffritti, Davide Firinu, Dorottya Csuka, Emmanouil Manousakis, Anna Valerieva, Markus Margiel, Henriette Farkas, Anastasios E. Germenis
Keywords
Related Articles
- EP ID EP481968
- DOI -
- Views 51
- Downloads 0
Znaczenie procesów angiogenezy w patofizjologii astmy oskrzelowe
Przewlekłemu zapaleniu w przebiegu astmy oskrzelowej towarzyszy rozbudowa sieci naczyń krwionośnych w drogach oddechowych. Wzmożone procesy angiogenezy u chorych na astmę odzwierciedlają zwiększone zapotrzebowanie tkan...
Trudności diagnostyczne w rozpoznawaniu chorób alergicznych
Diagnostyka chorób alergicznych należy do najtrudniejszych w medy- cynie. Dużym wyzwaniem jest prawidłowe zebranie wywiadu, szcze- gólnie jeżeli chodzi o alergię pokarmową m.in. ze względu na ilość i różnorodność spożyw...
Rupatadyna – lek przeciwhistaminowy o nowym mechanizmie działania
Rupatadyna jest lekiem przeciwhistaminowym drugiej generacji o interesującym profilu farmakologicznym, charakteryzującym się podwójnym antagonizmem, tj. silnie blokuje receptory histaminy H1 i receptory...
Alergia na konia – nowe fakty
Rekreacyjna jazda konna jest popularna, a u pewnej grupy ludzi dużą sympatią cieszą się wyścigi konne. Wiele mówi się o alergii zawodowej u hodowców koni, dżokejów czy weterynarzy. Jednak i stnieją prace, kt...
Management of pregnancy in hereditary angioedema
Hereditary angioedema due to C1-inhibitor deficiency (HAE) is a rare disease. HAE course can be more severe in female patients due to the activation of contact system by endogen oestrogens. Pregnancy can therefore worsen...