Identyfikacja Francisella tularensis techniką real - time PCR z wykorzystaniem sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla fragmentów sekwencji genów fopA i tul4
Journal Title: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia - Year 2010, Vol 62, Issue 4
Abstract
Badano przydatność zaprojektowanych starterów FopA F/R, Tul4 F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2, Tul4 S1/S2 dla genów fopA i tul4 do wykrywania F. tularensis. W badaniach, w których użyto 50 szczepów F. tularensis uzyskano wyniki dodatnie. Swoistość reakcji wykazano badając szczepy bakterii non-Francisella tularensis. Przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 zaprojektowanych dla genów fopA dodatnie wyniki amplifikacji uzyskano ze wszystkimi badanymi szczepami F. tularensis. Identyczne wyniki otrzymano w reakcji real - time PCR z zastosowaniem starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 zaprojektowanych dla genu tul4. Swoiste produkty reakcji amplifikacji pojawiły się między 16 a 18 cyklem reakcji. Badania z użyciem starterów i sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla genu fopA wykazały, że charakterystyczna temperatura topnienia produktów wynosiła 61°C, a dla genu tul4 60°C. Przy użyciu starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 czułość oznaczeń wynosiła 10 fg/μl, a przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 1 fg/μl.
Authors and Affiliations
Agata Bielawska-Drózd, Marcin Niemcewicz, Jerzy Gaweł, Michał Bartoszcze, Grzegorz Graniak, Justyna Joniec
Keywords
Related Articles
- EP ID EP75683
- DOI -
- Views 95
- Downloads 0
Ocena wrażliwości klinicznych szczepów Escherichia coli na działanie olejku tymiankowego i lawendowego w odniesieniu do ich lekooporności
Przedstawiono wyniki badania aktywności olejków eterycznych tymiankowego i lawendowego wobec klinicznych szczepów Escherichia coli, z jednoczesną oceną lekowrażliwości tych szczepów. Skład olejków eterycznych określono m...
Ocena przydatności wybranych antygenów Mycoplasma pneumoniae do serodiagnostyki mykoplazmozy
Oceniono przydatność wybranych antygenów białkowych, lipoproteinowych i glikolipidowych M. pneumoniae do serodiagnostyki mykoplazmozy. Wykazano, że najczęściej w próbkach surowicy osób z mykoplazmozą wykrywane są przeciw...
Zróżnicowanie gatunkowe i lekowrażliwość grzybów wyosobnionych z krwi pacjentów Szpitala Uniwersyteckiego w Bydgoszczy w latach 2005-2008
Przeprowadzono retrospektywną analizę szczepów grzybów izolowanych z próbek krwi pacjentów Szpitala Uniwersyteckiego w Bydgoszczy w latach 2005-2008. W okresie pierwszych trzech lat objętych analizą obserwowano wzrost li...
Porównanie metody Real-Time PCR i hodowli bakteryjnej w laboratoryjnej diagnostyce rzeżączki u pacjentów Kliniki Dermatologii i Wenerologii Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego The Comparison of Real-Time PCR and bacterial culture in laboratory diagnostics of gonorrhoea in patients of Department of Dermatology and Venereology Medical University of Warsaw
Rzeżączka należy do najczęstszych bakteryjnych chorób przenoszonych drogą płciową. Celem pracy było porównanie metody Real Time PCR oraz hodowli bakteryjnej w laboratoryjnej diagnostyce zakażeń N. gonorhoeae. Zbadano mat...
Komórki Raji, P3HR-1 i Namalwa jako model badania reaktywacji zakażenia wirusem Epsteina-Barr (EBV)
Przedstawiono charakterystykę linii komórkowych wyprowadzonych z chłoniaka Burkitt’a (Raji, P3HR-1 i Namalwa) dotyczącą warunków wzrostu, obecności genomu wirusa EBV, oraz ekspresji receptorów Toll-like (TLR 2, TLR3, TLR...