Taxonomical position of pigmented yeast isolated from Antarctic ecosystems
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 23, Issue
Abstract
Aim. To determine species composition and taxonomic position of extremotolerant Antarctic yeast. Methods. The objects of research were yeast from Antarctic soils and phytocenosis, which are stored in the Collection of Extremophilic Microorganisms at the Institute of Microbiology and Virology of the National Academy of Sciences of Ukraine, Kiev. Yeast were grown on malt wort (рН 5.0–5.5, temperature 18–20°С). Isolation of genomic DNA was performed using a commercial kit DNA-sorb; amplification of DNA preparations – use of primers NL1 and NL4; phylogenetic analysis – construction of dendrograms showing the position of the studied strains among closely related and typical species. Results. The analysis have shown a high percentage of similarity (98.4–99.9 %) of 18S rRNA genes sequences of yeast Antarctic strains and yeast sequences from the database GenBank. It was found that yeast strains belonged to phylum Basidiomycota (genera Rhodosporidium, Rhodotorula) and Ascomycota (genus Exophiala). Conclusions. As it was shown by phylogenetic analysis, red yeast S33, S48, S182 clustered with Rhodotorula mucilaginosa; S14 – with Rhodosporidium diobovatum and can be attributed to these species. Extremotolerant black yeast S10, S36 and S237 refer to the species Exophiala nigra. Keywords:Antarctica, extremotolerant yeast, phylogenetic analysis, species composition.
Authors and Affiliations
Г. В. Гладка, В. О. Романовська, Н. Л. Белькова, О. С. Юнгін, О. Б. Таширев
Keywords
Related Articles
- EP ID EP621455
- DOI -
- Views 43
- Downloads 0
Якість зерна у ліній м’якої пшениці з генетичним матеріалом Triticum kiharae
Мета. Triticum kiharae (AtAtGGDD, 2n=42) є цікавим видом для поліпшення сортів м’якої пшениці як джерело високого вмісту білка, клейковини в зерні і стійкості до багатьох захворювань. З метою збагачення генофонду T. aest...
Генетичне профілювання бактерій роду Pseudomonas, що уражують бобові культури
Мета. З метою коректної внутрішньовидової ідентифікації та оцінки групової гетерогенності було проведено фінгепринтування геномів ізольованих нами і колекційних штамів «Pseudomonas lupinі», а також типових представників...
Chickpea genotypes characteristics on resistance to fusarium Fusarium oxysporum f. sp. ciceris
Aim. Molecular-genetic analysis of the chickpea genotypes for foc0, foc3, foc4 resistance genes to Fusarium oxysporum f. sp ciceris. Methods. Extraction and purification of DNA, spectrophotometry, polymerase chain reacti...
Obtaining of transgenic potato plants (Solanum tuberosum L.) that contain antisense sequence of prolindehydrogenase gene
Aim. The aim of our work was to obtain transgenic potato plants of Ukrainian varieties with the expression of a double-stranded RNA suppressor of proline dehydrogenase gene. We propose the decrease of proline degradation...
Genetic features of the glutathyon system of long livers of Carpathian region with comorbid pathology: arterial hypertension and osteoarthrosis
Aim. To study the polymorphism of GSTM1, GSTT1 genes. To study the activity of enzymes encoding these genes in long-livers with arterial hypertension (AG) and osteoarthritis (OA). Methods. The determination of the freque...