Review of genome sampling methods in sequencing libraries preparation protocols
Journal Title: Agronomy Science - Year 2018, Vol 73, Issue 4
Abstract
Since the publication of the full sequence of the Arabidopsis thaliana genome in 2000 [AGI Initiative 2000], a period of dynamic genome exploration began. In the last decade, with the revolution in the next generation sequencing, the number of scientific reports based on sequence analysis has increased exponentially. New, fast, high throughput and relatively inexpensive nucleic acid sequencing technologies have become available and widespread, opening up the possibility of making extensive use of molecular tools in science and breeding practice. These new methods include whole genome sequencing and various methods of reduced representation sequencing. The multitude of available methods, varying in terms of availability and costs, generating different types of result data, dedicated to different research and application purposes, may make it difficult to choose the best variant [Poland et al. 2012]. The aim of this paper is to familiarize the reader with the possibilities and application of selected genotyping techniques with the use of sequencing.
Authors and Affiliations
MARTA PUCHTA, PAULINA BOLC, URSZULA PIECHOTA
Keywords
Related Articles
- EP ID EP454194
- DOI 10.24326/asx.2018.4.9
- Views 66
- Downloads 0
Charakterystyka pomologiczna niemieckich odmian czereśni w kolekcji Instytutu Ogrodnictwa w Skierniewicach
W latach 2015–2017 prowadzono obserwacje pomologiczne na 21 odmianach czereśni hodowli niemieckiej zgromadzonych w kolekcji ex situ Instytutu Ogrodnictwa w Skierniewicach. Odmiany oceniano za pomocą deskryptora ‘Sweet ch...
Analiza przestrzennego podobieństwa plonowania odmian pszenicy ozimej na obszarze województwa śląskiego i opolskiego
Na podstawie wyników plonowania odmian uzyskanych w doświadczeniach w ramach Porejestrowego Doświadczalnictwa Odmianowego i Rolniczego (PDOiR) z pszenicą ozimą z terenu województw opolskiego i śląskiego przeprowadzono an...
Ocena zawartości materii organicznej w glebie torfowo-murszowej w warunkach zróżnicowanego użytkowania runi łąkowej
Celem pracy była analiza zawartości materii organicznej w glebie torfowo- -murszowej w warunkach zróżnicowanego użytkowania runi łąkowej. Badania przeprowadzono w latach 2006–2010 w Stacji Dydaktyczno-Badawczej w Sosnowi...
The role of collection missions in gathering plant genetic resources material
In the last 40 years, the National Center for Plant Genetic Resources (KCRZG) in Radzików has organized 67 collecting missions across the country. The main task was to secure the still existing plant genetic richness in...
Wpływ międzyplonów ścierniskowych oraz sposobu uprawy roli na jakość ziarna pszenicy jarej w krótkotrwałej monokulturze
Badania przeprowadzono w latach 2011–2013 w GD Czesławice (woj. lubelskie) na glebie lessowej. Statyczne, dwuczynnikowe doświadczenie z monokulturą pszenicy jarej założono metodą split-plot w 5 powtórzeniach na poletkach...