The effect of DNA isolation methods on genetic similarity of winter wheat (Triticum aestivum L.) lines using RA PD-PCR techniques
Journal Title: Aparatura Badawcza i Dydaktycza - Year 2015, Vol 20, Issue 2
Abstract
The aim of this study was to compare the effect of 4 DNA isolation methods on the results of analyses using molecular markers of Random Amplified Polymorphic DNA – Polymerase Chain Reaction (RAPDPCR) in winter wheat lines. DNA was isolated using the method proposed by Thomson and Henry, the column method with a Quiagen DNeasy Plant Kit, a Genomic Mini AX Plant Kit by A&A Biotechnology and the Maxwell® 16 LEV Plant DNA Kit by Promega. After isolation RAPD–PCR analyses were carried out. The molecular study was an evaluation indicator of the DNA isolation methods. The best isolation method was that using the Quiagen DNeasy Plant Kit. Isolation using this kit provided the best DNA quality and the greatest legibility of electropherograms. However, it is the most time- and cost-intensive method of DNA isolation, which limits its applicability at a large number of tested genotypes. In terms of electrophoretic image quality good DNA isolation was provided by the method using a Genomic Mini AX Plant Kit. A rapid and cheap method was that proposed by Thomson and Henry; unfortunately, it was less efficient than the former ones. The greatest variation in the amounts of obtained DNA was observed for isolation using the Maxwell kit.
Authors and Affiliations
Agnieszka Tomkowiak, Danuta Kurasiak-Popowska, Dorota Weigt, Sylwia Mikołajczyk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP199192
- DOI -
- Views 118
- Downloads 0
Wpływ metod izolacji DNA na podobieństwo genetyczne linii pszenicy ozimej (Triticum aestivum L.) przy zastosowaniu techniki RA PD-PCR
Celem badań było porównanie wpływu 4 metod izolacji DNA na wynik analizy markerami molekularnymi RAPD-PCR (ang. Random Amplified Polymorphic DNA – Polymerase Chain Reaction) linii pszenicy ozimej. Przeprowadzono izolację...
Cechy okrywy włosowej lisów polarnych a podatność jej na spilśnianie się
Laboratoryjnie ustalono skład okrywy, wysokość i długość włosów oraz ich wzajemny stosunek dla czterech typów anatomicznych oraz stosunek wysokości i długości obu warstw okrywy. Lanametrem zmierzono grubość włosów i ich...
Analiza pieśni godowych oraz odgłosów wydawanych przez cietrzewie (Tetrao tetrix Linnaeus, 1758) na podstawie zarejestrowanego czasu trwania oraz sonogramu dźwięków.
W pracy dokonano analizy głosów wydawanych w okresie godowym przez cietrzewie (Tetrao tetrix L, 1758) w hodowli wolierowej. Analiza obejmowała chronometraż fraz pieśni oraz ich graficzny zapis w postaci wykresów i sonogr...
Pomiary toru i prędkości zjazdu w basenowych zjeżdżalniach wodnych
Artykuł skrótowo przedstawia sposób pomiaru toru i prędkości zjazdu basenową zjeżdżalnią wodną. Badania te zostały wykonane w celu kalibracji i walidacji numerycznego modelu ruchu, wykorzystywanego do oceny bezpieczeństw...
WPŁYW TEMPERATURY I CZASU WĘDZENIA NA WYBRANE CECHY JAKOŚCIOWE SZYNKI WIEJSKIEJ
Celem przeprowadzonych badań była ocena wpływu temperatury i czasu wędzenia na wybrane cechy jakościowe szynki wiejskiej. Materiałem doświadczalnym była wędzonka parzona - szynka wiejska wyprodukowana w zakładzie przemys...