Последовательность хромосомы Streptomyces globisporus 1912-2, гомологичная гену afsA S. griseus NBRC 13350
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2015, Vol 13, Issue 1
Abstract
Цель – выявить последовательность хромосомной S. globisporus 1912-2, гомологичной аrpA-гена S. griseus NBRC 13350 и определить in silico степени сходства первичного строения данной последовательности и аrpA-генов других микроорганизмов. Методы. Использовались ресурсы сервера NCBI (BLAST: blastx, discontiguous megablast) для in silico анализа библиотеки контигов S. grlobisporus 1912-2 и Интернет баз данных. Результаты. Выявлено нуклеотидную последовательность аrpA-гена S. globisporus 1912-2, детерминирующую фермент AfsA, которая расположена на Contig 70 (5134 – 6078 п.н.). Нуклеотидное строение упомянутой последовательности идентично на 84 % аfsA-гену S. griseus NBRC 13350. Только у семи штаммов стрептомицетов из 4 родов обнаружено последовательности, гомологичные более чем на 80 % последовательности afsA-гена S. globisporus 1912-2 при степени их идентичности большей 75 %. Выводы. Установлено наличие в хромосоме S. globisporus 1912-2 afsA-гена, детерминирующего фермент (AfsA), который обеспечивает синтез А-факторподобного вещества. Фермент AfsA S. globisporus 1912-2 имеет типичную для ферментов Нot_dog-суперсемейства архитектуру: образуются два "hotdog fold" домены из AfsA-семьи.Ключевые слова: стрептомицет, нуклеотидная последовательность, гомология, ген, фермент.
Authors and Affiliations
L. V. Polishchuk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613846
- DOI -
- Views 87
- Downloads 0
Characterization of subunit composition of 7S and 11S globulins from soybean varieties of different phylogenetic origin
Aim. The aim of the work was to study the features of subunit composition of 7S and 11S globulins from soybean varieties of different phylogenetic origin. Methods. Isolation and identification of 7S and 11S soybean globu...
Професор Ю.П. Мірюта – педагог і вчений (до 110-річчя від дня народження)
Висвітлено, поряд з відомими, нові біографічні та архівні матеріали про навчання, педагогічну та наукову діяльність видатного українського генетика із вавиловської плеяди вчених професора Юрія Петровича Мірюти, незалежно...
Професор С. В. Клименко — видатний український селекціонер плодових рослин (до 80-річчя від дня народження)
Висвітлено основні віхи життєвого шляху і найголовніші наукові здобутки та досягнення у селекційній і науково-педагогічній роботі члена Українського товариства генетиків і селекціонерів ім. М. І. Вавилова Світлани Валент...
Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М. І. Вавилова та кафедра генетики Київського національного університету імені Тараса Шевченка — 50 років співпраці
У статті коротко проаналізовано спільну роботу Всеукраїнської громадської організації «Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М. І. Вавилова» (УТГіС) та кафедри генетики Київського національного університету...
Наталія Володимирівна Солодюк (8.02.1938 –17.11.2014)