Zastosowanie metody Real-time PCR opartej na wykorzystaniu nukleolitycznych sond typu TaqMan do wykrywania markera wirulencji Bacillus anthracis – genu pag oraz specyficznej sekwencji chromosomalnej rpoB
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2011, Vol 24, Issue 10
Abstract
Przedmiotem pracy było zastosowanie metody Real-time PCR opartej na wykorzystaniu nukleolitycznych sond typuTaqMan do wykrywania markera wirulencji Bacillus anthracis – genu pag oraz specyficznej sekwencji chromosomalnej rpoB. Opracowano również reakcję multiplex Real-time PCR pozwalającą na równoczesną amplifikację i wykrywanie wymienionego genu oraz specyficznej sekwencji chromosomalnej.Badania przeprowadzono z użyciem jednego szczepu szczepionkowego i czterech szczepów terenowych laseczki wąglika. Przy ocenie swoistości testów wykorzystano izolaty różnych gatunków rodzaju Bacillus oraz szczepy sześciu innych gatunków drobnoustrojów. Do badań użyto zestaw do PCR QuantiTect (Qiagen) oraz startery swoiste dla genu pag kodującego białko PA i startery do amplifikacji fragmentu specyficznego dla sekwencji chromosomalnej.Reakcja PCR pozwoliła na wykrycie badanych genów na podstawie obserwacji krzywej amplifikacji. Czułość i liniowość reakcji określono korzystając ze współczynnika regresji. Wykazano wysoki współczynnik regresji wynoszący 0,99 dla wszystkich reakcji.Testy Real-time charakteryzowały się wysoką czułością i specyficznością.
Authors and Affiliations
Sylwia Budniak, Agnieszka Kędrak-Jabłońska, Monika Reksa, Anna Szczawińska, Marek Krupa
Keywords
Related Articles
- EP ID EP54054
- DOI -
- Views 161
- Downloads 0
Zmiany skórne – cenna wskazówka w diagnostyce zespołów otępiennych
Zespoły otępienne są schorzeniami o złożonej etiologii i często podobnym obrazie klinicznym. Powoduje to duże trudności diagnostyczne. Aby sobie z tym poradzić, współczesna medycyna poszukuje metod pozwalających na szybk...
Diagnostyka obrazowa we współczesnej onkologii
Radiologia i diagnostyka obrazowa odgrywają istotną rolę na wszystkich etapach leczenia chorych na nowotwory złośliwe. Właściwe wykorzystanie metod diagnostyki obrazowej nie tylko poprawia wyniki leczenia ale także ma po...
Diabetes and diabetic kidney disease – an increasing epidemiological problem
Skomplikowane przetoki odbytu o etiologii odkryptowej. Operacje oszczędzające zwieracze
Odkryptowa przetoka odbytu jest wskazaniem do leczenia chirurgicznego. Celem operacji jest usunięcie przetoki, zachowanie funkcji zwieraczy odbytu i zapobieganie nawrotowi przetoki i/lub ropnia. Operacje przetok odbytu n...
Przydatność przedoperacyjnego badania endosonograficznego w różnicowaniu przetok odbytu niskich z wysokimi
Introduction. Preoperative determination of the fistula is of great importance in the selection of treatment and the risk of postoperative incontinence. High transsphincteric and intersphincteric fistulas, suprasphincter...