Structure of bacterial chromosome: An analysis of DNA-protein interactions in vivo
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2017, Vol 71, Issue
Abstract
According to recent reports, bacterial chromosomes exhibit a hierarchical organization. The number of proteins that bind DNA are responsible for local and global organization of the DNA ensuring proper chromosome compaction. Advanced molecular biology techniques combined with high-throughput DNA sequencing methods allow a precise analysis of bacterial chromosome structures on a local and global scale. Methods such as in vivo footprinting and ChIP-seq allow to map binding sites of analyzed proteins in certain chromosomal regions or along the whole chromosome while analysis of the spatial interactions on global scale could be performed by 3C techniques. Additional insight into complex structures created by chromosome-organizing proteins is provided by high-resolution fluorescence microscopy techniques.
Authors and Affiliations
Joanna Hołówka, Małgorzata Płachetka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP242334
- DOI 10.5604/01.3001.0010.6696
- Views 170
- Downloads 0
Ścieżki aktywacji i polaryzacji makrofagów
Powiązania suchości skóry i świądu u chorych na przewlekłą chorobę nerek
Suchość skóry i świąd należą do najczęstszych zmian skórnych u chorych na przewlekłą chorobę nerek. Zmiany skórne są częstsze i o większym nasileniu w grupie dializowanych, niezależnie od rodzaju dializy, w porównaniu do...
Rola receptorów RIG-I-podobnych w odpowiedzi przeciwwirusowej
Wrodzona odporność nieswoista jest pierwszą linią obrony w zakażeniach wirusowych. Receptory Toll-podobne (TLR) oraz RIG-I-podobne (RLR) są dwoma głównymi rodzinami receptorów wykrywającymi wirusowy kwas nukleinowy. Dot...
Systemic contact dermatitis
Systemic contact dermatitis (SCD) is a skin inflammation occurring in a patient after systemic administration of a hapten, which previously caused an allergic contact skin reaction in the same person. Most frequently, hy...
Radiation-induced bystander effect: The important part of ionizing radiation response. Potential clinical implications
It has long been a central radiobiological dogma that the damaging effects of ionizing radiation, such as cell death, cytogenetic changes, apoptosis, mutagenesis, and carcinogenesis, are the results of the direct ionizat...