Expression profiling of kinesins, involved in the development of autophagy in Arabidopsis thaliana, and the role of tubulin acetylation in the interaction of Atg8 protein with microtubules
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Aim. To investigate the interrelation between changes in the expression levels of kinesin genes that are potentially involved in the development of stress-induced autophagy in Arabidopsis thaliana by means of microtubules, and the structural biology analysis of the role of α-tubulin acetylation in the regulation of interaction of α-tubulin with Atg8. Methods. The simulation of the influence of abiotic stresses. PCR analysis of changes in expression levels of kinesin genes. The molecular dynamics simulations of α-tubulin and Atg8 complexes were performed using the GROMACS 4.5.5 program. Results. It was shown that the changes in expression levels were caused by the influence of stressful stimuli. A significant increase in the transcriptional activity of the KIN5B, KIN12B, KIN12F genes after UV-B irradiation, the KIN6, KIN7O, KIN7D, KIN12B genes under osmotic-, and KIN6, KIN12B under salt stress was detected. By means of bioinformatics it was demonstrated that α-tubulin acetylation provides an enhanced interaction of α-tubulin and Atg8 protein. Conclusions. Obtained data point out the important role of kinesins and α-tubulin acetylation in realization of microtubules’ partaking in the development of stress-induced autophagy in plants. Keywords: microtubules, α-tubulin, kinesins, Atg8 protein, stress-induced autophagy.
Authors and Affiliations
В. Д. Оленева, Д. И. Литвин, А. И. Емец, Я. Б. Блюм
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618741
- DOI -
- Views 32
- Downloads 0
Восстановление целостности ДНК клеточными репаративными системами
В обзоре рассмотрены четыре из шести основных репаративных систем клетки. Некоторые из них были изучены нобелевскими лауреатами 2015 года в области химии. Общее название их работы – «За исследование механизмов репарации...
Генетические маркеры молдавских цигайских и каракульских овец
Цель. Изучение генетической структуры двух созданных молдавских типов овец – цигайских шерстно-мясо-молочного и каракульских смушково-мясо-молочного типов по частоте встречаемости антигенов, генотипов, аллелей, уровню го...
PECULIARITIES OF MORPHOLOGY AND STRESS-RESISTANCE OF PLANTS STEVIA REBAUDIANA (ВERT.) BERTONI DEPENDENT ON FORMS AND GROWING CONDITIONS
Aim. Study of leaf surface morphology microstructure peculiarities of plants Stevia rebaudiana, character of waterholding capacity dependent on growing conditions (open soil and in vitro) and influence on adaptation abil...
Методологічні проблеми біотичної діагностики антропогенної трансформації лісових екосистем за рівнями організації життя
Мета. Ціллю дослідження було виявити і систематизувати методологічні проблеми діагностики антропогенної трансформації лісів за рівнями організації життя. Методи. Теоретичні методи системно-структурного, ретроспективного...
Molecular genetic test system for diagnosis of x-linked agammaglobulinemia
Aim. Primary immunodeficiencies are disorders in which immune system is missing or does not function normally due to genetic disorders. X-linked agammaglobulinemia (XLA) is a rare genetic disorder in which don’t generate...