Vankomisin dirençli enterokok’larda (VRE) vanA ve vanB gen prevalansının Taq Man real time PCR assay ile araştırılması
Journal Title: Journal of Microbiology and Infectious Diseases - Year 2013, Vol 3, Issue 4
Abstract
Amaç: Enterokoklar önemli hastane enfeksiyonu etkenidirler ve antimikrobiyal direnç potansiyelleri nedeniyle rezistans genlerinin yayılmasında önemli rolleri bulunmaktadır. Günümüzde bu mikroorganizmalar önemli bir halk sağlığı sorunu olarak tanımlanmıştır. Bu çalışmada İran’daki bazı hastanelerde değişik klinik örneklerden izole edilen vankomisin dirençli enterokok (VRE)’lar arasında vanA ve vanB genlerinin sıklığının araştırılması amaçlandı. Yöntemler: Suşların vankomisin duyarlılıkları E test yöntemiyle araştırılarak minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri belirlendi. Vankomisin dirençli ve vankomisine orta düzeyde dirençli Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında Taq Man real time PCR assay ile vankomisin direncini kodlayan vanA ve vanB genleri hedeflendi. Bulgular: Çalışma süresince klinik örneklerden toplam 235 enterokok suşu izole edildi. Bu şuşlardan 193’ü (% 82,1) E. faecalis, 33’ü (% 14,0) E. faecium, 1’i (% 0,4) Enterococcus avium, 1’i (% 0,4) Enterococcus raffinosus ve 7’si (% 3,0) Enterococcus galinarium olarak tanımlandı. Toplam 235 enterokok suşunda 32’si (% 13,6) VRE idi. Toplam 235 suştan 18 (% 7,7)’i E. faecalis ve 14’ü (% 6,0) E. faecium idi. Bu suşların 27 (% 84,4)’sinde vanA ve vanB genleri belirlendi (bazı izolatlar hem vanA ve hem vanB genlerine sahip idi). Suşların 5’inde (% 15,6) direnç geni belirlenemedi. Sonuçlar: Araştırmamızda klinik VRE suşları arasında E. faecalis suşlarının sıklıkta olduğu ve vanA geninin vankomisin direncine sebep olan en sık gen olduğu gözlendi. Bu çalışma Taq Man real time PCR assay testinin vankomisin direnç genlerinin gösterilmesinde kullanılabilen, kesin ve hızlı bir test olduğunu göstermektedir. Anahtar kelimeler: VRE, Taq Man real time PCR, vanA, vanB, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium
Authors and Affiliations
Bahman Mirzaei, Taghi Farivar, Puran Juhari, Masume Mehr, Ryhane Babaei
Keywords
Related Articles
- EP ID EP115478
- DOI 10.5799/ahinjs.02.2013.04.0107
- Views 126
- Downloads 0
Cerebellar involvement that occurred during treatment of Legionella pneumonia: A case report
Legionnaires’ disease can appear with different levels of severity. A case of a previously healthy lady with communityacquired pneumonia who progressed to severe acute respiratory distress syndrome and developed cerebel...
Intestinal parasitic infections in leukemic patients with diarrhea
Objectives: Leukemic patients are at increased risk of severe infections with parasites. Moreover, intestinal parasites can lead to severe diarrhea in patients with immunosuppression. The purpose of this study is to deci...
Epidemiology of Hepatitis C Virus and Human Immunodeficiency Virus Co-Infection and Challenges in Their Diagnosis
Objective: To screen HCV infection in HIV infected individuals and to compare the genotype and viral load of HCV in these co infected patients versus HIV negative individuals. Methods: Serum samples from 70 HIV infected...
Successful control of outbreak caused by clonally related extensively-resistant Acinetobacter baumannii in an intensive care unit
Objective: Worldwide drug resistance in Acinetobacter baumannii is on the rise. We report outbreak of extensively-resistant (XDR) A. baumannii in a medical intensive care unit (MICU) at a tertiary care referral hospital...
Nasal Extranodal Natural Killer/T Cell Lymphoma in a 69-Year Old Female: A Case Report
Mature natural killer /T-cell (NK/T-cell) lymphomas are a rarely occurring subgroup of Non Hodgkin Lymphomas (NHL). A large majority of NK/T cell lymphomas are extranodal. Nasal type is the most common one. As clinical s...