Molecular typing and investigation of carbapenemases in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii isolates (Karbapenemlere dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında moleküler tiplendirme ve karbapenemazların araştırılması)
Journal Title: Turk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi - Year 2016, Vol 73, Issue 4
Abstract
Objective: In this study, it was aimed to investigate the presence of carbapenemases in carbapenem-resistant A. baumannii strains and their chromosomal or plasmid origin. Methods: Of the total 65 A. baumannii studied, 66% were isolated from patients in intensive care unit (ICU); most of strains were blood (37%) and lower respiratory tract samples (32%). VITEK2 automated system and disk diffusion tests were used to evaluate antibiotic susceptibilities. In addition, MIC values for carbapenems were determined using M.I.C. evaluator strips. Clonal relationship between the isolates was assessed by AP-PCR, using M13 and DAF4 primers. Carbapenemase genes were screened by multiplex- PCR, and presence of plasmid-borne carbapenemase was investigated. Results: The The isolates were found to be susceptible to tobramycin, netilmicin, and colistin by 98.5%, 98.5% and 96.9%, respectively. The rates of resistance to other antibiotics were quite high, and resistance was found between 78.5% - 100%. The resistance rates were detected as 100% to ticarcillin, piperacillin, piperacillin+tazobactam, ceftazidime, ceftriaxone, sefepime, imipenem, meropenem, and ciprofloxacin, 98.5% to ticarcillin+clavulanic acid, gentamicin, levofloxacin, tetracycline, doxycycline, and trimethoprim-sulfamethoxazole, 93.8% to minocycline, 92.3% to amikacin, and 78.5% to ampicillin+sulbactam. In the study, two different patterns were observed by AP-PCR. Chromosomal OXA-23 and OXA-51 carbapenemase enzyme genes positively were found in all isolates. Plasmids were isolated neither of isolates. Conclusion: Isolates were detected more frequently from hemocultures in ICU. Isolates showed clonal similarity in AP-PCR where M13 and DAF4 primers were used. The presence of the single Acinetobacter clone in our hospital suggests that they all originated from the same source. For this reason, it is concluded that universal infection control measures should be taken in consideration to prevent cross-infection by carbapenem resistant isolates. Amaç: Bu çalışmada karbapenem dirençli A. baumannii’lerde karbapenemazların varlığı ve bunların kromozomal veya plazmid kaynaklı olduğunun araştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Çalışılan 65 A. baumannii’nin %66’sı yoğun bakım ünitesi (YBÜ)’ndeki hastalardan, en çok kandan (%37) ve alt solunum yolu örneklerinden (%32) izole edilmiştir. Antibiyotik duyarlılıklarını değerlendirmede VITEK 2 otomatize sistemi ve disk difüzyon testi kullanılmıştır. Ayrıca, karbapenemler için MİK değerleri, MİK değerlendirici stripler kullanılarak belirlenmiştir. İzolatlar arasındaki klonal ilişki M13 ve DAF4 primerleri kullanılarak AP-PZR ile değerlendirilmiştir. Karbapenemaz genleri multipleks- PZR ile taranmış ve plazmit kaynaklı karbapenemaz araştırılmıştır. Bulgular: İzolatlar tobramisin, netilmisin ve kolistine sırasıyla %98.5, %98.5 ve %96.9 oranında duyarlı bulunmuştur. Diğer antibiyotiklere direnç oranları oldukça yüksek olup %78.5-100.0 arasında saptanmıştır. Tikarsilin, piperasilin, piperasilin+tazobaktam, seftazidim, seftriakson, sefepim, imipenem, meropenem ve siprofloksasin için %100.0; tikarsilin+klavulanik asit, gentamisin, levofloksasin, tetrasiklin, doksisiklin ve trimethoprim+sulfametoksazol için %98.5; minosiklin için %93.8; amikasin için %92.3 ve ampisilin+sulbaktam için %78.5 oranında direnç saptanmıştır. AP-PZR ile araştırmada iki farklı patern gözlenmiştir. Bütün izolatlarda kromozomal kaynaklı OXA-23 ve OXA- 51 karbapenemaz enzim geni pozitif bulunmuştur. İzolatların hiçbirinde plazmit izole edilmemiştir. Sonuç: İzolatlar en sık YBÜ’de yatmakta olan hastaların kan örneklerinde saptanmıştır. İzolatlar M13 ve DAF4 primerlerin kullanıldığı AP-PZR’de klonal benzerlik göstermiştir. Hastanemizde tek Acinetobacter kolonu bulunması, hepsinin aynı kaynaktan köken aldığını düşündürmektedir. Bu nedenle karbapeneme dirençli izolatların çapraz enfeksiyonlarını önlemek için evrensel enfeksiyon kontrol önlemlerine dikkat etmek gerektiği sonucuna varılmıştır.
Authors and Affiliations
Nilgün ÖZBEY, Müşerref TATMAN-OTKUN
Keywords
Related Articles
- EP ID EP490797
- DOI 10.5505/TurkHijyen.2016.91489
- Views 133
- Downloads 0
Manisa ili hepatit A seronegatifliği ve sosyal belirleyicilerle ilişkisi, 2014 (Hepatitis A seronegativity and its relationship with social determinants in Manisa province, 2014)
Amaç: Bu araştırmada 2014 yılında Manisa ilinde iki yaş üstü nüfusta hepatit A seronegatifliğinin sosyal belirleyicilerle ilişkisinin incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Araştırmanın bağımlı değişkeni, hepatit A seronegat...
Yara örneklerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyallere duyarlılıkları (Microorganisms which isolated from wound samples and their antimicrobial susceptibilities)
Amaç: Yara enfeksiyonları, morbidite ve mortalitesi yüksek önemli bir sağlık problemi olmaya devam etmektedir. Ekonomik kayıpları ve artan antimikrobiyal direnç gelişimini engellemek amacıyla, bu enfeksiyonların erken ta...
Antibiyotik kullanımı ve obezite arasındaki köprü: Mikrobiyota mı? (The bridge between antibiotic use and obesity: Is it a microbiota?)
ÖZET Hemostazın sağlanması ve hastalıkların gelişmesinde belirgin etkisi olan bağırsak mikrobiyotası insan gastrointestinal sisteminde yaşayan kompleks ve dinamik bir mikroorganizma topluluğundan oluşmaktadır. Bağırsak b...
Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde hastane enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen candida suşlarının dağılımı (2010-2015) (Distribution of candida species isolated from nosocomial infections of Ankara Numune Training and Research Hospital (2010-2015))
Amaç: Son yıllarda nozokomiyal Candida enfeksiyonlarının epidemiyolojisinde ve tedavisinde kullanılan antifungallerle ilgili önemli değişiklikler ortaya çıkmıştır. Nozokomiyal Candida enfeksiyonlarının en sık etkeni Cand...
Üniversite öğrencilerinin gıda okuryazarlığı ve gıda güvenliği konusunda bilgi, tutum ve davranışları “Amasya Üniversitesi Sabuncuoğlu Şerefeddin Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu örneği” (University students food literacy and food safety knowledge, attitudes and behaviors “Example of Amasya University Sabuncuoğlu Şerefeddin Health Services Vocational School”)
Amaç: Gıda güvenliğini bilmek ve gıda okuryazarlığı; sağlıklı gıdaya ulaşma konusundaki yeteneğimizi ifade etmektedir. Beslenme ve gıda alışkanlıkları insan sağlığını etkileyen en temel faktörlerdendir. Tüketicilerin güv...