Tüberküloz menenjiti için Cobas Amplicor MTB ve Rotorgene Real Time PCR’ın tanı değeri: 6 yıllık retrospektif çalışma
Journal Title: Journal of Microbiology and Infectious Diseases - Year 2015, Vol 5, Issue 4
Abstract
Amaç: Tüberküloz menejiti (TBM), tüberkülozun (TB) en şiddetli ve öldürücü formudur. TBM’nin bakteriyolojik tanısı zor ve zaman alıcıdır. Bu nedenle, hastaların çoğu sadece klinik ve beyin omurilik sıvısı (BOS)’nın özelliklerine göre anitüberküloz tedavisine alınmaktadır. TBM’nin hızlı tanısı ölüm ve hastalık oranlarını azaltılmasına önem taşımaktadır. Bu çalışmanın amacı tedavi öncesinde ve tedaviye başladıktan sonra TBM’nin tanımlanmasında hızlı bir yöntem olarak COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene Real Time PCR (RT PCR)’ın etkinliğinin araştırılmasıdır. Yöntemler: Bu retrospektif çalışma Ekim 2002-Ocak 2009 tarihleri arasında tüberküloz şüpheli 468 adet BOS örneği ile yapıldı. Klinik örnekler Ankara’daki çeşitli hastanelerden toplandı. Bütün örnekler yayma mikroskopi, katı (Lowenstein-Jensen) ve sıvı besiyerinde (MGIT 960 kültür sistemi) kültür, COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene RT PCR yöntemleri ile değerlendirildi. Bulgular: Kültür yöntemi altın standart olarak kabul edildiğinde duyarlılık, özgüllük, pozitif belirleyicilik değeri (PBD) ve negatif belirleyicilik değeri (NBD) sırası ile COBAS Amplicor MTB için %71,0, %98,8, %97,8 ve %75,0; Rotorgene RT PCR için %80,0, %98,9, %99,0 ve %80,0 olarak bulundu. İstatistiksel analizlerde COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene RT PCR testi arasına anlamlı bir fark bulunmadı (p≥0.05). Löwenstein Jensen besiyerinde proporsiyon yöntemine gore yapılan ilaç duyarlılık testlerinde bütün izolatlar izoniazid, rifampin, streptomisin ve etambutol’a hassas olarak saptandı. Bütün izolatlar spoligotiplendirme yöntemi ile LAM7-TUR olarak tanımlandı. Sonuç: Altı yıllık retospektif değerlendirmede COBAS Amplicor MTB ve Rotorgene RT PCR testleri BOS örneklerinden MTB’nin hızlı tanısında etkin bulundu. Rotorgene RT-PCR testinin (%81,0), COBAS Amplicor MTB (%71,0) testinden daha duyarlı bulundu. Anahtar kelimeler: Tüberküloz menenjiti, COBAS Amplicor MTB, Rotorgene Real Time PCR
Authors and Affiliations
Gülnur Tarhan, Hülya Şimşek, Salih Cesur, İsmail Ceyhan
Nozokomiyal patojenlerde artan antimikrobiyal direnç; çok ilaca dirençli, yaygın ilaç dirençli ve tüm ilaçlara dirençli Acinetobacter baumannii
Amaç:Bu çalışmada nozokomiyal enfeksiyonlardan izole edilen Acinetobacter spp. suşlarının antimikrobiyal duyarlılıkları tespit edilerek yıllar içerisindeki direnç değişimlerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yönteml...
Effects of Urogenital Schistosomiasis on Academic Performance and Anthropometric Parameters of School-aged Children
Effects of Urogenital Schistosomiasis on Academic Performance and Anthropometric Parameters of School-aged Children Paul Columba Inyang-Etoh1, Francisca Benedict Akpan1, Uloma Opara-Osuoha2 1Department of Medical Labora...
The ‘Starry Sky’ in Tuberculoma
we have to keep tuberculoma as an important differential of the “starry sky” appearance in the developing countries and a thorough clinical examination is of utmost importance in every such case to avoid misdiagnosis and...
Nokardiyoz Epidemiyolojisi – Kuzey Hindistan’dan Altı Yıllık Bir Çalışma
Amaç: Klinik örneklerden yeni Nocardia türlerini izole etmek ve bunların farklı antibiyotiklere olan duyarlılık paternlerini çalışmak. Nokardiyoza eşlik eden değişik risk faktörleri de çalışıldı. Metotlar: Yatan hasta v...
Feco-orally transmitted viral hepatitis in a tertiary care hospital in urban India
Objective: To investigate the magnitude and pattern of hepatitis viral markers in feco-orally transmitted acute viral hepatitis with their relation to age and sex. Methods: This prospective study was carried out in two...