Identyfikacja profilu ekspresji genów związanego z opornością ex vivo na etopozyd w dziecięcych ostrych białaczkach
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2012, Vol 66, Issue 0
Abstract
Wstęp: Oporność na terapię oraz związany z nią profil ekspresji genów dyskryminują wyniki leczenia, a także wskazują podgrupy pacjentów z niekorzystnym rokowaniem. Celem badań była analiza profilu ekspresji genów w korelacji z profilem chemiooporności ex vivo na etopozyd u dzieci z ostrymi białaczkami. Materiał/Metody: Profil oporności ex vivo oznaczono w teście cytotoksyczności MTT na komórkach białaczkowych pobranych od 56 pacjentów. Profil ekspresji genów opracowano na podstawie wyników hybrydyzacji cRNA do macierzy oligonukleotydowych HGU133A 2.0 Chip. Do zidentyfikowanego zestawu sond przeprowadzono analizę korelacji, grupowanie hierarchiczne, przypisanie lokalizacji i funkcji. Weryfikację danych o poziomie ekspresji dla 4 wybranych genów (MNDA, GH1, NUDT21, RHOG) przeprowadzono techniką QPCR w badanej oraz niezależnej grupie 54 pacjentów. Wyniki: Za pomocą permutacyjnego testu korelacji Spearmana wyselekcjonowano zestaw 233 sond/209 genów. Ekspozycja blastów białaczkowych na etopozyd inicjuje złożoną odpowiedź komórkową, będącą odzwierciedleniem globalnych zmian ekspresji genów. Globalny test istotności różnic potwierdził (p<0,001) związek profilu ekspresji genów z opornością na etopozyd. Gen NUDT21 (Nudix, nucleoside diphosphate linked moiety X-type, motif 21) wykazywał najsilniejszą korelację z opornością na etopozyd (FDR<0,0001%). Podsumowanie: Profilowanie ekspresji genów może pomóc w ocenie wrażliwości na leki stosowane w chemioterapii dużymi dawkami. Oporność na etopozyd prawdopodobnie jest związana ze znaczną liczbą biologicznie ważnych genów i jest konsekwencją współistnienia w komórce nowotworowej różnych mechanizmów.
Authors and Affiliations
Joanna Szczepanek, Jan Styczyński, Andrzej Tretyn, Monika Pogorzała, Mariusz Wysocki
Keywords
Related Articles
- EP ID EP66716
- DOI -
- Views 126
- Downloads 0
The role of genetic and environmental factors in the etiology of esophageal atresia and tracheo-esophageal fistula
Esophageal atresia and tracheo-esophageal fistula are severe congenital malformations, whose etiology is still poorly understood. So far, numerous genetic and environmental factors that may contribute to the occurrence o...
The role of estrogens in Parkinson’s disease
Parkinson’s disease (PD) is a chronic progressive neurodegenerative disorder of the central nervous system. It has a high prevalence, which significantly increases with age. This disease significantly deteriorates the qu...
Nanostruktury – ogólne informacje. Zastosowanie nanoobiektów w medycynie i kosmetologii
Obserwowane na całym świecie dążenie do miniaturyzacji systemów technologicznych, jak i materiałów, spowodowało intensywny rozwój nanotechnologii - technologii bazującej na nanomateriałach. Nanotechnologia jest bardzo sz...
Cytotoksyczny i proapoptotyczny wpływ bendamustyny zastosowanej pojedynczo lub w skojarzeniu z rytuksymabem na komórki przewlekłej białaczki limfocytowej in vitro
Usefulness of estimation of blood procalcitonin concentration versus C-reactive protein concentration and white blood cell count for therapeutic monitoring of sepsis in neonates
Aim: This study was intended to assess the clinical usefulness of blood procalcitonin (PCT) concentrations for the diagnosis and therapeutic monitoring of nosocomial neonatal sepsis.Material/Methods: The enrolment criter...