Molecular organization of 5S rDNA in two ukrainian populations of sycamore (Acer pseudoplatanus)
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2016, Vol 14, Issue 2
Abstract
Aim. The genetic variability of tree species has still not been studied enough at the molecular level. Considering the relatively low rate of molecular evolution in perennial tree species, it is necessary to use only those regions of genome, which demonstrate a high level of variability, such as 5S rDNA. Accordingly, to estimate the potential of 5S rDNA as a molecular marker for tree species, the organization of this genomic region was compared between samples from two geographically remote Ukrainian populations of sycamore, Acer pseudoplatanus. Methods. PCR amplification, cloning and sequencing of the 5S rDNA IGS of A.pseudoplatanus. Results. It was shown that only one variant of 5S rDNA repeat with a length of 475 bp is present in the genome of A. pseudoplatanus. Also, it was found that the elements typical for the angiosperm RNA polymerase III promoter, which are localized in IGS, appear to be different from those previously described for species of other families. The level of IGS sequence similarity within the populations exceeds 99%, while the level of IGS sequence similarity between various populations is only 93,3-94,3%. Conclusions. High rate of molecular evolution of the 5S rDNA IGS makes them a convenient molecular marker for evaluation of intraspecific variation in populations of A. pseudoplatanus.Key words: 5S rDNA, molecular markers, intraspecific variability, Acer
Authors and Affiliations
O. O. Rusak, V. I. Petrashchuk, I. I. Panchuk, R. A. Volkov
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613746
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.14.2.691
- Views 68
- Downloads 0
Важливість сигнальної функції β-катеніну на початкових стадіях розвитку патологічної гіпертрофії дорослого серця
Поширення серцево-судинних захворювань, їхня загроза здоров’ю та вагоме соціально-економічне навантаження обумовлюють і значний інтерес науковців до вирішення цієї проблеми. Останнім часом актуальними стають не лише досл...
Наталія Володимирівна Солодюк (8.02.1938 –17.11.2014)
Відділ генетики клітинних популяцій Інституту молекулярної біології і генетики НАН України: історія та головні наукові здобутки (до 30-річчя від часу заснування)
У статті коротко розглянуто основні віхи історії Відділу генетики клітинних популяцій, створеного у 1988 р. в Інституті молекулярної біології і генетики постановою Президії АН УРСР. Саме у цьому Відділі та його попередни...
Stability and plasticity of wheat soft winter genotypes in the forest-steppe ecotope
Aim. The aim of the work was to study the reactions of genotypes (сultivars and promising lines) of winter bread wheat to the cultivation in the central Forest-Steppe conditions in terms of ecological plasticity, genetic...
Результаты селекционной работы с вишней и дюками на Мелитопольской опытной станции садоводства имени М. Ф. Сидоренко ИС НААН
Цель: создать сорта, обладающие устойчивостью к неблагоприятным экологическим факторам, самоплодные, устойчивые к коккомикозу и монилиозу, с высоким качеством плодов, универсального назначения, со сдержанной силой роста....