Structure of bacterial chromosome: An analysis of DNA-protein interactions in vivo
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2017, Vol 71, Issue
Abstract
According to recent reports, bacterial chromosomes exhibit a hierarchical organization. The number of proteins that bind DNA are responsible for local and global organization of the DNA ensuring proper chromosome compaction. Advanced molecular biology techniques combined with high-throughput DNA sequencing methods allow a precise analysis of bacterial chromosome structures on a local and global scale. Methods such as in vivo footprinting and ChIP-seq allow to map binding sites of analyzed proteins in certain chromosomal regions or along the whole chromosome while analysis of the spatial interactions on global scale could be performed by 3C techniques. Additional insight into complex structures created by chromosome-organizing proteins is provided by high-resolution fluorescence microscopy techniques.
Authors and Affiliations
Joanna Hołówka, Małgorzata Płachetka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP242334
- DOI 10.5604/01.3001.0010.6696
- Views 184
- Downloads 0
Role of leptin in the regulation of lipid and carbohydrate metabolism
Leptin is a hormone secreted primarily by adipose tissue and its blood levels depend on the amount of fat stored in adipocytes. Leptin has a wide range of physiological effects. Acting directly or through the sympathetic...
Bakteryjne topoizomerazy typu I – rola biologiczna i zastosowanie jako potencjalnych celów dla antybiotyków
W komórce bakteryjnej chromosom występuje w postaci niezależnych topologicznie domen, których przestrzenna organizacja kontrolowana jest przez białka zwane topoizomerazami. Prawidłowa topologia chromosomu jest jednym z e...
Wpływ operacji bariatrycznych na ustępowanie cukrzycy typu 2
Plaga otyłości dotyka coraz szerszą grupę ludzi. Wraz z otyłością, coraz powszechniejsza staje się cukrzyca typu drugiego, najpoważniejsza choroba towarzysząca nadmiernej masie ciała. Tradycyjne metody walki z otyłością,...
Porównanie metod optycznych oznaczania liczby bakterii
Hereditary prostate cancer
Prostate cancer (PC) is one of the most common cancers affecting men. It may soon become the main cancer - caused mortality among men all over the world. The genetic basis of prostate cancer is very complex and its etiol...