Вариабельность генов CYP4 и CYP6 у тлей Aphis fabae mordvilkoi Börner & Janisch, 1922
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Цель. Оценить вариабельность генов CYP450 4-го и 6-го семейств, извлеченных их данных полногеномного секвенирования тли Aphis fabae mordvilkoi, развивающейся в Беларуси на чубушнике (Philadelphus coronaries L.). Методы. Секвенирование генома тлей провели в Центре секвенирования ДНК Университета штата Юта (г. Солт-Лейк-Сити, США). Последовательности генов CYP4 и CYP6 были извлечены из пула прочтений генома путем последовательной фильтрации выравниваний прочтений по референсным последовательностям генов CYP450 4-го и 6-го семейства, извлеченных из 3 находящихся в открытом доступе геномов тлей (Acyrthosiphon pisum Harris, 1776, Myzus persicae (Sulžer, 1776) и Diuraphis noxia (MordvilkoexKurdjumov, 1913)). Все обнаруженные уникальные варианты сборки оценивали как индивидуальный ген. Результаты. В геноме A. fabae mordvilkoi обнаружен 31 ген CYP4, из которых 24 представляют собой варианты гена CYP4C1. В семействе CYP6 обнаружено 19 генов, 8 из которых представляют собой варианты CYP6A13. Вариабельность нуклеотидных и аминокислотных последовательностей CYP4 и CYP6 у A. fabae mordvilkoi оказалась в равной степени высокой. Заключение. В геноме тли A. fabae mordvilkoi среди генов CYP450 семейства CYP4 преобладают гены CYP4C1, а гены CYP6 представлены преимущественно генами CYP6A13. Остальные гены указанных семейств представлены в геноме A. fabae mordvilkoi единичными копиями.Ключевые слова: тли, цитохромы р450, Aphis fabae, трофическая специализация, копийность генов.
Authors and Affiliations
Н. В. Воронова, М. М. Воробьева, Ю. В. Бондаренко
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618720
- DOI -
- Views 54
- Downloads 0
Значення інтродукованих представників роду Prunus L. для селекції декоративної вишні
Мета. Потреба пошуку джерел і донорів дефіцитних для селекції східної декоративної вишні (сакури) ознак, а також необхідність впорядкування колекції цієї перспективної для вітчизняного садівництва деревної декоративної к...
Использование ДНК-маркеров для изучения генетического полиморфизма генотипов мягкой пшеницы (Triticum aestivum Desf.) Азербайджана
Цель. Работа посвящена молекулярно-генетической оценке генотипов 110 образцов мягкой пшеницы из различных регионов Азербайджана. Методы. Молекулярно-генетический. Результаты. С применением 8 ISSR маркеров уровень генетич...
Elucidation of the genetic mechanisms contributing to moenomycin resistance in actinobacteria
Aim. Moenomycins are phosphoglycolipid antibiotics produced almost exclusively by representatives of genus Streptomyces. These antibiotics directly inhibit peptidoglycan glycosyltransferases and are extremely active agai...
Визначення стійкості азотфіксувальних мікроорганізмів ґрунту Еквадору до токсичних металів (CrO42–, Ni2+, Cu2+)
Мета. Метою роботи було визначення стійкості азотфіксувальних мікроорганізмів, ізольованих із ризосфери бромелії (Еквадор), до дії токсичних металів. Методи. Мікроорганізми ізолювали на поживному середовищі Ешбі. Отриман...
Genetic markers of moldovan tsigayand karakul sheep
Aim. The study of the genetic structure of the two created Moldovan types of sheep – Tsigay wool-meat-dairy and karakul astrakhan -meat-and-milk types by the frequency of antigens, genotypes, alleles, homozygosity level...