Genotypowanie M. kansasii metodą TRS-PCR
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2011, Vol 24, Issue 10
Abstract
Wstęp. W ostatnich latach obserwowany jest wzrost zachorowań wywoływanych przez prątki należące do grupy NTM, w tym Mycobacterium kansasii. Z tego względu ważne jest znalezienie odpowiedniej metody, która pozwoli na analizę epidemiologiczną zakażeń.Materiał i metody. W badaniach wykorzystano kolekcję 48 szczepów M. kansasii, którą wstępnie zanalizowano pod kątem różnorodności profili PRA-hsp65, a następnie wygenerowano profile prążkowe za pomocą testu TRS-PCR oraz wykonano analizę jego powtarzalności.Wyniki i wnioski. 39 z 48 szczepów na podstawie profilu PRA-hsp65 zostało zaklasyfikowanych jako M. kansasii typ I, najczęściej izolowanego od ludzi. Testy CGG-PCR i CCG-PCR dla kolekcji szczepów M. kansasii okazały się najlepsze, gdyż zróżnicowały je w największym stopniu, co potwierdzają wysokie wartości współczynnika różnicowania, zaś ich powtarzalność była na zbliżonym poziomie. Test TRS-PCR pozwolił na potwierdzenie wyniku analizy PRA-hsp65 w przypadku trzech szczepów, które według profilu PRA-hsp65 zostały zaklasyfikowane jako M. fortuitum typu I. Szczepy te grupowały się oddzielnie od szczepów M. kansasii we wszystkich analizach TRS-PCR. Otrzymane przez nas wyniki mogą świadczyć o możliwości zastosowania metody TRS-PCR w dochodzeniach epidemiologicznych dla M. kansasii, w przypadku gdy zostanie ona uzupełniona dodatkową metodą różnicowania.
Authors and Affiliations
Anna Kubiak, Arkadiusz Wojtasik, Ewa Augustynowicz-Kopeć, Zofia Zwolska, Paweł Parniewski
Keywords
Related Articles
- EP ID EP54051
- DOI -
- Views 151
- Downloads 0
Usefulness and limitations of core biopsy in pancreatic tumors diagnostics – retrospective analysis
Introduction. Pancreatic lesions may be diagnosed with imaging techniques and invasive procedures (evaluating tissue material obtained intraoperatively, by laparoscopy or percutaneous biopsy). One of the methods to take...
Embolizacja tętnic macicznych w leczeniu objawowych mięśniaków macicy
Wstęp. Mięśniaki są najczęściej występującymi łagodnymi guzami macicy. W ramach leczenia stosuje się zarówno metody zachowawcze, chirurgiczne, jak i minimalnie inwazyjne. Kluczowym elementem przy embolizacji jest odpowie...
Trucizny – definicja, rodzaje, mechanizm działania
Zgodnie z obowiązującą współcześnie definicją, trucizna jest to substancja, egzogenna lub endogenna, która powoduje zaburzenie funkcji organizmu lub jego śmierć. Pojęcie trucizny często stosujemy wymiennie z pojęciem kse...
Elderly patients: when and how to perform dialysis?
The elderly constitute the most rapidly expanding category of dialysis patients, with specific problems, mainly caused by a high burden of comorbidities and frailty. Dialysis treatment should be implemented in this popul...
Suplementacja witaminy D u ludzi dorosłych – wytyczne
Witamina D jest niezbędna do utrzymania prawidłowej gospodarki wapniowo-fosforanowej w organizmie (działanie klasyczne) oraz do zapewnienia prawidłowego funkcjonowania wielu tkanek, narządów, komórek niezwiązanych z gosp...