Identyfikacja profilu ekspresji genów związanego z opornością ex vivo na etopozyd w dziecięcych ostrych białaczkach
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2012, Vol 66, Issue 0
Abstract
Wstęp: Oporność na terapię oraz związany z nią profil ekspresji genów dyskryminują wyniki leczenia, a także wskazują podgrupy pacjentów z niekorzystnym rokowaniem. Celem badań była analiza profilu ekspresji genów w korelacji z profilem chemiooporności ex vivo na etopozyd u dzieci z ostrymi białaczkami. Materiał/Metody: Profil oporności ex vivo oznaczono w teście cytotoksyczności MTT na komórkach białaczkowych pobranych od 56 pacjentów. Profil ekspresji genów opracowano na podstawie wyników hybrydyzacji cRNA do macierzy oligonukleotydowych HGU133A 2.0 Chip. Do zidentyfikowanego zestawu sond przeprowadzono analizę korelacji, grupowanie hierarchiczne, przypisanie lokalizacji i funkcji. Weryfikację danych o poziomie ekspresji dla 4 wybranych genów (MNDA, GH1, NUDT21, RHOG) przeprowadzono techniką QPCR w badanej oraz niezależnej grupie 54 pacjentów. Wyniki: Za pomocą permutacyjnego testu korelacji Spearmana wyselekcjonowano zestaw 233 sond/209 genów. Ekspozycja blastów białaczkowych na etopozyd inicjuje złożoną odpowiedź komórkową, będącą odzwierciedleniem globalnych zmian ekspresji genów. Globalny test istotności różnic potwierdził (p<0,001) związek profilu ekspresji genów z opornością na etopozyd. Gen NUDT21 (Nudix, nucleoside diphosphate linked moiety X-type, motif 21) wykazywał najsilniejszą korelację z opornością na etopozyd (FDR<0,0001%). Podsumowanie: Profilowanie ekspresji genów może pomóc w ocenie wrażliwości na leki stosowane w chemioterapii dużymi dawkami. Oporność na etopozyd prawdopodobnie jest związana ze znaczną liczbą biologicznie ważnych genów i jest konsekwencją współistnienia w komórce nowotworowej różnych mechanizmów.
Authors and Affiliations
Joanna Szczepanek, Jan Styczyński, Andrzej Tretyn, Monika Pogorzała, Mariusz Wysocki
Keywords
Related Articles
- EP ID EP66716
- DOI -
- Views 151
- Downloads 0
Multidirectional action of resistin in the organism
In recent years obesity is treated as a civilization disorder. It is believed that it is the cause of diseases of many system; moreover, moreover obesity can promote the development of many types of cancers and is a majo...
Krótkotrwałe leczenie przeciwnadciśnieniowe zmniejsza stężenie białka C-reaktywnego
Wstęp: Wyniki wielu ostatnio opublikowanych badań ukazują istotne związki między wskaźnikami stanu zapalnego a chorobami układu sercowo-naczyniowego. Stężenie CRP jest uważane za niezależny czynnik ryzyka rozwoju chorób...
Ocena wpływu stymulacji komórek mononuklearnych krwi obwodowej polisacharydami Streptococcus pneumoniae na ekspresję wybranych receptorów Toll-podobnych, markerów aktywacji oraz antygenu FAS u chorych na przewlekłą białaczkę limfocytową
Moczowa cystatyna C jako biomarker uszkodzenia kanalików nerkowych
Cystatyna C (cysC) jest endogennym inhibitorem peptydaz (proteaz) cysteinowych, który od lat jest obiektem badań jako biomarker funkcji nerek. Ze względu na małe rozmiary i brak białek wiążących cystatyna C jest swobodni...
Paksylina i jej znaczenie w procesie starzenia komórek skóry
Morfologia komórek starzejących ulega ciągłym zmianom na poziomie molekularnym, co zaburza ich funkcjonowanie. Wiąże się to z obniżeniem zdolności do syntezy składowych macierzy zewnątrzkomórkowej oraz dysfunkcją integry...