Vankomisin dirençli enterokok’larda (VRE) vanA ve vanB gen prevalansının Taq Man real time PCR assay ile araştırılması
Journal Title: Journal of Microbiology and Infectious Diseases - Year 2013, Vol 3, Issue 4
Abstract
Amaç: Enterokoklar önemli hastane enfeksiyonu etkenidirler ve antimikrobiyal direnç potansiyelleri nedeniyle rezistans genlerinin yayılmasında önemli rolleri bulunmaktadır. Günümüzde bu mikroorganizmalar önemli bir halk sağlığı sorunu olarak tanımlanmıştır. Bu çalışmada İran’daki bazı hastanelerde değişik klinik örneklerden izole edilen vankomisin dirençli enterokok (VRE)’lar arasında vanA ve vanB genlerinin sıklığının araştırılması amaçlandı. Yöntemler: Suşların vankomisin duyarlılıkları E test yöntemiyle araştırılarak minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri belirlendi. Vankomisin dirençli ve vankomisine orta düzeyde dirençli Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında Taq Man real time PCR assay ile vankomisin direncini kodlayan vanA ve vanB genleri hedeflendi. Bulgular: Çalışma süresince klinik örneklerden toplam 235 enterokok suşu izole edildi. Bu şuşlardan 193’ü (% 82,1) E. faecalis, 33’ü (% 14,0) E. faecium, 1’i (% 0,4) Enterococcus avium, 1’i (% 0,4) Enterococcus raffinosus ve 7’si (% 3,0) Enterococcus galinarium olarak tanımlandı. Toplam 235 enterokok suşunda 32’si (% 13,6) VRE idi. Toplam 235 suştan 18 (% 7,7)’i E. faecalis ve 14’ü (% 6,0) E. faecium idi. Bu suşların 27 (% 84,4)’sinde vanA ve vanB genleri belirlendi (bazı izolatlar hem vanA ve hem vanB genlerine sahip idi). Suşların 5’inde (% 15,6) direnç geni belirlenemedi. Sonuçlar: Araştırmamızda klinik VRE suşları arasında E. faecalis suşlarının sıklıkta olduğu ve vanA geninin vankomisin direncine sebep olan en sık gen olduğu gözlendi. Bu çalışma Taq Man real time PCR assay testinin vankomisin direnç genlerinin gösterilmesinde kullanılabilen, kesin ve hızlı bir test olduğunu göstermektedir. Anahtar kelimeler: VRE, Taq Man real time PCR, vanA, vanB, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium
Authors and Affiliations
Bahman Mirzaei, Taghi Farivar, Puran Juhari, Masume Mehr, Ryhane Babaei
Keywords
Related Articles
- EP ID EP115478
- DOI 10.5799/ahinjs.02.2013.04.0107
- Views 118
- Downloads 0
Batı Kenya’da Su ve İnsan Dışkı Örneklerinde Patojenik Vibrio Suşları
Amaç: Batı Kenya bölgelerinden olan Migori, Sondu-Miriu, Nyando ve Yala’dan alınan su ve dışkı örneklerinden patojenik Vibrio türlerinin araştırılması Yöntemler: Mayıs-Aralık 2013 ile Ağustos –Eylül 2014 aras...
Nozokomiyal patojenlerde artan antimikrobiyal direnç; çok ilaca dirençli, yaygın ilaç dirençli ve tüm ilaçlara dirençli Acinetobacter baumannii
Amaç:Bu çalışmada nozokomiyal enfeksiyonlardan izole edilen Acinetobacter spp. suşlarının antimikrobiyal duyarlılıkları tespit edilerek yıllar içerisindeki direnç değişimlerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Yönteml...
Cost effective purification of intein based syntetic cationic antimicrobial peptide expressed in cold shock expression system using salt inducible E. coli GJ1158
Objective: Synthetic cationic antimicrobial peptide (SC-AMP) is an important and upcoming therapeutic molecule against conventional antibiotics. In this study, an attempt was made to purify the SC-AMP without the enzymat...
Utility of PCR in the Diagnosis of Female Genital Tuberculosis
Genital tuberculosis (GTB) is one of the major causes of infertility among females. Since the infection is asymptomatic in most of the cases, it makes the clinical diagnosis quite difficult. We report a case of a 24 year...
Bioactive metabolite production by Streptomyces albolongus in favourable environment
Objectives: Demand for new antibiotic is rising up due to continuous resistance risk against conventional antibiotic. This attempt was taken to find out a novel antimicrobial metabolite. Methods: Chili field antagonist...