ПРОФІЛЮВАННЯ ГЕНОМУ СОРТІВ ЧЕРЕШНІ УКРАЇНСЬКОЇ СЕЛЕКЦІЇ ЗА ДОПОМОГОЮ IRAP-ПЛР ТА REMAP-ПЛР МАРКЕРІВ
Journal Title: Naukovyi visnyk Chernivetskoho universytetu. Biolohiia (Biolohichni systemy) - Year 2014, Vol 6, Issue 2
Abstract
Використання однорідного садивного матеріалу з підтвердженою генетичною ідентичністю – одна з головних вимог при створенні садів інтенсивного типу. Ефективність методу ідентифікації та аналізу генетичних відмінностей між різними сортами плодових культур за допомогою традиційних фенотипових ознак є недостатньою, оскільки значним чином залежить від впливу факторів зовнішнього середовища. Профілювання геномів з використанням молекулярно-генетичних маркерів є найбільш точним та надійним способом вивчення генетичного різноманіття еукаріотичних геномів. Використання ретротранспозонних генетичних маркерів є потужним засобом для генетичного профілювання еукаріотичних геномів, оскільки вони є найбільш численною групою мобільних елементів в геномі рослин та відіграють важливу роль в його реорганізації у відповідь на дію природного та штучного добору. Проблема пошуку найбільш інформативних маркерних систем для генетичного профілювання геномів сортів черешні є особливо актуальною з огляду на досить низький рівень генетичного поліморфізму у цієї культури. Це є відображенням обмеженої генетичної мінливості геноплазми сортів черешні внаслідок системи гаметофітної самонесумісності. В роботі досліджено 13 сортів черешні української селекції та два сорти закордонної селекції в якості контролю. Загальну геномну ДНК виділяли ЦTAБ-методом з деякими модифікаціями. ПЛР проводили методами IRAP та REMAP. Продукти ампліфікації розділяли в поліакриламідному гелі. Дискримінаційні можливості використаних маркерних систем оцінювали за допомогою різних показників поліморфізму для порівняння їх інформативності. Проведена робота дозволила оцінити дискримінаційні можливості та технічні особливості застосування декількох систем генетичного профілювання геномів сортів черешні української селекції з використанням IRAP- та REMAP-ПЛР маркерів та виявити серед них найбільш перспективні для рутинного аналізування. Використання п'яти праймерів (IRAP-ПЛР) та двох комбінацій праймерів (REMAP-ПЛР) дозволило в сумі отримати 63 маркери, з яких 23.8 % виявилося поліморфними. Було показано, що для генетичного профілювання сортів черешні перспективним є застосування комбінації праймерів TRIM K002 +8565 й окремих праймерів TRIM K002, iPBS 2272 та iPBS 2077.
Authors and Affiliations
Я. І. ІВАНОВИЧ, Н. В. ТРЯПІЦИНА
Keywords
Related Articles
- EP ID EP246021
- DOI -
- Views 151
- Downloads 0
The impact of DON-1R on Microcystis sp. monocultures
The study is intended to investigate the impact of complex drug DON-1R on monocultures of Microcystis sp. Cyanobacteria of Microcystis aeruginosa (Kützing) Kützing та Microcystis pulverea (H.C.Wood) Forti are the dominan...
Застосування препаратів поліненасичених жирних кислот у технології раннього вигодовування осетрових риб
Досліджували ефективність застосування препаратів поліненасичених жирних кислот, біоінкапсульованих в науплії артемії, на ранніх етапах вирощування осетрових риб на прикладі гостроносого осетра та стерляді прісноводної....
ІСТОРІЯ ТА ПЕРСПЕКТИВИ ІНТРОДУКЦІЇ ВИДІВ РОДУ PITTOSPORUM BANKS EX SOL В УМОВАХ ЗАХИЩЕНОГО ГРУНТУ КРИВОРІЗЬКОГО БОТАНІЧНОГО САДУ НАН УКРАЇНИ
У статті наведено відомості щодо історії відкриття видів роду Pittosporum. Висвітлено результати інтродукційних досліджень даного роду в умовах захищеного грунту. Подано опис інтродукованих 9 таксонів: Pittosporum hetero...
Підсумки інтродукції представників родини Vitaceae lindl. у чернівецькій області
Проаналізовано сезонний ритм розвитку 13 видів та 1 форми дерев’янистих ліан родини Vitaceae Lindl. інтродукованої флори Чернівецької області, на основі чого здійснено їх розподіл на фенологічні групи за строками початку...
Effect of nutrient deprivation on the expression of pdgfc, pdgfra, and pdgfrb genes in u87 glioma cells depends on ern1 signaling enzyme function
Growth factors, which control angiogenesis, play an important role in malignant tumor progression. We studied the effect of glucose or glutamine deprivation conditions on the expression level of platelet derived growth f...