Wpływ wybranych czynników przedanalitycznych na wyniki oznaczeń wirusowego DNA metodą PCR
Journal Title: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia - Year 2012, Vol 64, Issue 2
Abstract
Introduction: Obtaining a reliable laboratory test result depends on many factors, among which preanalytical factors play a significant role. The aim of this study was to determine the effect of temperature, storage time of samples and number of freezing and thawing cycles on the results of tests carried out by PCR. Methods: The study was conducted in a model of cytomegalovirus (DNA) and with four types of clinical material: whole blood, serum, cerebrospinal fluid, urine and archival samples. After contamination with CMV clinical samples were incubated under various conditions for a specified period of time or subjected to cycles of freezing and thawing. The presence of DNA - CMV were determined by nested PCR method. Results: The results revealed that in the case of applied levels of contamination and in model used in the study: 1) CMV DNA in samples of clinical material (blood, serum, cerebrospinal fluid, urine) for testing by PCR remains stable for at least 5 days at room temperature or refrigerated and at least 7 days when frozen, 2) Repeated freezing and thawing clinical specimens has no influence on the result of the presence of viral DNA, 3) Isolated viral DNA is stable in the temperature of the freezer and can be subjected to at least 20 freeze-thaw cycles without affecting the PCR results. Conclusions: Viral DNA in clinical specimens examined in the applied experimental conditions is stable. Określono wpływ temperatury, czasu przechowywania próbek różnych materiałów klinicznych oraz liczby cykli zamrażania i rozmrażania na wyniki oznaczeń przeprowadzonych metodą PCR. Badania przeprowadzono na modelu wirusa cytomegalii (DNA).
Authors and Affiliations
Agnieszka Trzcińska, Anna Laskowska, Irena Brodzka, Joanna Siennicka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP75357
- DOI -
- Views 114
- Downloads 0
Ocena częstości występowania przeciwciał dla werotoksycznych pałeczek Escherichia coli (VTEC) u osób z wybranych grup populacji polskiej Seroprevalence of antibodies against verocytotoxin-producing Escherichia coli (VTEC) in individuals from selected groups of the Polish population
Oceniono częstość występowania przeciwciał dla LPS oraz rekombinowanych białek werotoksycznych pałeczek E. coli u osób z wybranych grup populacji polskiej. Przeprowadzone badania wykazały, że u kilkunastu procent klinicz...
Identyfikacja Francisella tularensis techniką real - time PCR z wykorzystaniem sond hybrydyzujących zaprojektowanych dla fragmentów sekwencji genów fopA i tul4
Badano przydatność zaprojektowanych starterów FopA F/R, Tul4 F/R i sond hybrydyzujących FopA S1/S2, Tul4 S1/S2 dla genów fopA i tul4 do wykrywania F. tularensis. W badaniach, w których użyto 50 szczepów F. tularensis uzy...
Genetyczne podobieństwo opornych na wankomycynę szczepów Enterococcus faecium izolowanych z materiału klinicznego
Badano występowanie genów vanA, vanB, vanD, vanE i vanG metodą PCR u wankomycyno-opornych szczepów Enterococcus faecium izolowanych z materiału klinicznego pochodzącego z wybranych oddziałów Szpitala Dzieciątka Jezus w W...
Zastosowanie metody real-time PCR do wykrywania RNA enterowirusów człowieka
Celem pracy było zaprojektowanie i optymalizacja warunków reakcji w metodzie real-time PCR z wykorzystaniem sondy typu TaqMan do wykrywania enterowirusów człowieka. Użyto starterów oraz sondy komplementarnych dla konserw...
Usefulness of the (GTG)4-PCR for typing of monophasic Salmonella enterica isolates with antigenic shame 1,4,[5],12:i:-* Ocena przydatności metody (GTG)4-PCR do różnicowania jednofazowych szczepów Salmonella enterica o wzorze antygenowym 1,4,[5],12:i:-*
Jednofazowe pałeczki Salmonella enterica o wzorze antygenowym 1,4,[5],12:i:- stanowią narastający problem zdrowia publicznego. Dokładna identyfikacja tych szczepów z zastosowaniem rutynowych testów fenotypowych (badania...