Tüberküloz menenjiti için Cobas Amplicor MTB ve Rotorgene Real Time PCR’ın tanı değeri: 6 yıllık retrospektif çalışma
Journal Title: Journal of Microbiology and Infectious Diseases - Year 2015, Vol 5, Issue 4
Abstract
Amaç: Tüberküloz menejiti (TBM), tüberkülozun (TB) en şiddetli ve öldürücü formudur. TBM’nin bakteriyolojik tanısı zor ve zaman alıcıdır. Bu nedenle, hastaların çoğu sadece klinik ve beyin omurilik sıvısı (BOS)’nın özelliklerine göre anitüberküloz tedavisine alınmaktadır. TBM’nin hızlı tanısı ölüm ve hastalık oranlarını azaltılmasına önem taşımaktadır. Bu çalışmanın amacı tedavi öncesinde ve tedaviye başladıktan sonra TBM’nin tanımlanmasında hızlı bir yöntem olarak COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene Real Time PCR (RT PCR)’ın etkinliğinin araştırılmasıdır. Yöntemler: Bu retrospektif çalışma Ekim 2002-Ocak 2009 tarihleri arasında tüberküloz şüpheli 468 adet BOS örneği ile yapıldı. Klinik örnekler Ankara’daki çeşitli hastanelerden toplandı. Bütün örnekler yayma mikroskopi, katı (Lowenstein-Jensen) ve sıvı besiyerinde (MGIT 960 kültür sistemi) kültür, COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene RT PCR yöntemleri ile değerlendirildi. Bulgular: Kültür yöntemi altın standart olarak kabul edildiğinde duyarlılık, özgüllük, pozitif belirleyicilik değeri (PBD) ve negatif belirleyicilik değeri (NBD) sırası ile COBAS Amplicor MTB için %71,0, %98,8, %97,8 ve %75,0; Rotorgene RT PCR için %80,0, %98,9, %99,0 ve %80,0 olarak bulundu. İstatistiksel analizlerde COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene RT PCR testi arasına anlamlı bir fark bulunmadı (p≥0.05). Löwenstein Jensen besiyerinde proporsiyon yöntemine gore yapılan ilaç duyarlılık testlerinde bütün izolatlar izoniazid, rifampin, streptomisin ve etambutol’a hassas olarak saptandı. Bütün izolatlar spoligotiplendirme yöntemi ile LAM7-TUR olarak tanımlandı. Sonuç: Altı yıllık retospektif değerlendirmede COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene RT PCR testleri BOS örneklerinden MTB’nin hızlı tanısında etkin bulundu. Rotorgene RT-PCR testinin (%81,0), COBAS Amplicor MTB (%71,0) testinden daha duyarlı bulundu. Anahtar kelimeler: Tüberküloz menenjiti, COBAS Amplicor MTB, Rotorgene Real Time PCR
Authors and Affiliations
Gülnur Tarhan, Hülya Şimşek, Salih Cesur, İsmail Ceyhan
Epidemiology and Antimicrobial Susceptibility of Anaerobic Bloodstream Infections: A 10 Years Study
Epidemiology and Antimicrobial Susceptibility of Anaerobic Bloodstream Infections: A 10 Years Study Nadeem Sajjad Raja Department of Microbiology, East Sussex Healthcare Trust, Hastings, England, UK ABSTRACT Objective:...
Isolated testicular tuberculosis masquerading as a testicular tumor
Tuberculosis is a major cause of morbidity and a persisting public health problem in the developing countries. Testicular tuberculosis particularly in isolated form is extremely rare. We report an unique case of testicul...
Hearing loss: Can it be neurobrucellosis?
Brucellosis is a zoonotic infection transmitted from animals to humans mostly by ingestion through infected food products, direct contact with an infected animal. It can involve any organ system and present with a b...
Standardization of process for increased production of pure and potent tetanus toxin
When stationary pot culture was replaced by submerged cultivation of Clostridium tetani, an anaerobic organism, in a fermentor using a vibromixer and optimum supply of sterile air to the headspace of the fermentor to fl...
Sentetik insan katyonik antimikrobiyal peptidi olan hCAP-18/LL37’nin idrar yolu patojenlerine karşı anti-biyofim aktivitesi ve öldürücü etkinliği
Amaç: Cathelicidin LL37 mesane epitel hücrelerinin kimyasal bir savunma komponenti olup antimikrobiyal peptitler arasında idrar yolunda bakterilerin yapışmasını engelleyerek mukozal bağışıklıkta önemli bir role sahiptir....