Differentiation of Mycobacterium tuberculosis clinical strains using restrikction fragment length polymorphism technique based on hsp65 gene.
Journal Title: مجله دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد - Year 2005, Vol 7, Issue 3
Abstract
Background and aim: Polymerase chain reaction (PCR) coupled with Restriction Fragment Length Polymorphism analysis (RFLP) has been used for genotyping of Mycobacteria in recent years. While detailed differentiation of non tuberculosis Mycobacteria has been described by this technique, even in some species ability of this technique for molecular epidemiology has been proven, only a small number of Mycobacterium tuberculosis (MTB) strains have been studied. The present study was conducted to apply this method to an expanded population of MTB isolates. Methods: A total of 150 clinical isolates were collected from patients referred to TB reference unit, PHLS, Ahvaz, Iran. Acid fast staining was performed for the isolates and they were identified as MTB by using conventional culture and biochemical tests. The PCR-RFLP method uses a simple DNA extraction followed by a PCR step based on amplification of a 439 bp fragment of hsp65 gene involving genus specific primers. The restriction enzyme analysis was then performed by digestion of products with HaeIII and BstEII enzymes. Results: Our results showed that 145 clinical isolates (96.6%) showed the identical restriction patterns similar to M. tuberculosis reference strains equal to 165/140/72 bp fragments for HaeIII and 250/120/82 bp fragments for BstEII digests. Three different patterns were observed for five clinical strains in HaeIII digest as 165/145 bp (three isolates), 180/100/80 bp (one isolate) and 194/72 bp (one isolate), while their BstEII digestion patterns showed no variation and were similar to other isolates. Conclusion: Our results showed that in clinical strains of mycobacterium tuberculosis, few polymorphisms in hsp65 fragment might be present.
Authors and Affiliations
azardokht Khosravi, abdorrazagh Hashemi
Keywords
Related Articles
- EP ID EP82445
- DOI -
- Views 97
- Downloads 0
گزارش یک مورد میاز روده ای ناشی از سارکوفاگا هموروئیدالیس از استان چهارمحال و بختیاری
این گزارش مربوط به پسر بچه 13 ساله¬ای است که ساکن روستای سید صالح کوتاه از توابع شهرستان کوهرنگ در استان چهارمحال و بختیاری می باشد. بیمار در شرح حال خود دردهای شکمی در قسمت راست تحتانی، احساس پری شکم، دفع مدفوع شل دو تا...
ThThe long term effects of occupational electromagnetic fields exposure on peripheral blood indexes in workers of aluminum processing factory of Arak e long term effects of occupational electromagnetic fields exposure on peripheral blood indexes in workers of aluminum processing factory of Arak
Background and aim: The effect of electromagnetic fields on human health and especially the risk of carcinogenesis have been comprehensively studied. However, the vast majority of findings of these studies were controver...
اثرات عصاره آبی گیاه سیر روی خواص الکترو- فیزیولوژیک پایه و وابسته به سرعت در گره دهلیزی – بطنی جدا شده خرگوش <br /> <br />
چکیده: زمينه و هدف: گياهان دارويي، به علت سهولت دسترسي، كاهش عوارض جانبي و قيمت مناسب، به عنوان جايگزين‌هاي شايسته داروهاي شيميايي، همواره مورد توجه بوده‌اند. مطالعات قبلي در مورد اثرات فارماكولوژيك و بيوشيميايي گياه سي...
آگاهي، نگرش و عملكرد زنان مراجعه كننده به مراكز بهداشتي - درماني شهر شهركرد در مورد روشهاي اضطراری پيشگيري از بارداري در سال 1385
چکیده: زمينه و هدف: با توجه به اهمیت تنظیم خانواده و عامل بالقوه پیشگیری اضطراری به منظور جلوگیری از حاملگی های ناخواسته، مطالعه حاضر با هدف تعیین آگاهي، نگرش و عملكرد زنان استفاده کننده از روشهای کاندوم، مقاربت منقطع و...
مقایسه شيوههاي فرزند پروري و كاركرد خانواده در خانوادههاي بد سرپرست، داراي اختلالات رفتاري و عادی<br /> <br />
چکیده: زمينه و هدف: در دو دهه اخير، رابطه بين شيوههاي فرزند پروري و كاركرد خانواده توسط پژوهشگران بسياري مورد مطالعه قرار گرفته است. در پژوهش حاضر رابطه بين شيوههاي فرزند پروري و كاركرد خانواده در خانوادههاي كودكان د...