Struktura chromosomu bakteryjnego – metody analizy oddziaływań białko-DNA in vivo
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2017, Vol 71, Issue
Abstract
Badania prowadzone w ostatnich latach ujawniły, że chromosom bakteryjny wykazuje hierarchiczną organizację. Liczne białka wiążące DNA kondensują chromosom lokalnie oraz zapewniają jego odpowiednie upakowanie w skali globalnej. Połączenie zaawansowanych technik biologii molekularnej oraz wysokoprzepustowych metod sekwencjonowania DNA pozwala na precyzyjną analizę struktury chromosomu bakteryjnego w skali lokalnej i globalnej. Przykładowo in vivo footprinting oraz ChIP-seq umożliwiają wyznaczenie miejsc wiązania analizowanych białek zarówno w określonym miejscu jak wzdłuż całego chromosomu. Natomiast techniki 3C pozwalają na analizę oddziaływań przestrzennych w skali globalnej. Wgląd w złożone struktury tworzone przez białka odpowiedzialne za organizację chromosomu bakteryjnego zapewniają techniki wysokorozdzielczej mikroskopii fluorescencyjnej.
Authors and Affiliations
Joanna Hołówka, Małgorzata Płachetka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP242335
- DOI 10.5604/01.3001.0010.6696
- Views 145
- Downloads 0
Theta rhythm recorded in the hippocampal formation in vitro
Theta rhythm is the best synchronized EEG activity that can be recorded in the mammalian brain.Hippocampal formation (HPC) is considered to be the main structure involved in the generationof this activity. Numerous data...
Activity of N-acetyl-β-hexosaminidase and its isoenzymes A and B in cancer
There were approximately 93,060 deaths from cancers in Poland in 2008, and about 105,000 are predicted for the year 2025. Early detection of cancer is a major problem throughout the world, which is why many researchers a...
Adenosine, its analogues and conjugates
Adenosine is an endogenous purine nucleoside that plays an important role in many biochemical processes. It acts through the four types of adenosine receptors: A1, A2A, A2B, A3 which are located i.a. in the immune, nervo...
Pentraksyny – znaczenie w patogenezie tocznia rumieniowatego układowego
Toczeń rumieniowaty układowy (TRU) jest chorobą autoimmunologiczną, w której podstawowy mechanizm patogenetyczny to zaburzenia przebiegu apoptozy oraz upośledzenie czynności komórek immunologicznych, prowadzące do kumula...
Is TCF7L2 variant associated with non-diabetic chronic kidney disease progression? Results of a family-based study
Introduction: It is assumed that genetic factors may play a significant role in CKD development. The aim of the study was to investigate the role of rs7903146 polymorphism in the TCF7L2 gene in development and progressio...