Zastosowanie metody Real-time PCR opartej na wykorzystaniu nukleolitycznych sond typu TaqMan do wykrywania markera wirulencji Bacillus anthracis – genu pag oraz specyficznej sekwencji chromosomalnej rpoB
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2011, Vol 24, Issue 10
Abstract
Przedmiotem pracy było zastosowanie metody Real-time PCR opartej na wykorzystaniu nukleolitycznych sond typuTaqMan do wykrywania markera wirulencji Bacillus anthracis – genu pag oraz specyficznej sekwencji chromosomalnej rpoB. Opracowano również reakcję multiplex Real-time PCR pozwalającą na równoczesną amplifikację i wykrywanie wymienionego genu oraz specyficznej sekwencji chromosomalnej.Badania przeprowadzono z użyciem jednego szczepu szczepionkowego i czterech szczepów terenowych laseczki wąglika. Przy ocenie swoistości testów wykorzystano izolaty różnych gatunków rodzaju Bacillus oraz szczepy sześciu innych gatunków drobnoustrojów. Do badań użyto zestaw do PCR QuantiTect (Qiagen) oraz startery swoiste dla genu pag kodującego białko PA i startery do amplifikacji fragmentu specyficznego dla sekwencji chromosomalnej.Reakcja PCR pozwoliła na wykrycie badanych genów na podstawie obserwacji krzywej amplifikacji. Czułość i liniowość reakcji określono korzystając ze współczynnika regresji. Wykazano wysoki współczynnik regresji wynoszący 0,99 dla wszystkich reakcji.Testy Real-time charakteryzowały się wysoką czułością i specyficznością.
Authors and Affiliations
Sylwia Budniak, Agnieszka Kędrak-Jabłońska, Monika Reksa, Anna Szczawińska, Marek Krupa
Keywords
Related Articles
- EP ID EP54054
- DOI -
- Views 154
- Downloads 0
Występowanie niezgodności słabych antygenów zgodności tkankowej w allogenicznych przeszczepieniach komórek krwiotwórczych od zgodnego w układzie HLA rodzeństwa
Oznaczyliśmy allele jedenastu słabych antygenów zgodności tkankowej (mHAg) i zbadaliśmy występowanie ich immunogennych niezgodności pomiędzy dawcą i biorcą w 35 allogenicznych przeszczepieniach komórek krwiotwórczych od...
Changing face of Candida parapsilosis
Candida parapsilosis is a opportunistic fungal pathogen, which causes the nosocomial infections. Now, it is established well that Candida spp. via contaminated vascular catheters, interacts with host defences as well as...
Physicians specializing in general medicine – factors affecting choice of specialization, problems encountered during specialization and future career plans
Introduction. Information on factors affecting choice of specialization, employment situation, future career plans and problems encountered during specialization by physicians specializing in internal medicine in Poland...
Physicians specializing in endocrinology – characteristics of a group
<b>Introduction.</b> Information about the employment situation, including workload and career satisfaction, as well as general information about the career plans of doctors specializing in en...
Ocena przydatności i ograniczeń przezskórnej biopsji skrawkowej w diagnostyce guzów trzustki – analiza retrospektywna
Wstęp. Zmiany ogniskowe w trzustce możemy różnicować za pomocą metod diagnostyki obrazowej, jak również oceniając materiał tkankowy pobrany śródoperacyjnie, laparoskopowo lub za pomocą nakłucia przezskórnego. Jedną z met...