REP-PCR analisis of single agent of cucumber bacterial diseases
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2017, Vol 15, Issue 1
Abstract
Aim. For the purpose of correct species identification and estimation of population’s heterogeneity, the fingerprinting of the genome of isolated by us Pectobacterium sp., collection «Erwinia toxica» strains and typical representatives of certain species of Pectobacterium and Diskeya genera has been carried out. Methods. In the course of research, microbiological, molecular genetic (REP-PCR), mathematical-statistical methods of research were used. Results. On the basic of BOX, REP and ERIC profiles the significant affinity between isolated Pectobacterium sp. and collections «Erwinia toxica» strains with the typical P. carotovorum susp. carotovorum UCM B1075T has been established. Genetic heterogeneity of isolated Pectobacterium sp. and collections «Erwinia toxica» strains has been estimated. Conclusions. It has been found the significant relationship between isolates Pectobacterium sp. and the collection «Erwinia toxica» strains with the typical strain P. carotovorum susp carotovorum UCM B1075T on the basic of their BOX, REP and ERIC profiles. Most likely, this indicates that they belong to this species. The genetic homogeneity of isolated Pectobacterium sp. strains of and the genetic heterogeneity of the collection «Erwinia toxica» strains is probably due to the plant’s selection from similar or different region.Keywords: identification, genetic heterogeneity, REPPCR, «Erwinia toxica», Pectobacterium sp.
Authors and Affiliations
L. A. Dankevych
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613277
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.15.1.708
- Views 61
- Downloads 0
Антифунгальна та рістрегулююча дія нових металоорганічних сполук
Мета даної роботи полягала у дослідженні нових хелатних комплексів платини, паладію та міді з різними органічними лігандами щодо антифунгальної дії по відношенню до фітопатогенних грибів роду Fusarium та визначенні харак...
Self-incompatibility allele identification in Ukrainian sweet cherry (Prunus avium L.) cultivars
Aim. Ukrainian breeders have created a large number of sweet cherry cultivars, which still remain almost unexplored at the molecular level. The aim of our study was to identify the self-incompatibility alleles (S-alleles...
ПЛР-аналіз генів фотоперіодичної чутливості у сортів м’якої озимої пшениці селекції Білоцерківської дослідно-селекційної станції
Мета. Визначення алельного стану генів чутливості до фотоперіоду Ppd-1 у 16 сортів м’якої озимої пшениці селекції Білоцерківської дослідно-селекційної станції і детекція гаплотипів за геном Ppd-D1, згідно з прийнятою кла...
Роль саліцилатного та жасмонатного сигнальних шляхів у індукованій ліпополісахаридами стійкості рослин арабідопсису до фітопатогенного штаму Pseudomonas aeruginosa IMB 9096
Мета. Дослідити вплив ліпополісахаридів, одержаних з сапрофітних штамів Pseudomonas aeruginosa, на стійкість до патогенного штамму P. aeruginosa IMB 9096 рослин Arabidopsis thaliana дикого типу (Сol-0), мутанта npr1, що...
Молекулярно-генетический анализ полиморфных локусов c.454–397T/C И c.454–351А/G гена рецептора эстрогена ESR1 у семейных пар с идиопатическим бесплодием
Цель: установить ассоциацию полиморфных локусов 397 T>C и 351 A>G гена ESR1 у супружеских пар с неудачными ЭКО. Методы. Выделение и очистку ДНК проводили методом высаливания. Амплификацию последовательностей ДНК in...