Вивчення поліморфізму гена MDP0000151428 серед сортів і видів яблуні
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Мета. Метою даної роботи було вивчення варіабельності гена MDP0000151428, що відноситься до DREB сімейства, серед сортів різного генетичного походження, що володіють різною стійкістю до холоду. Методи. Аналіз поліморфізму проводили за допомогою методів ПЛР і секвенування. Результати. Проведено клонування і секвенування гена MDP0000151428 з 18 сортів і видів яблуні з різним рівнем стійкості до холоду. Оцінка варіабельності його первинної структури показала присутність точкових мутацій. Більшість з них були однонуклеотидними замінами, в одному випадку виявлено однонуклеотидну делецію. Ступінь ідентичності послідовностей коливався від 97,5 % до 100 %. Висновки. Оцінка поліморфізму довжини гена MDP0000151428 показала, що він досить консервативний і не несе протяжних інсерций або делецій у 20 сортів і видів яблуні з різним рівнем стійкості до холоду. Аналіз показав, що частота виникнення мутацій у різних сайтах гена MDP0000151428 відрізняється. Найбільш схильні до мутацій нуклеотиди, що знаходяться в 138, 341 і 472 позиціях. Порівняння гіпотетичних амінокислотних послідовностей показало наявність окремих замін. Найчастіше вони зустрічаються в 114 і 158 позиціях.
Authors and Affiliations
О. Ю. Урбанович, П. В. Кузмицкая
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618756
- DOI -
- Views 48
- Downloads 0
CHAPERONES HSP90 AS A STABILIZER OF PLANT GROWTH AND MORPHOGENESIS: A MICROEVOLUTIONARY ASPECT
Aim. Chaperones HSP90 have been considered as a mechanism for buffering and accumulating genetic changes which could be important for developmental networks. An analysis of polymorphic Arabidopsis thaliana seeds was carr...
Вплив тривалості фотоперіоду на формування плодів у сортів сої (Glycine max (L.) Merr.)
Мета. З’ясувати вплив тривалості фотоперіоду на динаміку формування плодів і насіння у сортів сої з різною фотоперіодичною реакцією. Методи. Польовий дослід – вирощування сортів сої Аннушка, Устя, Ятрань та Хаджибей в ум...
Аналіз локусів Glu-1 у зразків малопоширених видів пшениці та їх гібридів
Мета. Визначення алельного складу локусів Glu-1 у зразків малопоширених видів пшениці та їх гібридів із м’якою ярою пшеницею. Методи. ПЛР-аналіз. Результати. У наявних колекційних зразках малопоширених видів пшениці в ос...
Aspects of the study of multi-level mechanisms of human adaptation to the extreme conditions of Antarctica
Aim. Study of mechanisms of adaptation of organism functions, including molecular genetic level, to extreme conditions of professional activity in Antarctica. Methods. Survey of Antarctic winterers with clinical, functio...
ДНК паспортизация сортообразцов и гибридов многолетних злаковых трав
Цель. С целью проведения идентификации сортов растений проведена паспортизация сортов, сортообразцов и гибридов многолетних злаковых трав Alopecurus protensis, Agropyron cristatum, Lolium perenne, Lolium miltiflorum, Fes...