Mycobacterium tuberculosis kompleksinin saptanmasında dokuz farklı nükleik asit amplifikasyon yönteminin tanısal değeri
Journal Title: Journal of Microbiology and Infectious Diseases - Year 2015, Vol 5, Issue 3
Abstract
Amaç: Bu çalışmada, yayma pozitif balgam örneklerinde ve yayma negatif balgam örneklerinde Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTBK)’nin hızlı tanısında dokuz ticari Nükleik Asit Amplifikasyon Test sistemi (NAAT)’nin tanı performansı değerlendirildi. Yöntemler: Çalışma sırasında kullanılan 60 yayma pozitif ve 55 yayma negatif balgam örneği mikroskopik olarak Erlich Zielh Neelsen (EZN) boyama yöntemi ve Löwenstein Jensen (LJ) besiyerinde kültür ile değerlendirildi. Löwenstein-Jensen kültür yöntemi altın standart olarak kabul edilerek dokuz NAAT yönteminin duyarlılık ve özgüllükleri hesaplandı. Bulgular: Löwenstein Jensen kültür sonuçları altın standart olarak alındığında; Yayma pozitif örneklerde (COBAS Amplicor MTB (Metot A), GenProbe MTD (Metot B), Cobas TaqMan MTB PCR (Metot C), iCycler iQ RT-PCR (Metot D), TaqMan PCR AB 5700 (Metot E), TaqMan PCR AB7700 (Metot F), LightCycler® 480 RT PCR (Metot G), Rotor Gene RT PCR (Metot 104 Tarhan G, et al. Value of nine NAAT methods for Mycobacterium tuberculosis J Microbiol Infect Dis www.jmidonline.org Vol 5, No 3, September 2015 H) ve AdvanSure TB/NTM RT PCR (Metot I) yöntemlerinin duyarlılık oranı sırası ile % 98,3, % 93,3, % 96,7, % 100, % 93,3, % 100, % 100, % 100 ve % 100 olarak bulundu. Bu oran yayma negatif örneklerde A, B, D, E, G ve I yöntemleri için %53,8; C ve H yöntemi için % 38,5; F yöntemi için % 61,5 olarak bulundu. Dokuz NAAT metodu arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunmadı. (p≥0.05). Yayma negatif balgam örneklerinde özgüllük bütün NAAT yöntemleri için % 100 olarak saptandı. Pozitif saptama oranı yayma negatif örneklerde A, B, D, E, G ve I yöntemleri için % 53,8, C ve H yöntemleri için % 38,5 ve F yöntemi için % 61,5 olarak bulundu. Bu oran yayma pozitif balgam örneklerinde D, F, G, H ve I yöntemleri için % 100; A yöntemi için % 98,3, C yöntemi için % 96,7, B ve E yöntemleri için % 93,3 olarak saptandı. Dokuz NAAT yöntemi arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunmadı (p≥0.05). Sonuç: Dokuz NAAT yönteminin yayma pozitif örneklerde MTBK tanısında yararlı olabileceği, ancak yayma negatif örneklerde etkin olmadığı sonucuna varıldı. Anahtar kelimeler: Tüberküloz, polimeraz zincir reaksiyonu, nükleik asit amplifikasyon test, yayma pozitif, yayma negatif
Authors and Affiliations
Gülnur Tarhan, Salih Cesur, Hülya Şimşek, Ismail Ceyhan, Yusuf Ozay, Melike Atasever
Keywords
Related Articles
- EP ID EP127821
- DOI 10.5799/ahinjs.02.2015.03.0186
- Views 98
- Downloads 0
Primary hepatic actinomycosis mimicking a tumor (inflammatory pseudotumor): Case report and literature review
Actinomycosis often manifests with abscesses in the cervicofacial region. Hepatic involvement occurs usually secondary to an intraabdominal infection. “Isolated or primary hepatic actinomycosis (PHA) defines actinomycosi...
Hastane kökenli Acinetobacter bakteriyemisinde risk faktörleri: Yoğun bakım hastalarında bir vaka kontrol çalışması
Amaç: Bu çalışma yoğun bakımda gelişen hastane kökenli Acinetobacter bakteriyemilerinde risk faktörlerinin belirlenmesi, hastalığın klinik sonuçlarının ve bakteriyemiye atfedilen mortalitenin saptanması için yapıldı. Yö...
Seroprevalence of Hepatitis B, C and HIV/AIDS in Asylum Seekers in Istanbul
Objective: This study aimed to determine prevalence of hepatitis B, C and HIV/AIDS in asylum seekers in Istanbul, Turkey. Methods: The data about asylum seekers who applied in Istanbul between March 2008 and March 2010...
An investigation of type 3 secretion toxins encoding-genes of Pseudomonas aeruginosa isolates in a University Hospital in Egypt
Objective: Pseudomonas aeruginosa uses type 3 secretion system (T3SS) to directly inject four toxins into host cells. The aim of the study was to determine the prevalence of the toxins-encoding genes among P. aeruginosa...
A Case of Meropenem Induced Cholestasis
Meropenem is a broad-spectrum carbapenem antibiotic used for complicated hospital infections. Mild aminotransferase elevations have been reported in meropenem recipients, but cholestasis is rare. A 70 year old man was ad...