Identyfikacja Francisella tularensis techniką real - time PCR z wykorzystaniem sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla fragmentów sekwencji genów fopA i tul4
Journal Title: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia - Year 2010, Vol 62, Issue 4
Abstract
Badano przydatność zaprojektowanych starterów FopA F/R, Tul4 F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2, Tul4 S1/S2 dla genów fopA i tul4 do wykrywania F. tularensis. W badaniach, w których użyto 50 szczepów F. tularensis uzyskano wyniki dodatnie. Swoistość reakcji wykazano badając szczepy bakterii non-Francisella tularensis. Przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 zaprojektowanych dla genów fopA dodatnie wyniki amplifikacji uzyskano ze wszystkimi badanymi szczepami F. tularensis. Identyczne wyniki otrzymano w reakcji real - time PCR z zastosowaniem starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 zaprojektowanych dla genu tul4. Swoiste produkty reakcji amplifikacji pojawiły się między 16 a 18 cyklem reakcji. Badania z użyciem starterów i sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla genu fopA wykazały, że charakterystyczna temperatura topnienia produktów wynosiła 61°C, a dla genu tul4 60°C. Przy użyciu starterów Tul4 F/R i sond hybrydyzujących Tul4 S1/S2 czułość oznaczeń wynosiła 10 fg/μl, a przy użyciu starterów FopA F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2 1 fg/μl.
Authors and Affiliations
Agata Bielawska-Drózd, Marcin Niemcewicz, Jerzy Gaweł, Michał Bartoszcze, Grzegorz Graniak, Justyna Joniec
Keywords
Related Articles
- EP ID EP75683
- DOI -
- Views 108
- Downloads 0
Ocena wrażliwości na tygecyklinę klinicznych szczepów pałeczek Campylobacter jejuni opornych na tetracyklinę
Oceniono wrażliwość na tygecyklinę opornych na tetracyklinę szczepów pałeczek Campylobacter jejuni izolowanych na terenie kraju w latach 2007-2008. Stwierdzono, że wszystkie badane szczepy wykazywały in vitro wrażliwość...
Ocena przydatności testu Premi®Test Salmonella do identyfikacji pałeczek Salmonella nietypujących się metodami klasycznymi
Oceniono przydatność komercyjnego testu Premi®Test Salmonella do identyfikacji nietypujących się szczepów pałeczek Salmonella. Spośród 37 przebadanych szczepów, ocenianym testem w pełni zidentyfikowano 21 (56%) szczepów,...
Zakażenia ran wywołane przez maczugowce reprezentujące gatunki bakterii uważanych za oportunistyczne
Przeprowadzono analizę 24 przypadków izolacji z ran w znamiennej ilości Gram-dodatnich maczugokształtnych pałeczek (C. amycolatum, C. striatum, C. grupa G, Brevibacterium sp., C. jeikeium, C. urealyticum, C. grupa F1). S...
Adhezja oraz wytwarzanie śluzu zewnątrzkomórkowego przez dzikie i kliniczne szczepy pałeczek Acinetobacter baumannii
Celem pracy była ocena adhezji i wytwarzania śluzu zewnątrzkomórkowego przez szczepy Acinetobacter baumannii izolowane z różnych środowisk. Spośród 51 badanych szczepów A. baumannii, z materiału pochodzącego z dolnych dr...
Wpływ właściwości hydrofobowych Candida sp. Na zdolność wytwarzania biofilmu na powierzchni wybranych biomateriałów
Oceniono właściwości hydrofobowe 150 szczepów Candida sp. wykorzystując metody agregacji: w soli (SAT) i w p-ksylenie (MATH). Zdolność wytwarzania biofilmu oceniano metodą redukcji TTC na 5 biomateriałach: lateksie silik...