نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته همزمان بر داده‌های ریزآرایه
Journal Title: مجله علمی- پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی قم - Year 2019, Vol 13, Issue 6
Abstract
زمینه و هدف: در سال‌های اخیر، فن‌آوری‌های جدید منجر به تولید حجم انبوهی از داده‌ها شده و در حوزه زیستی، فناوری ریزآرایه نیز به‌صورت چشمگیری توسعه یافته است. در این میان، جهت مقایسه گروه کنترل با دو یا چند گروه آزمایشی، همچنین یافتن ژن‌هایی با بیان متفاوت، از آزمون فیشر استفاده می‌شود. در این مطالعه نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته همزمان بر داده‌های ریزآرایه بررسی گردید. روش بررسی: در این مطالعه، ابتدا با شبیه‌سازی و انتخاب سه حالت مختلف برای نمونه‌های کنترل و آزمایشی، نرخ کشف کاذب با استفاده از دو روش آزمون جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته محاسبه گردید، سپس این دو روش بر روی 8799 ژن مربوط به سلول مغز 29 موش (در سه گروه سنی جوان، میانسال و پیر) اعمال گردید و تأثیر فرآیند سن مغز بر افزایش ایجاد بیماری آلزایمر مورد بررسی قرار گرفت. یافته‌ها: نتایج نشان داد استفاده از روش آزمون جایگشتی فیشر، نرخ کشف کاذب را نمی‌تواند کنترل کند، ولی روش جایگشتی تعدیل‌یافته بهتر عمل کرده و اختلافات واقعی معنی‌دار را درست‌تر تشخیص می‌دهد؛ لذا مقدار FP در روش دوم کاهش خواهد یافت. نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، استفاده از روش‌های مرسوم ازجمله آزمون جایگشتی فیشر که مبنای تحلیل داده‌های زیستی در بسیاری از نرم‌افزارها می‌باشد، در داده‌های بزرگ مقیاس، ازجمله داده‌های ریزآرایه کارایی مطلوب را ندارد و نرخ کشف کاذب را نمی‌تواند کنترل کند؛ درحالی‌که روش جایگشتی تعدیل‌یافته با عملکرد بهتر در کنترل نرخ کشف کاذب، نتایج قابل‌اعتمادتری در پی دارد.
Authors and Affiliations
Mohsen Salehi, Issac Almasi
Keywords
Related Articles
- EP ID EP634123
- DOI 10.29252/qums.13.6.47
- Views 26
- Downloads 0
Comparison of Alphapinene and Donpezil Effects on Passive Avoidance Memory in Adult Male Rats
Background and Objectives: Alphapinene as one of the most important Components of essential oils, which has antioxidant and anti-cholinesterase activities. Oxidative stress directly affects the function of the brain and...
بررسی همبستگی بین توانمندی روان‌شناختی و فرسودگی شغلی با نقش واسطه‌ای استرس ادراک‌شده در پرستاران
زمینه و هدف: یکی از عوامل تنش‌زا در انسان، محیط کاری است. درصورت عدم برخورداری از مهارت‌های لازم، افراد ممکن است درگیر فرسودگی شغلی شوند. هدف از پژوهش حاضر تعیین همبستگی بین توانمندی روان‌شناختی و فرسودگی شغلی با نقش واس...
The Effect of 4 Weeks of Flaxseed Extract Supplementation on Serum Concentration of Brain-Derived Neurotrophic Factor and C-Reactive Protein
Background and Objective: Omega-3 Supplementation has different effects on the body. Terefore, this study was carried out with the aim of investigating the effect of 4 weeks of flaxseed extract supplementation on serum c...
فعالیت ضدباکتریایی بذر گیاه رومکس کیپریوس بر اشرشیاکلی و استافیلوکوکوس اورئوس
زمینه و هدف: عفونت‌های سویه‌های اشرشیاکلی و استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم، در بیشتر موارد منشأ بیمارستانی دارند و شیوع آنها در سراسر جهان در حال افزایش است. از این‌رو تلاش‌های بسیاری جهت یافتن ترکیبات فعال گیاهی جدید برای ج...
Investigation of Antibiotic Resistance in Bacteria Isolated from the Contents and Shell of Industrial Eggs in Qom City, Iran
Background and Objectives: Egg directly affects family nutrition health. The main contaminants of this product is presence of pathogenic bacteria. The purpose of this study was to evaluate the antibiotic resistance of Sa...