Вариабельность генов CYP4 и CYP6 у тлей Aphis fabae mordvilkoi Börner & Janisch, 1922
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Цель. Оценить вариабельность генов CYP450 4-го и 6-го семейств, извлеченных их данных полногеномного секвенирования тли Aphis fabae mordvilkoi, развивающейся в Беларуси на чубушнике (Philadelphus coronaries L.). Методы. Секвенирование генома тлей провели в Центре секвенирования ДНК Университета штата Юта (г. Солт-Лейк-Сити, США). Последовательности генов CYP4 и CYP6 были извлечены из пула прочтений генома путем последовательной фильтрации выравниваний прочтений по референсным последовательностям генов CYP450 4-го и 6-го семейства, извлеченных из 3 находящихся в открытом доступе геномов тлей (Acyrthosiphon pisum Harris, 1776, Myzus persicae (Sulžer, 1776) и Diuraphis noxia (MordvilkoexKurdjumov, 1913)). Все обнаруженные уникальные варианты сборки оценивали как индивидуальный ген. Результаты. В геноме A. fabae mordvilkoi обнаружен 31 ген CYP4, из которых 24 представляют собой варианты гена CYP4C1. В семействе CYP6 обнаружено 19 генов, 8 из которых представляют собой варианты CYP6A13. Вариабельность нуклеотидных и аминокислотных последовательностей CYP4 и CYP6 у A. fabae mordvilkoi оказалась в равной степени высокой. Заключение. В геноме тли A. fabae mordvilkoi среди генов CYP450 семейства CYP4 преобладают гены CYP4C1, а гены CYP6 представлены преимущественно генами CYP6A13. Остальные гены указанных семейств представлены в геноме A. fabae mordvilkoi единичными копиями.Ключевые слова: тли, цитохромы р450, Aphis fabae, трофическая специализация, копийность генов.
Authors and Affiliations
Н. В. Воронова, М. М. Воробьева, Ю. В. Бондаренко
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618720
- DOI -
- Views 48
- Downloads 0
Biochemical characteristics of checkpea (Cicer arietinum L.) seeds for selection of genotypes of food direction
Aim. The goal of research was to study the features of biochemical composition of the chickpea seed for detection the characteristics which can be used to genotype selection of food direction. Methods. Research met...
Таксономічне положення пігментованих дріжджів, ізольованих з екосистем Антарктики
Мета. Визначити видовий склад і таксономічне положення екстремотолерантних антарктичних дріжджів. Методи. Об’єкти дослідження – дріжджі з ґрунтів і фітоценозів Антарктики, які зберігаються в Колекції екстремофільних мікр...
Genome as a top informational attribute of biological species
Aim. To substantiate a concept of genome as the top informational attribute of biological species based on the modern achievements of biological sciences. Methods. Study and analysis of subject scientific literary source...
Якість зерна у ліній м’якої пшениці з генетичним матеріалом Triticum kiharae
Мета. Triticum kiharae (AtAtGGDD, 2n=42) є цікавим видом для поліпшення сортів м’якої пшениці як джерело високого вмісту білка, клейковини в зерні і стійкості до багатьох захворювань. З метою збагачення генофонду T. aest...
Ртуть-резистентні бактерії у екосистемах Антарктики
Мета. Робота присвячена вивченню стійкості антарктичних мікроорганізмів до іонів ртуті. Методи. В дослідженні було використано стандартні мікробіологічні методи висівання мікроорганізмів із десятикратних розведень суспен...