Оптимізація методу ChIP для дослідження регуляції генів-мішеней канонічного ВНТ сигналінгу у новонародженому серці
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Мета. Метою нашої роботи було оптимізувати метод хроматинімунопреципітації (ChIP) з наступною валідацією із застосуванням ПЛР у реальному часі для аналізу функції b-катеніну та плакоглобіну у регуляції експресії генів-мішеней канонічного ВНТ сигналінгу у новонародженому серці. Методи. Дослідження проводили із використанням тканини новонароджених сердець мишей віком 3 доби після народження (P3). Аналізували як тканину серця контрольних мишей, так і мишей із делецією одного алеля гена β-катеніну. Методику ChIP проводили, ґрунтуючись на стандартних протоколах із власними модифікаціями, викладеними у статті. Валідацію результатів ChIP проводили із застосуванням методу ПЛР у реальному часі. Результати. У результаті проведеної роботи нами було адаптовано метод ChIP для вивчення сигнальної функції β-катеніну та плакоглобіну й аналізу специфічних ділянок геному, з якими зв’язуються досліджувані нами білки у новонародженому міокарді. Висновки. Було показано, що за умови гетерозиготного нокауту гена β‑катеніну плакоглобін здатний компенсувати його сигнальну функцію та зв’язуватись із тими ж фрагментами геному, що й β-катенін. Ключові слова: β-катенін, плакоглобін, Wnt-сигналінг, експресія генів, міокард, хроматинімунопреципітація, ChIP.
Authors and Affiliations
О. О. Півень
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618744
- DOI -
- Views 36
- Downloads 0
Вплив трофічних, осмотично активних та гелеутворювальних компонентів живильного середовища на прямий ембріоїдогенез у культурі пиляків in vitro ярого ячменю
Мета. Ембріоїдогенез, або соматичний ембріогенез, є найбільш ефективним шляхом регенерації рослин у культурі in vitro клітин, тканин та органів. Мета досліджень полягала у визначенні впливу на частоту прямого ембріоїдоге...
Assessment of structural peculiarities of glaziovianin A interaction with human α-, β and γ-tubulins
Aim. To determine the features of the ligand-protein interaction of glaziovianin A and human α-, β- and γ-tubulin. Methods. Protein and ligand spatial structure modelling (I-Tasser, Grid), molecular docking (CCDC Gold),...
GENOTOXIC INFLUENCE OF FLUORINE DRINKING WATER
Aim. Fluoride is widely distributed in nature and contains in minerals, ores, soils, atmosphere, natural waters, plant and animal organisms. One measure of the quality of drinking water is its content of fluorine. Gettin...
Academician Andriy Opanasovich Sapegin (to birthday 135 anniversary)
The main biographical data on the life and creative path of Academician AO Sapevin – an outstanding scientist, talented teacher and organizer of science, the pioneer of the leading areas of genetics and selection.Keyword...
Вивчення генетичних механізмів стійкості до моеноміцину в актинобактерій
Мета. Дослідити генетичні механізми стійкості до моеноміцину А (МмА) в актинобактерій. Методи. Використано мікробіологічні та молекулярно-генетичні підходи, та модельні штами Streptomyces coelicolor M145 й S. albus...