Nucleotide sequences of tRNA-methonine genes of Streptomyces globisporus 1912-2, identified in silico
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2016, Vol 14, Issue 1
Abstract
Aim of this work was to identify nucleotide sequences of tRNAMet of S. globisporus 1912-2. Methods. Resources of server NCBI (programs BLAST: blast, discontiguous megablast and databases: “Genome”, “Nucleotide”) were used for in silico analysis of library of S. grlobisporus 1912-2 contigs. Results. Nucleotide sequences of 4 genes of tRNAMet of S. globisporus 1912-2 were determined in silico. Molecules of tRNA of the II type were translated from tRNAMet gene (Contig № 21 (936–1008 bp)) and the molecules of tRNAfMet genes (Contigs № 299 (1713–1787 bp), № 255 (5941–6015 bp)). Conclusions. 4 genes of transfer RNAs-methionine were identified in silico in S. globisporus 1912-2 genome. Two genes from them coded tRNAfMet molecules. The nucleotide sequences of all tRNAMet genes were identified.Keywords: gene, tRNA, methionine, nucleotide sequence, Streptomyces.
Authors and Affiliations
L. V. Polishchuk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613449
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.14.1.545
- Views 76
- Downloads 0
Academician of NAAS Boris V. Dzyubetsky (to the 80th anniversary)
Висвітлено основні віхи життєвого шляху і найголовніші наукові здобутки та досягнення у селекційній і науково-педагогічній роботі члена Українського товариства генетиків і селекціонерів ім. М. І. Вавилова Бориса Володими...
Кластерний аналіз в селекції гречки
Мета. Використовуючи кластерний аналіз, скоротити тривалість селекційного процесу у гречки шляхом групування гібридних комбінацій у кластерні класи за схожістю оцінок морфологічних, урожайних і технологічних параметрів....
Анализ экспрессии изоформ ITSN2 и TKS5 в опухолях грудной железы человека
Цель. Несмотря на большой прогресс в лечении 15 % случаев рака молочной железы остаются летальными. Несмотря на многолетние исследования и большой опыт в лечении этого вида рака, одной из основных проблем в диагностике и...
Dynamics of activity of energy supply enzymes of rat brain against the background of exposure to stress factors
Aim. The aim of this work was to give a review of own studies of dynamics of the activity of energy metabolism enzymes in the brain during postnatal ontogenesis which characterizes the functional relations within the ana...
Поліморфізм у короткому плечі 1R хромосоми жита в лініях пшениці, що мають 1RS.1BL транслокацію та 1R(1В) заміщення з різних джерел
Мета. Коротке плече хромосоми жита (Secale cereale L.) 1R широко застосовується у селекції м’якої пшениці (Triticum aestivum L.), зокрема 1RS.1BL транслокація, для інтрогресії генів стійкості до листової (Lr26), стеблово...