Fourier dönüşümü kızılötesi spektroskopisi ile CD133+/CD44+ prostat kanser kök hücrelerinin iki boyutlu ve üç boyutlu ortamdaki hücresel farklılıklarının belirlemesi

Journal Title: Dokuz Eylul Universitesi Tip Fakultesi Dergisi - Year 2019, Vol 33, Issue 1

Abstract

GİRİŞ ve AMAÇ: Sferoid kültürleri, hücrelerin kendi iç dinamikleri ve diğer hücrelerle olan etkileşimleri açısından tek tabakalı kültürlere kıyasla tümör dokusunun özelliklerini daha iyi yansıtmaktadır. Bu çalışmanın amacı, üç boyutlu (3D) ve iki boyutlu (2D) kültür ortamlarında üretilen CD133+/CD44+ prostat kanser kök hücrelerinin (KKH) makromoleküllerindeki benzerlik ve farklılıklarının araştırılmasıdır.YÖNTEM ve GEREÇLER: DU-145 prostat kanser hücre hattı içerisindeki CD133+/CD44+ yüzey belirteç özelliklerine sahip KKH’leri akış sitometrisi (FACS) kullanılarak izole edilmiştir. Agarla kaplı kültür kapları ile sferoid yapıları oluşturulmuştur. 2D ve 3D kültür ortamlarındaki KHK hücreleri Fourier dönüşümü kızılötesi (FTIR) spektroskopisi ile karşılaştırılmıştır. BULGULAR: CD133+/CD44+ hücrelerin birinci haftada agarlı kültür ortamlarında mikro-agregatlar oluşturduğu gözlenmiştir. İkinci haftada ise, olgun sferoid yapıların oluştuğu saptanmıştır. 2D ve 3D (multisellüler tümör sferoidleri) kültür ortamlarında üretilen hücreler ile yapılan FTIR analizleri KHK hücre yapısındaki proteinler, lipitler, karbonhidratlar ve nükleik asitlerde (DNA, RNA) önemli derecede farklanmalar olduğunu göstermiştir. Membran lipit açil zincir uzunluğu ve hücre zarı kalınlığı, proteinlerin sekonder yapıları ve DNA oligonükleotitlerin baz sekanslarında veya fonksiyonel gruplarında önemli farklanmaların olduğu tespit edilmiştir. Elde edilen sonuçlar, 3D kültür ortamında üretilen sfreoid yapılarının in vivo tümör dokusu ile benzer özellikler sergilediğini göstermiştir.TARTIŞMA ve SONUÇ: Hücre ortam koşulları ile yaratılmış olan fiziksel, kimyasal ve biyolojik özellikler hücrelerin kendi iç dinamiğini ve mikroçevresi içerisindeki etkileşimlerini önemli derecede etkilemektedir. 2D kültür ortamları ile hücreleri tek boyutta indirgemek hücrelerin gerçek özelliklerini yansıtmamaktadır. Bu nedenle, 3D kültür ortamları ile hücre dinamiklerinin incelenmesi gerekmektedir. Bu çalışmadan elde edilen sonuçlar, kanserde önemli bir hücre popülasyonunu oluşturan KKH’lerin membran yapısı, lipitler, proteinlerin sekonder yapıları ve DNA oligonükleotit yapılarının terapötik hedef olabileceğini göstermektedir.

Authors and Affiliations

Günnur Güler, Eda Açıkgöz, Gülperi Öktem

Keywords

Related Articles

Examples of assessment methods that can be used during clinical phase in medical education

In medical education, a single method is not sufficient to evaluate cognitive, psychomotor and affective areas. It is thought that objective-oriented, multiple and up, to date evaluation methods should be used together....

Düşük Maliyetli Bir Fruktozamin Testinin Otomasyonu, Laboratuvar Performansı Ve Klinik Yararlılığının Değerlendirilmesi

GİRİŞ ve AMAÇ: Bu çalışmanın amacı düşük maliyetli bir fruktozamin ölçüm yöntemini otoanalizöre uyarlamak ve optimize etmek; daha sonra serum fruktozamin seviyesi ile uzun dönemli komplikasyonlar arasındaki ilişkiyi araş...

Comparison of differences in recurrent serum PSA measurements with reference change value

INTRODUCTION: Prostate cancer is one of the most common cancers in men. The prostate-specific antigen is a biochemical parameter that is often used to diagnose and monitoring prostate cancer. Because the intra-individual...

İmmün trombositopenik purpura tanılı hastalarda laparoskopik splenektomiye yanıt: Tek merkez verilerinin değerlendirilmesi

Amaç: İmmün trombositopenik purpura (İTP), edinilmiş trombositopeninin en sık nedenlerinden biridir. İmmün trombositopenik purpura tanılı hastaların ikinci sıra tedavisinde laparoskopik splenektomi (LS) yaygın olarak uyg...

The relationship between left to right shunting congenital heart disease and cardiotrophin-1 in children

Objective: In our study, it was aimed to investigate the interaction of serum cardiotrophin-1 (CT-1) levels in left to right shunting congenital heart disease in children and to evaluate the change of this biomarker with...

Download PDF file
  • EP ID EP532612
  • DOI 10.5505/deutfd.2019.44227
  • Views 72
  • Downloads 0

How To Cite

Günnur Güler, Eda Açıkgöz, Gülperi Öktem (2019). Fourier dönüşümü kızılötesi spektroskopisi ile CD133+/CD44+ prostat kanser kök hücrelerinin iki boyutlu ve üç boyutlu ortamdaki hücresel farklılıklarının belirlemesi. Dokuz Eylul Universitesi Tip Fakultesi Dergisi, 33(1), 45-56. https://europub.co.uk/articles/-A-532612