Mutacje w genie pncA jako główny mechanizm oporności na pirazynamid wśród prątków gruźlicy
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2015, Vol 28, Issue 4
Abstract
Wstęp. Postęp w oznaczaniu oporności na PZA dokonał się wraz z poznaniem genomu prątka oraz określeniem molekularnych mechanizmów oporności na lek, jakimi są mutacje w genie pncA. Gen pncA jest odpowiedzialny za prawidłową syntezę pirazynamidazy (PZaza) przekształcającej lek w jego aktywną formę. Mutacje w genie pncA występują na całej jego długości (561pz) oraz w regionie promotorowym. Mają one różnorodny charakter, najczęściej typu missense (skutkujące substytucją aminokwasu), ponadto insercje, delecje oraz mutacje typu nonsense.Cel pracy. Celem pracy była identyfikacja mutacji w genie pncA występujących wśród prątków gruźlicy opornych na pirazynamid.Materiał i metody. Analizie poddano 195 szczepów M. tuberculosis opornych na pirazynamid, które zostały wyizolowanie od polskich chorych w latach 2000-2011. Mutacje wykrywano, analizując sekwencje genu pncA i jego regionu promotorowego (700pz) w porównaniu z sekwencją „dzikiego” genu pncA szczepu M. tuberculosis H37Rv.Wyniki. Analiza sekwencyjna genu pncA oraz regionu promotorowego wykazała, że 174 (89,2%) szczepy oporne na PZA posiadały mutacje w genie odpowiedzialnym za oporność na ten lek. Wykryto 57 różnych mutacji, które rozmieszczone były wzdłuż całego genu, ponad 60% szczepów wykazywało mutacje w części 3’ genu, między kodonem 86 a 187. W pracy zidentyfikowano 25 nowych mutacji, które do tej pory nie zostały zarejestrowane w bazie TB Drug Resistance Mutation Database.Wnioski. Identyfikacja mutacji w genie pncA daje możliwość uzyskania w krótkim czasie informacji o PZA-oporności, co skutkuje szybkim włączeniem prawidłowego leczenia chorego na gruźlicę. Przedstawiona w pracy analiza może być podstawą do opracowania wiarygodnych i szybkich testów molekularnych do wykrywania PZA-oporności.
Authors and Affiliations
Agnieszka Napiórkowska, Zofia Zwolska, Ewa Augustynowicz-Kopeć
Keywords
Related Articles
- EP ID EP55025
- DOI -
- Views 189
- Downloads 0
Genetically determined and acquired factors predisponing to osteoarthritis or osteoporosis
A common characteristic for both osteoarthritis (OA) and osteoporosis (OP) is a gradual age-dependent increase in clinical manifestation, particularly acceleration of those processes in women after menopause and a positi...
Coexistence of obesity and sleep-disordered breathing in patients with suspected sleep apnea syndrome polysomnography referred by physicians of different specialties
Sleep-disordered breathing (SBD), particularly in the form of obstructive sleep apnea (OSAS), is highly prevalent in the general population. Obesity is a major risk factor for OSAS. BMI is the most frequently used obesit...
Different methods of the gastrointestinal tract reconstruction after pancreaticoduodenectomy – is this procedure optimal?
Pancreaticoduodenectomy is one of the most complexed surgical procedures. It is also extremely challenging for the surgeon who performs it. Due to the decreasing mortality rate and the reduction of the postoperative comp...
Cross-contamination in routine diagnostic in the mycobacteriology laboratories – risk factors, detection and prevention
Introduction. Identification of Mycobacterium tuberculosis complex in clinical material from the patient is the basis of microbiological confirmation of TB, and remains gold standard for diagnosis. The results of numerou...