Аналіз клітинної локалізації РН доменa Bcr-Abl з білком USP1 та розробка програми для оцінки їх сайтів фосфорилювання
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Мета. Ця робота присвячена вивченню клітинної локалізації РН домена Bcr-Abl разом із білком USP1 та створенню зручного програмного інструмента для агрегації даних щодо сайтів фосфорилювання білків. Методи. Трансфекція клітин ссавців. Підбір праймерів для ПЛР. Флуорисцентна мікроскопія у широкому полі та STED мікроскопія. Базові підходи у створенні програм на Python. Результати. Виявлена колокалізація між USP1 та PH доменом білка Bcr-Abl. Підібрані праймери до основних доменів білка USP1. Було створено програмний інструмент phospho-aggregate. Отримано зображення внутрішньоклітинної локалізації PH домена Bcr надвисокої роздільної здатності. Висновки. Ядерна локалізація USP1 в клітинах 293T, а також точкові колокалізації USP1 з РН доменом онкобілка Bcr-Abl вказують на сильну асоціацію досліджуваних білків зі специфічними клітинними структурами. Ідентифікація цих клітинних структур може допомогти виявити біологічні функції USP1 за хронічної мієлоїдної лейкемії (ХМЛ). Програма phospho-aggregate може бути використана для спрощення аналізу та порівняння сайтів фосфорилювання білків. Субдифракційні зображення внутрішньоклітинного розподілу PH домена Bcr показують, що він кластеризується в структурах, які нагадують клатринові везикули.Ключові слова: Bcr-Abl, USP1, PH домен, кортактин, клітинна локалізація, сайти фосфорилюванння.
Authors and Affiliations
С. В. Антоненко, Д. С. Гур'янов, І. В. Кравчук, Г. Д. Телегєєв
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618713
- DOI -
- Views 30
- Downloads 0
Гетерозисні моделі гібридів кукурудзи FAO 150–490 для умов зрошення
Мета. Розробити морфо-фізіологічні та гетерозисні моделі гібридів кукурудзи ФАО 150–490 для умов зрошення. Методи. Використовували загальнонаукові, спеціальні селекційно-генетичні та розрахунково-порівняльні методи...
Increase of oil content as an urgent task for hemp breeding
Aim. An unusually long stay in the shade outside the breeding was such an important economic feature as the content of oil in the hemp seed. Preliminary data attempts to start a study in this direction, under various cir...
Успадкування ознаки гілкування в колекції соняшнику (Helianthus annuus L.)
Мета. Метою наших досліджень було вивчити генетичну різноманітність і встановити успадкування ознаки гілкування в колекції ліній соняшнику Інституту олійних культур НААН. Методи. 47 ліній були використані як матеріал для...
CHANHES OF PARAMETRES OF THE MORPHOGENESIS IN ARABIDOPSIS THALIANA L. UNDER CHRONIC IRRADIATION OF SEEDS AND SEEDLINGS BY LOW DOSES OF IONIZING RADIATION
Aim. Our purpose was to evaluate influence of small doses of ionizing radiation on the growth and development of the model plant A. thaliana L., irradiated at the stage of dry seeds or seedlings. Methods. In our experime...
Hybride necrosis genes in bread wheat varieties (Triticum aestivum L.) of Ukraine
Hybrid necrosis is the gradual premature death of leaves or plants in certain F1-2hybrids of wheat (Triticum aestivum L.), and it is caused by the interaction of two dominant complementary genes Ne1 and Ne2 located...