Porównanie wyników identyfikacji wankomycyno-opornych enterokoków metodą MALDI-TOF MS, Vitek 2 i API 20 STREP
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2015, Vol 28, Issue 4
Abstract
Wstęp. Z klinicznego punktu widzenia, w zakażeniach wywoływanych przez rodzaj Enterococcus, najważniejsze jest różnicowanie gatunków: E. faecium i E. faecalis (odpowiedzialne za ponad 90% wszystkich zakażeń) oraz E. gallinarum, E. casseliflavus i E. flavescens, ze względu na ich naturalną oporność na niskie stężenia wankomycyny (fenotyp VanC). W trakcie badań nad szczepami enterokoków opornych na wankomycynę (VRE) zaobserwowano, że niektóre enterokoki izolowane z materiałów klinicznych od hospitalizowanych chorych były identyfikowane przez systemy oparte na biochemicznej identyfikacji: Vitek 2 i API 20 Strep (bioMereiux, Francja) jako E. gallinarum, podczas gdy inne metody identyfikowały te szczepy jako E. faecium oporne na wankomycynę.Cel. Celem pracy było porównanie systemu Vitek® 2, API 20 STREP oraz MALDI-TOF MS w identyfikacji gatunkowej enterokoków.Materiały i metody. 100 szczepów drobnoustrojów z rodzaju Enterococcus, poddano identyfikacji do poziomu gatunku w systemach opartych o rozkład cech biochemicznych (systemy Vitek® 2 i API 20 STREP) oraz o spektrometrię masową (MALDI-TOF). Metodami referencyjnymi były metody genetyczne wykrywające geny ddl i fragmentu genu vanC.Wyniki. Różnice w identyfikacji enterokoków wynosiły od 2% w systemie VITEK®2 do 6% dla ATBTM Expression względem MALDI – Biotyper oraz metod molekularnych.Wnioski. Wysoki koszt oraz czasochłonność metoda molekularnych, wyklucza je z zastosowania w rutynowej diagnostyce laboratoryjnej. Natomiast zgodność wyników identyfikacji gatunkowej w spektrometrii masowej MALDI-TOF z metodami genetycznymi, skłania do jej wykorzystania w rutynowej diagnostyce mikrobiologicznej.
Authors and Affiliations
Łukasz Chabros, Robert T. Kuthan, Anna Sawicka-Grzelak, Grażyna Młynarczyk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP55038
- DOI -
- Views 162
- Downloads 0
Breast cancer – where are we standing in 2011?
Breast cancer is one of the major health and social problems in women. Due to the wide application of screening programs and to improvements in treatment, breast cancer mortality in some countries has decreased by more t...
Ocena zależności między stężeniem adiponektyny i składowymi zespołu metabolicznego u dzieci i młodzieży z otyłością prostą
Wstęp. Adiponektyna jest białkiem tkanki tłuszczowej pełniącym wiele funkcji i odgrywającym istotną rolę w patogenezie zespołu metabolicznego u dzieci.Cel pracy. Ocena zależności między stężeniem adiponektyny i zespołem...
Treatment of visceral and renal aneurysms with endovascular methods
<b>Introduction. </b>Visceral and renal arteryaneurysmseven though they are rarevascular pathology (frequency of appearing of visceral aneurysms 0.1-2%, renal 0.01-0.09% of the human populatio...
SM u osób starszych (SM o późnym początku)
Mianem stwardnienia rozsianego o późnym początku określa się te przypadki choroby, które rozpoczynają się w wieku powyżej 50 roku życia. Z tego typu rozpoznaniem mamy do czynienia w 4-9,6% przypadków. SM o późnym początk...
Assessment of dietary habits and dietary intake in underweight children
<b>Introduction. </b>Proper nutrition is one of the determinants of health. Diet disturbances, both lower or higher intake of nutrients, may lead to health impairment. Children and adolescents...