Comparison of identification methods of vancomycin-resistant enterococci in MALDI-TOF MS, Vitek 2 and API 20 STREP
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2015, Vol 28, Issue 4
Abstract
Introduction. From the clinical point of view, differentiation of the following species in the genus Enterococcus is the most important: E. faecium and E. faecalis (responsible for over 90% of all enterococcal infections) and E. gallinarum, E. casseliflavus, E. flavescens due to their resistance to low concentrations of vancomycin (VanC phenotype). During research of enterococci strains resistant to vancomycin (VRE), we are observed some of those strains isolated from clinical specimens from hospitalized patients were identified by systems based on biochemical identification: Vitek® 2 and Api 20 STREP (bioMereiux, France) as E. gallinarum while other methods demonstrated that they were vancomycin resistant E. faecium (VRE).Aim. Aim of study was to compare system Vitek2 and Api 20 STREP vs MALDI-TOF MS for enterococci identification.Material and methods. 100 strains of enterococci were identified for species in systems based on biochemical reactions (system Vitek® 2 and API 20 STREP) and mass spectrometry (MALDI-TOF). The detection of ddl and vanC genes was the reference method.Results. The differences in identification of enterococci ranged from 2% in Vitek® 2 system to 6% for ATBTM Expression system in relation to MALDI – Biotyper.Conclusions. High cost and time-consuming of molecular methods, exclude them from the application in routine laboratory diagnosis. However consistency of results in species identification in mass spectrometry MALDI-TOF with genetic methods, abet to use its in routine microbiological diagnosis.
Authors and Affiliations
Łukasz Chabros, Robert T. Kuthan, Anna Sawicka-Grzelak, Grażyna Młynarczyk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP55037
- DOI -
- Views 188
- Downloads 0
Genetyka kliniczna raka trzustki
Rak trzustki jest chorobą o agresywnym przebiegu i należy do nowotworów o wysokim wskaźniku śmiertelności. Rak trzustki znalazł się w pierwszej dziesiątce najczęściej występujących w Polsce nowotworów złośliwych. Średni...
Disease relapse and infectious complications as the main cause of stem cell transplant failure
Introduction. Hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) is an important therapeutic method in hematology, oncology and immunology.Aim. The general overview of the results of HSCT in Bydgoszcz Transplant Center with...
Ból w przewlekłym zapaleniu trzustki
Bóle brzucha w przewlekłym zapaleniu trzustki są najczęstszym objawem choroby i w największym stopniu wpływają na jakość życia chorych.Uważa się, że do wystąpienia bólów przyczyniają się: podwyższone ciśnienie w przewodz...
Niedożywienie szpitalne – ważny problem zdrowotny i ekonomiczny
Stan odżywienia pacjentów w szpitalach ma istotny wpływ na skuteczność leczenia, występowanie powikłań, długość hospitalizacji i koszty leczenia. Dlatego też niezmiernie ważna jest właściwa ocena stanu odżywienia pacjent...
Severe Clostridium difficile infection
Beztlenowa, przetrwalnikująca laseczka Clostridium difficile jest najczęstszą przyczyną zakaźną biegunki szpitalnej. W ostatnich latach rośnie liczba i ciężkość zakażeń, także niezwiązanych z opieką zdrowotną, u osób bez...