Аналіз клітинної локалізації РН доменa Bcr-Abl з білком USP1 та розробка програми для оцінки їх сайтів фосфорилювання
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Мета. Ця робота присвячена вивченню клітинної локалізації РН домена Bcr-Abl разом із білком USP1 та створенню зручного програмного інструмента для агрегації даних щодо сайтів фосфорилювання білків. Методи. Трансфекція клітин ссавців. Підбір праймерів для ПЛР. Флуорисцентна мікроскопія у широкому полі та STED мікроскопія. Базові підходи у створенні програм на Python. Результати. Виявлена колокалізація між USP1 та PH доменом білка Bcr-Abl. Підібрані праймери до основних доменів білка USP1. Було створено програмний інструмент phospho-aggregate. Отримано зображення внутрішньоклітинної локалізації PH домена Bcr надвисокої роздільної здатності. Висновки. Ядерна локалізація USP1 в клітинах 293T, а також точкові колокалізації USP1 з РН доменом онкобілка Bcr-Abl вказують на сильну асоціацію досліджуваних білків зі специфічними клітинними структурами. Ідентифікація цих клітинних структур може допомогти виявити біологічні функції USP1 за хронічної мієлоїдної лейкемії (ХМЛ). Програма phospho-aggregate може бути використана для спрощення аналізу та порівняння сайтів фосфорилювання білків. Субдифракційні зображення внутрішньоклітинного розподілу PH домена Bcr показують, що він кластеризується в структурах, які нагадують клатринові везикули.Ключові слова: Bcr-Abl, USP1, PH домен, кортактин, клітинна локалізація, сайти фосфорилюванння.
Authors and Affiliations
С. В. Антоненко, Д. С. Гур'янов, І. В. Кравчук, Г. Д. Телегєєв
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618713
- DOI -
- Views 42
- Downloads 0
Характеристика генотипів нуту звичайного за генами стійкості до збудника фузаріозу Fusarium oxysporum f. sp. ciceris
Мета. Молекулярно-генетичний аналіз генотипів нуту звичайного за foc0, foc3, foc4 генами стійкості до збудника фузаріозу Fusarium oxysporum f. sp. ciceris. Методи. Екстрагування та очищення ДНК, спектрофотометрія, поліме...
Маркери гена AHAS1 для скринінгу та ідентифікації генотипів соняшнику гібридного походження
Мета. Проведено скринінг гібридів F1 і F2 соняшнику за мікросателітними маркерами мутантного гена AHAS1, асоційованого зі стійкістю до гербіцидів, що інгібують ацетолактатсинтазу. Методи. За допомогою ампліфікації фрагме...
Вивчення поліморфізму гена MDP0000151428 серед сортів і видів яблуні
Мета. Метою даної роботи було вивчення варіабельності гена MDP0000151428, що відноситься до DREB сімейства, серед сортів різного генетичного походження, що володіють різною стійкістю до холоду. Методи. Аналіз поліморфізм...
Генетична трансформація in planta пшениці озимої (Triticum aestivum L.)
Мета. Оптимізувати спосіб Agrobacterium-опосередкованої трансформації пшениці озимої, підібрати умови та період інокуляції для ефективного перенесення генів у процесі запилення. Методи. Agrobacterium-опосередкована транс...
Comparative cytogenetic analysis of early reproductive losses depending of maternal age
Aim. Human reproduction characterized by a high incidence of aneuploidies. Approximately 99 % of conceptions with anomalies of karyotype terminate of pregnancy loss, mainly during the first 14 weeks of intrauterine...