İmmün sistemi baskılı hastaların klinik örneklerinden soyutlanan Candida türlerinin PCR ile belirlenmesi ve antifungal direnç genlerinin RFLP ve sekans analizi ile saptanması
Journal Title: Dicle Tıp Dergisi - Year 2012, Vol 39, Issue 2
Abstract
Amaç: Bu çalışmanın amacı immun sistemi baskılı hastalardan elde edilen klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinde PCR tekniğinin ve RFLP ve sekans analizi ile antifungal direnç genlerinin araştırılmasıdır. Gereç ve yöntem: Çalışmada immün sistemi baskılı 200 hastadan alınan klinik örnekler (96 bronkoalveoler lavaj, 56 biyopsi-apse, 8 kan, 15 periton diyaliz sıvısı, 15 plevra sıvısı, 5 beyin omurilik ve 5 perikard sıvısı) geleneksel ve moleküler yöntemler ile incelenmiş ve sonuçlar değerlendirilmiştir. Örneklerden mantar DNA’sı saptandıktan sonra elde edilen ürünün, multipleks PCR yardımı ile tür düzeyinde tanısı yapılmış, antifungal direnci E-test, direnç genleri ise RFLP analizi ile saptanmıştır. Bulgular: İkiyüz örneğin 30’unda (%15) kültür yöntemleri ile pozitif sonuç alınmış [20 Candida albicans (%67), beş Candida parapsilosis (%17), beş Candida tropicalis (%17)], 170 (%85) örnekte üreme olmamıştır. Genel primerler ile yapılan PCR testi sonucunda kültürleri olumlu bulunan 30 örneğin tümünün mantar DNA’sı içerdiği belirlenmiştir. İzole edilen suşların biri E-test yöntemiyle flukanozole dirençli, ikisi flukanozole doza bağlı duyarlı olarak saptanırken 27’si duyarlı olarak bulunmuştur. Seçilen uygun primerler ile BamHI ve SalI enzimleri kullanılarak RFLP uygulanmış, yapılan analizler sonucunda dirençli bir C.albicans suşunda 600 bp’lik bant görülmüştür. Candida dubliniensis (950 bp) ve Candida krusei (360 bp) ile yapılan multipleks PCR optimizasyonunda başarı sağlanmıştır. Suşların ERG genine uygun primer çiftleri ile PCR’ları yapıldıktan sonra yapılan sekans analizi sonucunda dirençli C.albicans suşu referans gen ile karşılaştırıldığında D132E, E216D mutasyonları belirlenmiştir. Sonuç: Moleküler test yöntemleri özellikle immün sistemi baskılanmış hasta populasyonunun kısa sürede doğru tedavisine olanak sağladıkları için yaşamsal açıdan önemlidir.
Authors and Affiliations
Serdar Susever, Yıldız Yeğenoğlu
Keywords
Related Articles
- EP ID EP135225
- DOI -
- Views 129
- Downloads 0
Yttrium-90 radioembolization for the treatment of unresectable liver cancer:Results of a single center
Objective: To determine the effects of yttrium-90 (Y-90) resin microsphere radioembolization therapy on patients with unresectable liver cancer who do not benefit from chemotherapy. Methods: Fifty-five patients under...
Akut Mezenterik İskemi Tanısında ve Akut Pankreatit ile Akut Kolesistitten Ayırıcı Tanısında D-Dimerin Önemi
Amaç: Kötü prognozu ve yüksek mortalite oranı nedeniyle akut mezenterik iskemi (AMİ)’nin erken tanısı sorundur. AMİ’nin tanısında serum belirteçlerinin yeri oldukça sınırlı olup son yıllarda D-dimer testi ile ilgili ç...
Bilateral simultane çekiç parmak: Sıra dışı bir olgu
Çekiç parmak, distal falanks bazisindeki ekstansör mekanizmanın aşırı ve ani şekilde fleksiyona zorlanması sonucu oluşan bir deformitedir. Akut dönemde distal interfalangeal eklemi hiperekstansiyonda tutan splintler i...
The calibration of the percutaneous nephrolithotomy instruments used in pediatric patients with renal stones
The Factors Affecting Success of Pneumatic Retinopexy in Treatment of Retinal Detachment
Objective: To present the factors that influence the success rate of pneumatic retinopexy on rhegmatogenous retinal detachment treatment. Methods: Ninety eyes of 29 female and 61 male patient were included to the stud...