Molecular organization of 5S rDNA of perennial ryegrass Lolium perenne L.
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2018, Vol 16, Issue 2
Abstract
Aim. Ribosomal DNA (rDNA) is an important tool for molecular taxonomy and represents a convenient model for studying the evolution of repeated sequences. However, for many groups of angiosperms, 5S rDNA remains poorly studied, in particular for such a large group as the Poaceae (Gramineae) family. Accordingly, it was decided to analyze the molecular organization of 5S rDNA in the widespread and economically important species Lolium perenne. Methods. DNA extraction, PCR amplification, cloning and sequencing. Results. Two clones of L. perenne 5S rDNA were sequenced. It was shown that only one variant of 5S rDNA repeats with a 188–189 bp-long intergenic spacer (IGS) is present in the genome of L. perenne. Putative RNA polymerase III promoter elements were detected in the IGS. The level of IGS sequence similarity between representatives of different genera of the tribe Poeae ranges from 46 to 63 %. Conclusions. Comparison of IGS can be used to clarify the phylogenetic relationship between taxa of low ranks, in particular, between species and genera of the tribe Poeae. Keywords: 5S rDNA, intergenic spacer, molecular evolution, Lolium, Poaceae.
Authors and Affiliations
O. O. Ishchenko, I. I. Panchuk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613129
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.16.2.1054
- Views 98
- Downloads 0
«Чарівна паличка» біології – дар ченця з Брно. До 150-річчя публікації роботи Г. Менделя «Досліди над рослинними гібридами»
Представлено біографічні дані засновника сучасної генетики Грегора Менделя, проаналізовано роль його статті «Досліди над рослинними гібридами», як наукової праці, що стала одним із ключових факторів, які перетворили біол...
Алельний стан гена PavCNR12 у сортів черешні (Prunus avium L.) української селекції
Мета. Протягом останніх десятиріч українські селекціонери створили велику кількість сортів черешні. Подальший прогрес в селекції черешні потребує широкого залучення молекулярних методів. Особливо важливим є розробка мето...
Lysenkoizm phenomenon in the genomic era
During the round table meetings «Retrospective analysis of the learning efficiency in a genetics (Current Issues and Trends)», devoted to the 80-th anniversary of Yurii Mykolaiovych Mishkurov, a knowledge specialist of d...
Cluster analysis in the selection of buckwheat
Abstract. The purpose: using cluster analysis to shorten the selection process duration in buckwheat by grouping hybrid combinations into cluster classes by the similarity of morphological estimates, yield and technologi...
Intron length polymorphism of beta-tubulin genes in Ulmus pumila L. plants in the Steppe Prydniprov'ia
Aim. Using DNA markers related to the genes encoding β-tubulin in plants, to evaluate the intraspecific genetic polymorphism of Ulmus pumila L. in the Steppe Prydniprov'yia and compare it with the polymorphism of this sp...