Mycobacterium tuberculosis kompleksinin saptanmasında dokuz farklı nükleik asit amplifikasyon yönteminin tanısal değeri
Journal Title: Journal of Microbiology and Infectious Diseases - Year 2015, Vol 5, Issue 3
Abstract
Amaç: Bu çalışmada, yayma pozitif balgam örneklerinde ve yayma negatif balgam örneklerinde Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTBK)’nin hızlı tanısında dokuz ticari Nükleik Asit Amplifikasyon Test sistemi (NAAT)’nin tanı performansı değerlendirildi. Yöntemler: Çalışma sırasında kullanılan 60 yayma pozitif ve 55 yayma negatif balgam örneği mikroskopik olarak Erlich Zielh Neelsen (EZN) boyama yöntemi ve Löwenstein Jensen (LJ) besiyerinde kültür ile değerlendirildi. Löwenstein-Jensen kültür yöntemi altın standart olarak kabul edilerek dokuz NAAT yönteminin duyarlılık ve özgüllükleri hesaplandı. Bulgular: Löwenstein Jensen kültür sonuçları altın standart olarak alındığında; Yayma pozitif örneklerde (COBAS Amplicor MTB (Metot A), GenProbe MTD (Metot B), Cobas TaqMan MTB PCR (Metot C), iCycler iQ RT-PCR (Metot D), TaqMan PCR AB 5700 (Metot E), TaqMan PCR AB7700 (Metot F), LightCycler® 480 RT PCR (Metot G), Rotor Gene RT PCR (Metot 104 Tarhan G, et al. Value of nine NAAT methods for Mycobacterium tuberculosis J Microbiol Infect Dis www.jmidonline.org Vol 5, No 3, September 2015 H) ve AdvanSure TB/NTM RT PCR (Metot I) yöntemlerinin duyarlılık oranı sırası ile % 98,3, % 93,3, % 96,7, % 100, % 93,3, % 100, % 100, % 100 ve % 100 olarak bulundu. Bu oran yayma negatif örneklerde A, B, D, E, G ve I yöntemleri için %53,8; C ve H yöntemi için % 38,5; F yöntemi için % 61,5 olarak bulundu. Dokuz NAAT metodu arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunmadı. (p≥0.05). Yayma negatif balgam örneklerinde özgüllük bütün NAAT yöntemleri için % 100 olarak saptandı. Pozitif saptama oranı yayma negatif örneklerde A, B, D, E, G ve I yöntemleri için % 53,8, C ve H yöntemleri için % 38,5 ve F yöntemi için % 61,5 olarak bulundu. Bu oran yayma pozitif balgam örneklerinde D, F, G, H ve I yöntemleri için % 100; A yöntemi için % 98,3, C yöntemi için % 96,7, B ve E yöntemleri için % 93,3 olarak saptandı. Dokuz NAAT yöntemi arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunmadı (p≥0.05). Sonuç: Dokuz NAAT yönteminin yayma pozitif örneklerde MTBK tanısında yararlı olabileceği, ancak yayma negatif örneklerde etkin olmadığı sonucuna varıldı. Anahtar kelimeler: Tüberküloz, polimeraz zincir reaksiyonu, nükleik asit amplifikasyon test, yayma pozitif, yayma negatif
Authors and Affiliations
Gülnur Tarhan, Salih Cesur, Hülya Şimşek, Ismail Ceyhan, Yusuf Ozay, Melike Atasever
Keywords
Related Articles
- EP ID EP127821
- DOI 10.5799/ahinjs.02.2015.03.0186
- Views 131
- Downloads 0
Anti-tüberküloz tedavisi alan ergen yaştaki bir kız çocuğunda kendiliğinden iyileşen hemofagositik sendrom
Enfeksiyon ilişkili hemofagositik sendrom (HPS) nadirdir ve potansiyel olarak ölümcül olabilir. Reaktif HPS, tüberküloz dâhil olmak üzere çeşitli enfeksiyonlarla birlikte bildirilmiştir. Tüberküloz ilişkili HPS erişkinle...
Feco-orally transmitted viral hepatitis in a tertiary care hospital in urban India
Objective: To investigate the magnitude and pattern of hepatitis viral markers in feco-orally transmitted acute viral hepatitis with their relation to age and sex. Methods: This prospective study was carried out in two...
Current Prognostic Factors of Tetanus in Abidjan: 2005-2014
Objective: To describe the epidemiological, clinical and prognosis aspects of tetanus in patients hospitalized at the Infectious and Tropical Diseases Unit of Treichville Teaching Hospital. Methods: A retrospective study...
Mısır, Zagazig Üniversitesi Hastaneleri’nde fungal keratit insidansı ve hızlı tanısında direkt mikroskopi ve PCR tekniğinin yeri
Amaç: Fungal keratit (FK) sıklığının, risk faktörlerinin ve korneal örneklerin direkt mikroskopi ile incelenmesi ve PCR tekniğinin tanı değerinin araştırılması. Yöntemler: Mısır’da, Zagazig Üniversitesi Hastaneleri Göz...
Urged Nephrectomy in a Renal Transplant Recipient
Acute Urinary Tract Infection (UTI) not only affects a patient well-being but also gives rise to several issues like Interaction of antibiotics with immunosuppressive drugs, isolation of resistant strains, recurrent UTI,...