Identyfikacja profilu ekspresji genów związanego z opornością ex vivo na etopozyd w dziecięcych ostrych białaczkach
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2012, Vol 66, Issue 0
Abstract
Wstęp: Oporność na terapię oraz związany z nią profil ekspresji genów dyskryminują wyniki leczenia, a także wskazują podgrupy pacjentów z niekorzystnym rokowaniem. Celem badań była analiza profilu ekspresji genów w korelacji z profilem chemiooporności ex vivo na etopozyd u dzieci z ostrymi białaczkami. Materiał/Metody: Profil oporności ex vivo oznaczono w teście cytotoksyczności MTT na komórkach białaczkowych pobranych od 56 pacjentów. Profil ekspresji genów opracowano na podstawie wyników hybrydyzacji cRNA do macierzy oligonukleotydowych HGU133A 2.0 Chip. Do zidentyfikowanego zestawu sond przeprowadzono analizę korelacji, grupowanie hierarchiczne, przypisanie lokalizacji i funkcji. Weryfikację danych o poziomie ekspresji dla 4 wybranych genów (MNDA, GH1, NUDT21, RHOG) przeprowadzono techniką QPCR w badanej oraz niezależnej grupie 54 pacjentów. Wyniki: Za pomocą permutacyjnego testu korelacji Spearmana wyselekcjonowano zestaw 233 sond/209 genów. Ekspozycja blastów białaczkowych na etopozyd inicjuje złożoną odpowiedź komórkową, będącą odzwierciedleniem globalnych zmian ekspresji genów. Globalny test istotności różnic potwierdził (p<0,001) związek profilu ekspresji genów z opornością na etopozyd. Gen NUDT21 (Nudix, nucleoside diphosphate linked moiety X-type, motif 21) wykazywał najsilniejszą korelację z opornością na etopozyd (FDR<0,0001%). Podsumowanie: Profilowanie ekspresji genów może pomóc w ocenie wrażliwości na leki stosowane w chemioterapii dużymi dawkami. Oporność na etopozyd prawdopodobnie jest związana ze znaczną liczbą biologicznie ważnych genów i jest konsekwencją współistnienia w komórce nowotworowej różnych mechanizmów.
Authors and Affiliations
Joanna Szczepanek, Jan Styczyński, Andrzej Tretyn, Monika Pogorzała, Mariusz Wysocki
Keywords
Related Articles
- EP ID EP66716
- DOI -
- Views 149
- Downloads 0
Parametry angiogenezy a czynniki ryzyka zakrzepicy w czerwienicy prawdziwej
Aim: The assessment of angiogenic parameters in so-called “liquid tumors”, such as myeloproliferative neoplasms, remains an open clinical issue. The aim of the study is to evaluate the concentration of vascular endotheli...
Chlamydiosis of urogenitary tract in humans
Chlamydiae are bacteria commonly found in the environment of human life and they cause many diseases. Chlamydial infections are common among men and women, although they are more often diagnosed in women and they are fre...
Następstwa uzależnienia od alkoholu obserwowane w jamie ustnej
Zespół uzależnienia od alkoholu jest definiowany jako szereg procesów fizjologicznych, behawioralnych i poznawczych, wśród których przyjmowanie substancji psychoaktywnej staje się czynnością dominującą nad innymi rodzaja...
Role of the Hippo pathway in cell proliferation and organ size control. Disorders of the pathway in cancer diseases
The Hippo pathway (also known as SWH – Salvador/Warts/Hippo), discovered for the first time in Drosophila melanogaster, is responsible for cell proliferation and organ size control in mammalian systems. The components of...
IL-18 and IL-18 binding protein concentration in ovarian follicular fluid of women with “tubal factor” subjected to in vitro fertilization
Introduction: Composition of follicular fluid is also regarded to be linked to quality of oocytes, fertilization and quality of the embryo. The aim of this study was to investigate the concentration of IL-18 and IL18BP i...