Porównanie wyników identyfikacji wankomycyno-opornych enterokoków metodą MALDI-TOF MS, Vitek 2 i API 20 STREP
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2015, Vol 28, Issue 4
Abstract
Wstęp. Z klinicznego punktu widzenia, w zakażeniach wywoływanych przez rodzaj Enterococcus, najważniejsze jest różnicowanie gatunków: E. faecium i E. faecalis (odpowiedzialne za ponad 90% wszystkich zakażeń) oraz E. gallinarum, E. casseliflavus i E. flavescens, ze względu na ich naturalną oporność na niskie stężenia wankomycyny (fenotyp VanC). W trakcie badań nad szczepami enterokoków opornych na wankomycynę (VRE) zaobserwowano, że niektóre enterokoki izolowane z materiałów klinicznych od hospitalizowanych chorych były identyfikowane przez systemy oparte na biochemicznej identyfikacji: Vitek 2 i API 20 Strep (bioMereiux, Francja) jako E. gallinarum, podczas gdy inne metody identyfikowały te szczepy jako E. faecium oporne na wankomycynę.Cel. Celem pracy było porównanie systemu Vitek® 2, API 20 STREP oraz MALDI-TOF MS w identyfikacji gatunkowej enterokoków.Materiały i metody. 100 szczepów drobnoustrojów z rodzaju Enterococcus, poddano identyfikacji do poziomu gatunku w systemach opartych o rozkład cech biochemicznych (systemy Vitek® 2 i API 20 STREP) oraz o spektrometrię masową (MALDI-TOF). Metodami referencyjnymi były metody genetyczne wykrywające geny ddl i fragmentu genu vanC.Wyniki. Różnice w identyfikacji enterokoków wynosiły od 2% w systemie VITEK®2 do 6% dla ATBTM Expression względem MALDI – Biotyper oraz metod molekularnych.Wnioski. Wysoki koszt oraz czasochłonność metoda molekularnych, wyklucza je z zastosowania w rutynowej diagnostyce laboratoryjnej. Natomiast zgodność wyników identyfikacji gatunkowej w spektrometrii masowej MALDI-TOF z metodami genetycznymi, skłania do jej wykorzystania w rutynowej diagnostyce mikrobiologicznej.
Authors and Affiliations
Łukasz Chabros, Robert T. Kuthan, Anna Sawicka-Grzelak, Grażyna Młynarczyk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP55038
- DOI -
- Views 174
- Downloads 0
HCV antigens expression and inflammatory activity in patients with chronic HCV infection
Chronic type C hepatitis remains a substantial burden to global health problems. It is estimated, that only up to 30% of infected persons effectively eliminate the virus. In the remaining 70-80% chronic infection develop...
Treatment of type 1 diabetes mellitus in female patient with Graves’ orbitopathy, receiving intravenous systemic corticotherapy
In this article we presented a patient woman with type 2 autoimmune polyglandular syndrome (APS2) – type 1 diabetes mellitus, vitiligo and Graves disease. In the curse of Graves disease she had hyperthyroid...
Osteoporosis from a traumatologist’s point of view
According to contemporary definition osteoporosis is a condition characterized by reduced quality of bone tissue and resulting increase of fracture risk. Low-energy fractures are common in the population of patients over...
Nonalcoholic fatty liver disease in patients with morbid obesity
<b>Introduction. </b>Accumulation of fat in obese individuals can impact hepatocytes and contributes to the inflammatory process, which in extreme cases results in fibrosis, cirrhosis, and fai...
Powikłania zakrzepowo-zatorowe u pacjentów z ostrymi białaczkami i chłoniakami – doświadczenia własne
<b>Wstęp.</b> Powikłania zakrzepowo-zatorowe stanowią częste zaburzenia u pacjentów z chorobami nowotworowymi zwłaszcza w przebiegu guzów litych. Ich etiologia ma charakter złożony i wieloczyn...