Molecular organization of 5S rDNA of perennial ryegrass Lolium perenne L.
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2018, Vol 16, Issue 2
Abstract
Aim. Ribosomal DNA (rDNA) is an important tool for molecular taxonomy and represents a convenient model for studying the evolution of repeated sequences. However, for many groups of angiosperms, 5S rDNA remains poorly studied, in particular for such a large group as the Poaceae (Gramineae) family. Accordingly, it was decided to analyze the molecular organization of 5S rDNA in the widespread and economically important species Lolium perenne. Methods. DNA extraction, PCR amplification, cloning and sequencing. Results. Two clones of L. perenne 5S rDNA were sequenced. It was shown that only one variant of 5S rDNA repeats with a 188–189 bp-long intergenic spacer (IGS) is present in the genome of L. perenne. Putative RNA polymerase III promoter elements were detected in the IGS. The level of IGS sequence similarity between representatives of different genera of the tribe Poeae ranges from 46 to 63 %. Conclusions. Comparison of IGS can be used to clarify the phylogenetic relationship between taxa of low ranks, in particular, between species and genera of the tribe Poeae. Keywords: 5S rDNA, intergenic spacer, molecular evolution, Lolium, Poaceae.
Authors and Affiliations
O. O. Ishchenko, I. I. Panchuk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613129
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.16.2.1054
- Views 94
- Downloads 0
Stem deposition ability in modern winter wheat varieties under different environmental conditions as a physiological marker of their productivity
Aim. The search of relationship between characteristics of the stem deposition ability in winter wheat modern varieties and grains productivity under different environmental conditions. Methods. Field, biochemical (solub...
Характеристика сортів пшениці селекції Полтавської державної аграрної академії за допомогою маркерів до генів, що визначають важливі господарсько-агрономічні ознаки
Метою роботи було визначення алелів генів Ppd-А1, Ppd-В1, Ppd-D1, Rht8, Rht-B1, Rht-D1, Pina-D1, Pinb-D1, Wx-A1, Wx-B1, Wx-D1 у сортів озимої м’якої пшениці, створених в Полтавській державній аграрній академії (ПДАА). Ме...
Evaluation of the influence of bacterial lipopolysaccharides on the resistance of Arabidopsis thaliana to phytopathogenic bacteria
Aim. To study the effect of lipopolysaccharides derived from various strains of Pseudomonas aeruginosa on resistance of Arabidopsis thaliana to phytopathogenic bacteria. Methods. Conventional methods of plant pathology w...
Analysis of protein content and level of 7S and 11S globulins, their ratio in the soybean seed of F6 - F8 hybrid lines
Aims. The goal of research was to study a character of changes and relationship between level of 7S and 11S globulins, their ratio and protein content in the soybean seed of F6-F8 hybrid lines and their parental forms o...
Оцінка генетичноЇ різноманітності різних видів деревних рослин за допомогою поліморфізму інтронів генів β-тубуліну
Мета. Проаналізувати ефективність застосування методу аналізу поліморфізму довжини інтронів генів β-тубуліну (ТВР-метод) для оцінки генетичного різноманіття видів деревних рослин шляхом апробації метода на широкій вибірц...