Identyfikacja Francisella tularensis techniką real - time PCR z wykorzystaniem sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla fragmentów sekwencji genów fopA i tul4
Journal Title: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia - Year 2010, Vol 62, Issue 4
Abstract
Badano przydatność zaprojektowanych starterów FopA F/R, Tul4 F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2, Tul4 S1/S2 dla genów fopA i tul4 do wykrywania F. tularensis. W badaniach, w których użyto 50 szczepów F. tularensis uzyskano wyniki dodatnie. Swoistość reakcji wykazano badając szczepy bakterii non-Francisella tularensis. Przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 zaprojektowanych dla genów fopA dodatnie wyniki amplifikacji uzyskano ze wszystkimi badanymi szczepami F. tularensis. Identyczne wyniki otrzymano w reakcji real - time PCR z zastosowaniem starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 zaprojektowanych dla genu tul4. Swoiste produkty reakcji amplifikacji pojawiły się między 16 a 18 cyklem reakcji. Badania z użyciem starterów i sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla genu fopA wykazały, że charakterystyczna temperatura topnienia produktów wynosiła 61°C, a dla genu tul4 60°C. Przy użyciu starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 czułość oznaczeń wynosiła 10 fg/μl, a przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 1 fg/μl.
Authors and Affiliations
Agata Bielawska-Drózd, Marcin Niemcewicz, Jerzy Gaweł, Michał Bartoszcze, Grzegorz Graniak, Justyna Joniec
Keywords
Related Articles
- EP ID EP75683
- DOI -
- Views 111
- Downloads 0
Helicobacter pylori – charakterystyka drobnoustroju, patogeneza i mikrobiologiczna diagnostyka zakażeń Helicobacter pylori – characteristics of pathogen, pathogenesis and microbiological diagnosis of infections
Zakażenia Helicobacter pylori stanowią istotną przyczynę zgonów związanych z rakiem żołądka u ludzi na całym świecie. Drobnoustrój ten jest też etiologicznym czynnikiem wrzodów żołądka oraz schorzeń dotyczących zarówno u...
Oddziaływanie substancji wydzielanych przez lipofilny szczep Corynebacterium CDC G1 ZMF 3P13 na inne drobnoustroje bytujące na skórze człowieka
Zbadano wpływ substancji wytwarzanych przez Corynebacterium CDC G1 ZMF 3P13 na 22 szczepy (gronkowców, maczugowców i propionibakterii) wspólnie bytujących z nim na skórze i 6 klinicznych izolatów drożdżaków Candida sp. B...
Występowanie genów związanych z wytwarzaniem pili u szczepów Corynebacterium diphtheriae
Introduction. Adhesion of pathogenic bacteria to host cells is a crucial step during infection. The presence of specific adhesion factors on the bacterial cell surface determines the tropism of the pathogen to the tissue...
Mikroflora jelitowa dzieci autystycznych
Istniejące hipotezy łączą autyzm między innymi z czynnikami wirusowymi, grzybiczymi bądź bakteryjnymi, wpływającymi na zaburzenia w rozwoju układu nerwowego, które z kolei powodują trwałe uszkodzenie w obszarze mózgu, zw...
Filogeneza, chorobotwórczość i zróżnicowanie pałeczek Yersinia enterocolitica
Wiedza na temat mechanizmów chorobotwórczości pałeczek Y. enterocolitica uległa w ostatniej dekadzie znacznemu poszerzeniu. W tym czasie odnotowano także istotne zmiany w geograficznym występowaniu wysoce zjadliwych, ame...