Вивчення взаємодії олігонуклеотидів з Д-маннітолом методом молекулярного докінгу
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2017, Vol 15, Issue 1
Abstract
Мета. Комплекс олігорибонуклеотид з манітолом володіє специфічною противірусною активністю. Він пригнічує гемаглютинуючу та нейрамінідазну активність вірусів грипу та парагрипу, і таким чином блокує входження вірусів у клітину та його реплікацію. Так, в даний час, дослідження взаємодії цього комплексу є важливим завданням. Дослідження. взаємодії олігорибонуклеотидів та олігодезоксинуклеотидів з молекулою Д-манітолу. Методи. Моделювання молекулярної структури олігорибонуклеотидів і олігодезоксинуклеотидів були зроблені за допомогою програмного пакету «HyperChem». Програма AutoDock була використана для виконання молекулярного докінгу. Результати. Були розраховані енергії зв’язування між молекулою Дманітолу з олігорибонуклеотидами та олігодезоксинуклеотидами. Проведено аналіз відстаней між атомами олігонуклеотидів та молекули Д-маннітолу, котрі найбільш ймовірно вступають у взаємодію. Висновки. Результати молекулярного моделювання повинні дати більш детальну інформацію про природу взаємодії олігонуклеотидів з молекулою Д-манітолу.Ключові слова: молекулярний докінг, олігонуклеотиди, Д-маннітол, енергія зв’язування.
Authors and Affiliations
V. Shchodryi, D. Lozhko, Z. Tkachuk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613289
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.15.1.714
- Views 67
- Downloads 0
Генетична трансформація Populus nigra х Populus deltoides (осокір клону Градізька)
Мета. Провести генетичну трансформацію тополі Populus nigra x P. deltoides клон Градізька модельною конструкцією pCB002, що містить селективний ген стійкості до антибіотика канаміцину та маркерний ген β-глюкуронідаз...
Кардіоспецифічна делеція гену beta-катеніну асоційована із порушенням активності сигнальних каскадів залучених до розвитку гіпертрофії міокарду
Мета. Дослідити молекулярні механізми розвитку гіпертрофії за умови кардіоспецифічної гетерозиготної делеції гену β-катеніну. Матеріали і методи. Дослідження проводили із використанням мишей, що мають умовний нокаут гену...
Вміст фенольних сполук у тканинах аїру звичайного (Acorus calamus L.) та живильному середовищі за умов вирощування in vitro
Мета. З метою з’ясування біохімічних особливостей рослин Acorus calamus L. двох генотипів, отриманих із різних популяцій, було проведено аналіз фенольних сполук у тканинах експлантів та в живильному середовищі за ум...
Meiosis analysis in soft winter wheat varieties — carriers of wheat-rye translocations 1BL.1RS and 1AL.1RS
Aim. Investigation of the features of the meiosis flow in winter wheat varieties — carriers wheat-rye translocations 1BL.1RS and 1AL.1RS. Methods. A comparative analysis of the meiosis flow in winter wheat varieties, the...
Yaroslav Borysovych Blyum (to 60th anniversary)