Automatyzacja izolacji DNA z materiałów biologicznych
Journal Title: Aparatura Badawcza i Dydaktycza - Year 2015, Vol 20, Issue 2
Abstract
Intensywny rozwój nauk biologicznych, zarówno w dziedzinie medycyny, kryminalistyki, jak i szeroko rozumianych badań związanych z biotechnologią, stworzył potrzebę doskonalenia technik analitycznych. Na szczególną uwagę zasługują metody biologii molekularnej bazujące na analizie kwasów nukleinowych, charakteryzujące się wysoką czułością i powtarzalnością. Pozwalają one na precyzyjną identyfikację śladów biologicznych, ocenę zmian w profilach ekspresji genów, a także pełną ewaluację bioróżnorodności nisz środowiskowych. Kluczowym elementem determinującym efektywność przeprowadzanych analiz jest etap pozyskiwania (izolacji) materiału genetycznego. Wyraźnie dostrzega się tendencje rozwoju technologii w kierunku zwiększenia przepustowości oraz dokładności izolacji DNA. Aktualnie możliwe jest pokonanie ograniczeń związanych z metodą manualnej izolacji poprzez zastosowanie gotowych zestawów oraz robotów automatycznych umożliwiających pracę z wieloma setkami prób jednocześnie. Celem badań było przeprowadzenie walidacji wybranych metod izolacji genomowego DNA. Wykorzystano trzy komercyjne zestawy. Dwa z nich, dedykowane platformie automatycznej BioRobot M48 Robotic Workstation (Qiagen), bazowały na zjawisku immobilizacji DNA na złożach z cząstkami paramagnetycznymi: QIAsymphony DNA Investigator Kit (Qiagen) oraz MagAttract® DNA Mini M48 (Qiagen). Trzeci zestaw, Sherlock AX (A&A Biotechnology), przeznaczony był do manualnej izolacji genomowego DNA i wykorzystywał mechanizm adsorbcji kwasów nukleinowych na membranach jonowymiennych połączonej ze strącaniem DNA izopropanolem. Ocenie poddano wykrywalność, powtarzalność, i odtwarzalność. Wyniki wskazują, że wszystkie analizowane metody pozwalają na izolację materiału genetycznego o wysokich standardach, który może być wykorzystany w dalszych procedurach badań molekularnych.
Authors and Affiliations
Justyna Staninska, Zuzanna Szczepaniak, Agnieszka Piotrowska-Cyplik, Paweł Cyplik, Jakub Czarny
Keywords
Related Articles
- EP ID EP199208
- DOI -
- Views 81
- Downloads 0
Wpływ rodzaju aktywatora paliwa na skład chemiczny spalin emitowanych przez samochodowe silniki spalinowe
W niniejszej pracy przedstawiono doświadczalne wyniki analizy spalin silników benzynowych o zasilaniu gaźnikowym Renault 19 Chamade 1.4 i wtryskowym Volkswagen Polo 6N 1.4 eksploatowanych w układach: bez aktywatora paliw...
Wpływ parametrów technologicznych na proces epoksydacji eteru diallilowego 30-proc. nadtlenkiem wodoru na katalizatorze tytanowo-silikatowym Ti-MWW
W pracy przedstawiono wyniki badań nad wpływem parametrów technologicznych na proces epoksydacji eteru diallilowego (EDA) na katalizatorze tytanowo-silikatowym Ti-MWW, w obecności 30-proc.nadtlenku wodoru oraz w metanolu...
Współrzędnościowa technika pomiarowa w kontroli dokładności wytwarzania powierzchni swobodnych
W pracy pokazano na konkretnych przykładach, w jaki sposób wybór strategii obróbki wykańczającej może wpływać na jakość i dokładność wytwarzanych powierzchni swobodnych. Powierzchniom tym w technice stawiane są liczne wy...
Analiza numeryczna odkształceń i naprężeń w procesie wyciskania materiału perforowanego
Zaprezentowano analizę odkształceń powstających w procesie numerycznego wyciskania na zimno przy użyciu programu Deform 3D perforowanych materiałów ze stopu aluminium. Do analizy przyjęto model materiału sztywno-plastycz...
Estimation of Soil Fertility from Organic Plantations Strawberries and Raspberries in the South-Eastern Poland
Studies conducted in the years 2014-2015 were designed to evaluate of soil fertility from 22 organic farms specializing in the cultivation of strawberries and raspberries from the south-eastern Poland. Evaluated soil sam...