Polymorphism upstream the coding region of the Ppd-D1 gene in Aegilops tauschii Coss.
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 23, Issue
Abstract
Aim. Evaluate time of heading and flowering in Aegilops tauschii Coss. accessions, donor of the bread wheat D genome, that are differentiated by polymorphism at upstream the coding region of the Ppd-D1 gene. Methods. NA extraction, allele-specific PCR, electrophoresis in polyacrylamide gel, two-factor analysis of variance. Results. We have found polymorphism upstream the coding region of Ppd-D1 gene with the help of the allele-specific PCR with primers to the Ppd-D1b allele in the accessions from the collection of Ae. tauschii Fragment 414 bp was detected in the samples: k-78, k-396, k-529, k-531, k-1144, k-1162, k-1235, k-1273, k-1283, fragment 429 bp have been revealed in the samples k-187, k-968, k-2178, and 453 bp – in the samples k-80, k-2358, Tetra tauschii. The results of a three-year field experiment showed a significant effect of the detected polymorphisms on the time of heading and flowering. Conclusions. Among the Ae. tauschii accessions by allele-specific PCR with primers to the Ppd-D1b allele have been tested amplification fragments 414 bp, 429 bp and 453 bp. Allele Ppd-D1a was not found in the collection of Ae. tauschii accessions. Samples of aegilops that are carrier of insertions 24 + 15 bp (for which the fragment 453 bp was detected by allele-specific PCR) – were characterized by earlier heading and flowering time in certain years. Keywords: time of heading and flowering, Ppd-D1 gene, Aegilops tauschiі Coss.
Authors and Affiliations
Г. А. Чеботарь, В. Е. Сечняк, Т. Ю. Юрганова, С. В. Чеботарь
Keywords
Related Articles
- EP ID EP621477
- DOI -
- Views 47
- Downloads 0
Методологічні проблеми біотичної діагностики антропогенної трансформації лісових екосистем за рівнями організації життя
Мета. Ціллю дослідження було виявити і систематизувати методологічні проблеми діагностики антропогенної трансформації лісів за рівнями організації життя. Методи. Теоретичні методи системно-структурного, ретроспективного...
Optimization of ChIP protocol for investigation of canonical Wnt target genes expression in new born heart
Aim. In present work we have focused on chromatinimmunoprecipitation (ChIP) protocol with next qPCR optimization for analysis of canonical Wnt target genes regulation by b‑catenin and plakoglobin in new born heart. Metho...
Аналіз клітинної локалізації РН доменa Bcr-Abl з білком USP1 та розробка програми для оцінки їх сайтів фосфорилювання
Мета. Ця робота присвячена вивченню клітинної локалізації РН домена Bcr-Abl разом із білком USP1 та створенню зручного програмного інструмента для агрегації даних щодо сайтів фосфорилювання білків. Методи. Трансфекція кл...
Вплив температури на личинковій стадії розвитку на тривалість життя Drosophila melanogaster
Мета. Вивчити вплив різної температури стадій розвитку на тривалість розвитку і тривалість життя імаго Drosophila melanogaster. Методи. Статистичну значущість показників визначали за допомогою однофакторного дисперсійног...
Description of genetic polymorphism and cytological stability of Avena sativa L., Avena sterilis L. and their interspecies hybrids
Aim. A study of cytological stability and genetic polymorphism of SSR loci in Avena sativa L., Avena sterilis L. and their interspecies hybrids. Methods. Interspecific hybridization in combination with cytological and mo...