[Aminoglikozit – Antibiyotik Enzim Etkileşimlerine Yönelik Termodinamik<br /> Çalışmalar]
Journal Title: Türk Biyokimya Dergisi/Turkish Journal of Biochemistry - Year 2006, Vol 31, Issue 2
Abstract
Bu makalede aminoglikozid antibiyotikleri ve bunları değiştirerek bakteriyel patojenlere karşı etkisiz hale getiren enzimlerin oluşturdukları komplekslerin termodinamik özelliklerini tanımlıyoruz. Üç temel katalitik modifikasyon reaksiyonunu temsil eden üç farklı enzimin kullanıldığı bu çalışmalarda, enzim– aminoglikozid komplekslerinin bir takım genel özellikleri ortaya çıkarıldı. Elde edilen veriler ikili enzim-aminoglikozid kompleks formasyonunun entalpik açıdan avantajlı, entropik açıdan ise dezavantajlı olduğunu göstermektedir . Bununla beraber incelenen tüm durumlarda yüksek egzotermik entalpi negativ entropiye baskın çıkarak sonuçta avantajlı bir bağlanma serbest enerjisi (DG) sağlamaktadır. İlaveten, bahsi geçen enzimlerin genel bir seçicilik özelliği olarak, aminoglikozidlerin 2’ ve 6’ pozisyonlarında –NH2 grubu bulunduranlarına, bu pozisyonlarda –OH grubuna sahip olanlara göre daha yüksek bir afinite ile bağlandığı da gözlemlendi. İkili enzim-aminoglikozid ve üçlü enzim-kosubstrat-aminoglikoz kompleks oluşumlarında, birden fazla amino grubunun bağlanma sonucu yükselen pKa değerleri protonasyon reaksiyonunun da tesbit edilmesine yol açtı. Çalışılan tüm sistemlerde, elde edilen intrinsik entalpi rakamları, bazik pH değerlerinde başlıca amino gruplarının protonasyonuna, nötral pH değerlerinde ise ek olarak diğer bir takım fonksiyonel grupların protonasyon/deprotonasyonuna işaret etmektedir.
Authors and Affiliations
Engin Serpersu , Can Özen , Edward Wright
Keywords
Related Articles
- EP ID EP102160
- DOI -
- Views 129
- Downloads 0
(Deneysel Sepsiste Eritrosit Antioksidan Enzim Seviyelerindeki Değişiklikler: Melatoninin Rolü)
Fizyolojik ve patofizyolojik olaylarda gelişen oksidatif hasara karşı organizmalar, glutatyon peroksidaz (GSH-Px), süperoksit dismutaz (SOD) ve katalaz (CAT) gibi antioksidan enzimleri de içeren antioksidan savunma sis...
Dietary Compo pounds As Anti-cancer Agents:<br /> A Preliminary Evaluation of Ion Channels And Membrane<br /> Excitability As Possible Target Mechanisms
Although a variety of natural, dietary compounds have been suggested to have anti-cancer properties, their modes of action are not well understood. In this article, we adopt membrane excitability and associated ion chann...
[Arginase Activity, Ornithine and Urea Levels in Breast Cyst Fluid]
Gross cystic disease of breast is the commonest benign disease of breast effecting 1:20 women in the western world. There are two groups of breast cyst; lined either by metaplastic epithelium (Na/K3). There is clear p...
Diabetes Mellitus ve Oksidatif Stres
Oxidative stress in diabetes mellitus may play an important role in the pathogenesis of early and long term complications of hu human diabetes, like microangiopathy and neuropathy. Protein glycation and glucose autoxid...
Enhanced Production and Extracellular Activity of Commercially Important Amylolytic Enzyme by a Newly Isolated Strain of Bacillus. sp. AS-1
Studies on the optimum conditions for the production of α-amylase were carried out with a newly isolated bacterial strain of bacillus sp.AS-1. The optimum temperature for amylase production was detected as 35°C. α -Amy...