Analysis of cellular localization of РН domain of Bcr-Abl with USP1 protein and development of software for estimation of their phosphorylation sites
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Aim. This work was dedicated to investigation of cellular localization РН domain of Bcr-Abl with USP1 protein and to develop useful tool to aggregate information about protein phosphorylation sites. Methods. Mammalian cell transfection. Primers design. Widefield and STED fluorescent microscopy. Basic software development in Python. Results. Co-localization between USP1 and PH domain of Bcr-Abl has been detected. Primers for main domains of USP1 have been designed. Integration tool phospho-aggregate has been developed. Super-resolution image of intracellular distribution of PH domain of Bcr was obtained. Conclusions. Nuclear localization of USP1 in 293T cells and also point co-localizations of USP1 and РН domain of Bcr-Abl oncoloprotein show strong association of investigated proteins with specific cellular structures. Identification of these cellular structures can help to find out biological functions of of USP1 in CML. Tool phospho-aggregate can be used to simplify analysis and comparison of protein phosphorylation sites. Subdiffraction imaging of intracellular distribution of PH domain of Bcr shows that it clusters in structures that resemble shape of clathrin-coated vesicles.Keywords: Bcr-Abl, USP1, PH domain, cortactin, cellular localization, phosphorylation sites.
Authors and Affiliations
С. В. Антоненко, Д. С. Гур'янов, І. В. Кравчук, Г. Д. Телегєєв
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618714
- DOI -
- Views 45
- Downloads 0
Молекулярно-генетичний аналіз зразків пшениці українського та закордонного походження на наявність генів стійкості до стеблової іржі
Мета. Пошук стійкості генів Sr2 та Sr33 до стеблової іржі у закордонних та вітчизняних сортах пшениці за допомогою молекулярно-генетичних маркерів. Методи. Застосовували ЦТАБ-метод для виділення ДНК; ПЛР зі специфічними...
Polymorphism upstream the coding region of the Ppd-D1 gene in Aegilops tauschii Coss.
Aim. Evaluate time of heading and flowering in Aegilops tauschii Coss. accessions, donor of the bread wheat D genome, that are differentiated by polymorphism at upstream the coding region of the Ppd-D1 gene. Method...
Jacob’s ladder Polemonium caeruleum L. and black salsify Sсorzonera hispanica L. in vitro culture
Aim. Micropropagation of Jacob’s ladder Polemonium caeruleum L. and black salsify Scorzonera hispanica L., obtaining root culture and regenerated plants. Methods. In vitro plant cultivation, medium composition modificati...
Таксономічне положення пігментованих дріжджів, ізольованих з екосистем Антарктики
Мета. Визначити видовий склад і таксономічне положення екстремотолерантних антарктичних дріжджів. Методи. Об’єкти дослідження – дріжджі з ґрунтів і фітоценозів Антарктики, які зберігаються в Колекції екстремофільних мікр...
Effects of genes controlling the plant development rates on the formation of individual productivity of wheat and soybean
Aim. The aim of the work was to study the effects of genes controlling the plant development rates on the speed of transition to generative development and formation of individual productivity of isogenic lines of wheat...