Assessment of structural peculiarities of glaziovianin A interaction with human α-, β and γ-tubulins
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Aim. To determine the features of the ligand-protein interaction of glaziovianin A and human α-, β- and γ-tubulin. Methods. Protein and ligand spatial structure modelling (I-Tasser, Grid), molecular docking (CCDC Gold), molecular dynamics simulation (GROMACS). Results. Using the method of molecular docking in CCDC Gold ligand-protein complexes of glaziovianin A and human α-, β- and γ-tubulin were reconstructed. Studied ligand interactions in GTP/GDP-exchange and colchicine binding sites of different tubulin isotypes. The built ligand-protein complexes were studied using molecular dynamics simulations. Conclusions. Binding of glaziovianin A with human tubulin was confirmed exposing its derivatives as perspective tubulin effectors. The binding energies of ligand-protein interaction confirm higher affinity for β-tubulin molecules, and it was suggested that glazovianin A binding may occur at two alternative sites: GTP/GDP-exchange site and site of colchicine binding. Keywords: tubulin, glaziovianin A, binding, antitumor activity.
Authors and Affiliations
П. А. Карпов, С. І. Співак, О. В. Раєвський, О. Ю. Нипорко, С. П. Ожерєдов, Я. Б. Блюм
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618806
- DOI -
- Views 44
- Downloads 0
Молекулярно-генетична тест-система для діагностики спадкової гіпогамаглобулінемії
Мета. Первинні імунодефіцити – спадкові чи набуті внутрішньоутробно імунодефіцитні стани, які спричинено генетичними порушеннями. Спадкова гіпогамаглобулінемія (СГ) – це один із типів вроджених первинних імунодефіцитів л...
HERITABILITY OF FORTIFIED MILK YIELD OF COWS DEPENDING ON ORIGIN OF GROUPS IN THE STRUCTURE AMONG HERD OF BLACK-AND-WHITE BREED
Aim. The «genetic group» was used as one of the genetic factors and as a result the genetic and mathematical analysis of fat content in cow’s milk and the output of milk fat depending on the origin of genetic groups in t...
Activity of antioxidant enzymes in chloroplasts of transgenic plants of wheat with double-stranded RNA-suppressor of the prolindehydrogenase gene
Aim. To investigate the activity of antioxidant enzymes in chloroplasts of transgenic wheat plants variety Zymoyarka containing a double-stranded RNA-suppressor of the proline dehydrogenase gene. Methods. Spectrophotomet...
Вплив мікрохвиль на прояв ефекту положення гена мозаїчного типу у Drosophila melanogaster Meig.
Мета. Метою дослідження було вивчення впливу мікрохвильового опромінення різної інтенсивності на прояв мозаїчного ефекту положення гена (МЕПГ) у Drosophila melanogaster Meig. Методи. Експерименти проводилися на мутантній...
Якість зерна у ліній м’якої пшениці з генетичним матеріалом Triticum kiharae
Мета. Triticum kiharae (AtAtGGDD, 2n=42) є цікавим видом для поліпшення сортів м’якої пшениці як джерело високого вмісту білка, клейковини в зерні і стійкості до багатьох захворювань. З метою збагачення генофонду T. aest...