Struktura chromosomu bakteryjnego – metody analizy oddziaływań białko-DNA in vivo
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2017, Vol 71, Issue
Abstract
Badania prowadzone w ostatnich latach ujawniły, że chromosom bakteryjny wykazuje hierarchiczną organizację. Liczne białka wiążące DNA kondensują chromosom lokalnie oraz zapewniają jego odpowiednie upakowanie w skali globalnej. Połączenie zaawansowanych technik biologii molekularnej oraz wysokoprzepustowych metod sekwencjonowania DNA pozwala na precyzyjną analizę struktury chromosomu bakteryjnego w skali lokalnej i globalnej. Przykładowo in vivo footprinting oraz ChIP-seq umożliwiają wyznaczenie miejsc wiązania analizowanych białek zarówno w określonym miejscu jak wzdłuż całego chromosomu. Natomiast techniki 3C pozwalają na analizę oddziaływań przestrzennych w skali globalnej. Wgląd w złożone struktury tworzone przez białka odpowiedzialne za organizację chromosomu bakteryjnego zapewniają techniki wysokorozdzielczej mikroskopii fluorescencyjnej.
Authors and Affiliations
Joanna Hołówka, Małgorzata Płachetka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP242335
- DOI 10.5604/01.3001.0010.6696
- Views 164
- Downloads 0
BNIP3 jako nietypowy przedstawiciel rodziny Bcl-2. Część 2: Regulacja ekspresji i aktywności BNIP3 oraz jego rola w chorobie nowotworowej*
BNIP3 należy do rodziny białek Bcl-2, których funkcją jest regulacja programowanej śmierci komórki. Jest to jedyne znane białko proapoptotyczne ulegające ekspresji w czasie hipoksji, co jest uwarunkowane obecnością w pro...
Leczenie zakażeń Helicobacter pylori w świetle nasilającej się antybiotykooporności
W artykule omówiono zagrożenia związane z występowaniem zakażeń pałeczkami Helicobacter pylori (H. pylori) u ludzi oraz problemy jakie przynosi eradykacja drobnoustroju z zastosowaniem antybiotykoterapii. Zamieszczono pr...
The maintenance of genetic stability of embryonic and induced pluripotent stem cells during anticancer therapies
Regenerative medicine is a very rapidly developing discipline. Its progress contributes to elongated life expectancy and improved quality of life of patients suffering from so far incurable diseases. Stem cells (SCs) are...
Rola diety w stwardnieniu rozsianym
Stwardnienie rozsiane jest demielinizacyjną chorobą ośrodkowego układu nerwowego, występującą najczęściej między 20 a 40 rokiem życia. Nadal nie jest poznana etiologia tej choroby, a jednym z rozpatrywanych czynników śro...
Immune checkpoint‑targeted cancer immunotherapies
Tumor cells may express on their surface various characteristic antigens that can induce antitumor immunity. However, cancer in human body may induce an immunosuppressive microenvironment that limits immune response to i...