Struktura chromosomu bakteryjnego – metody analizy oddziaływań białko-DNA in vivo
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2017, Vol 71, Issue
Abstract
Badania prowadzone w ostatnich latach ujawniły, że chromosom bakteryjny wykazuje hierarchiczną organizację. Liczne białka wiążące DNA kondensują chromosom lokalnie oraz zapewniają jego odpowiednie upakowanie w skali globalnej. Połączenie zaawansowanych technik biologii molekularnej oraz wysokoprzepustowych metod sekwencjonowania DNA pozwala na precyzyjną analizę struktury chromosomu bakteryjnego w skali lokalnej i globalnej. Przykładowo in vivo footprinting oraz ChIP-seq umożliwiają wyznaczenie miejsc wiązania analizowanych białek zarówno w określonym miejscu jak wzdłuż całego chromosomu. Natomiast techniki 3C pozwalają na analizę oddziaływań przestrzennych w skali globalnej. Wgląd w złożone struktury tworzone przez białka odpowiedzialne za organizację chromosomu bakteryjnego zapewniają techniki wysokorozdzielczej mikroskopii fluorescencyjnej.
Authors and Affiliations
Joanna Hołówka, Małgorzata Płachetka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP242335
- DOI 10.5604/01.3001.0010.6696
- Views 135
- Downloads 0
Wpływ płynów konserwujących UW I EC na ekspresję genów metaloproteinazy II i tkankowego inhibitora metaloproteinazy II
Metaloproteinazy macierzy oraz tkankowe inhibitory metaloproteinaz odgrywają istotną rolę w regulacji proliferacji komórek mezangium i mogą brać udział w procesie uszkodzenia niedokrwienno-reperfuzyjnego. Płyny konserwuj...
The role of chemerin in human disease
Adipose tissue is not merely a storage depot of triacylglycerols but also a major endocrine organ. Its cells, including adipocytes, synthesize and secrete a range of biologically active molecules termed adipokines. Adipo...
Białka osłony komórkowej pałeczek jelitowych i ich udział w patogenności oraz odporności przeciwbakteryjnej
W pracy opisano niektóre zagadnienia dotyczące chorobotwórczości i wirulencji wybranych przedstawicieli bakterii z rodziny [i]Enterobacteriaceae.[/i] Na podstawie przedstawionej budowy osłony komórkowej tych bakterii omó...
Vitamin D and functions of adipocytes
The presence of vitamin D receptors in β-cells, in the cells of intestine, skeletal system, lungs, lymphocytes, monocytes and adipocytes indicates its multidirectional activity. Vitamin D has the ability to modify the pr...
The influence of reactive oxygen species on the central nervous system
Oxidative stress can be defined as a rise of oxidative potential or decrease of antioxidant status. Oxidative stress is caused by reactive oxygen species (ROS) which are produced by one-electron reduction of oxygen in...