Identyfikacja Francisella tularensis techniką real - time PCR z wykorzystaniem sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla fragmentów sekwencji genów fopA i tul4
Journal Title: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia - Year 2010, Vol 62, Issue 4
Abstract
Badano przydatność zaprojektowanych starterów FopA F/R, Tul4 F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2, Tul4 S1/S2 dla genów fopA i tul4 do wykrywania F. tularensis. W badaniach, w których użyto 50 szczepów F. tularensis uzyskano wyniki dodatnie. Swoistość reakcji wykazano badając szczepy bakterii non-Francisella tularensis. Przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 zaprojektowanych dla genów fopA dodatnie wyniki amplifikacji uzyskano ze wszystkimi badanymi szczepami F. tularensis. Identyczne wyniki otrzymano w reakcji real - time PCR z zastosowaniem starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 zaprojektowanych dla genu tul4. Swoiste produkty reakcji amplifikacji pojawiły się między 16 a 18 cyklem reakcji. Badania z użyciem starterów i sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla genu fopA wykazały, że charakterystyczna temperatura topnienia produktów wynosiła 61°C, a dla genu tul4 60°C. Przy użyciu starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 czułość oznaczeń wynosiła 10 fg/μl, a przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 1 fg/μl.
Authors and Affiliations
Agata Bielawska-Drózd, Marcin Niemcewicz, Jerzy Gaweł, Michał Bartoszcze, Grzegorz Graniak, Justyna Joniec
Keywords
Related Articles
- EP ID EP75683
- DOI -
- Views 121
- Downloads 0
Ocena częstości występowania przeciwciał dla werotoksycznych pałeczek Escherichia coli (VTEC) u osób z wybranych grup populacji polskiej Seroprevalence of antibodies against verocytotoxin-producing Escherichia coli (VTEC) in individuals from selected groups of the Polish population
Oceniono częstość występowania przeciwciał dla LPS oraz rekombinowanych białek werotoksycznych pałeczek E. coli u osób z wybranych grup populacji polskiej. Przeprowadzone badania wykazały, że u kilkunastu procent klinicz...
Lekowrażliwość paciorkowców beta-hemolizujących izolowanych z wymazów z gardła i materiału ropnego
Oceniono lekowrażliwość 475 szczepów paciorkowców beta-hemolizujących izolowanych w latach 2005-2009 z wymazów z gardła i materiału ropnego pobranego od hospitalizowanych chorych. Wszystkie szczepy były wrażliwe na ampic...
Ocena przydatności oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów uzyskanych bezpośrednio z posiewu krwi na płynne podłoża namnażające Evaluation of the usefulness of the microbial susceptibility test done directly from blood culture on grooving media
Szybkie oznaczenie lekowrażliwości drobnoustrojów wyhodowanych z krwi ma zasadniczy wpływ na skuteczność antybiotykoterapii. Celem niniejszej pracy była ocena w jakim stopniu oznaczenie lekowrażliwości wykonane bezpośred...
Przeciwbakteryjna aktywność protegryny-1 w stosunku do szczepów Staphylococcus pseudintermedius i Staphylococcus aureus pochodzących od zwierząt Antibacterial activity of protegrin-1 against Staphylococcus pseudintermedius and Staphylococcus aureus strains isolated from animals
Szerząca się obecnie lekooporność gronkowców wywołujących infekcje zarówno u ludzi jak i zwierząt oraz możliwość ich transmisji stanowi światowy problem zdrowia publicznego. Trwają poszukiwania alternatywnych związków pr...
Występowanie przeciwciał klasy IgG dla wirusa odry w surowicach osób w różnym wieku
Introduction: The increase of measles incidence in Poland was recently observed. Furthermore, the analysis of routine serological tests performed in the Department of Virology, NIPH-NIH revealed, that nearly half of youn...