Testowanie różnych warunków PCR dla analiz DNA rzepaku ozimego za pomocą dwóch dominujących markerów SCAR specyficznych dla mutacji w genie BnaA.FAD2
Journal Title: Rośliny Oleiste - Oilseed Crops - Year 2016, Vol 37, Issue 1
Abstract
Dzięki zastosowaniu mutagenezy uzyskano dwa mutanty rzepaku ozimego (Brassica napus L. var oleifera) o wysokiej zawartości kwasu oleinowego (HOR3–M10453 i HOR4–M10464). Dla tych mutantów opisano i opatentowano dwa dominujące markery SCAR (ang. sequence-characterized amplified regions) specyficzne dla punktowych mutacji w obrębie genu desaturazy BnaA.FAD2. Aby poprawić specyficzność tych markerów niezbędne były badania nad stężeniem jonów Mg2+ oraz temperaturą przyłączania starterów (Ta) podczas PCR. W tym celu przy użyciu obu markerów testowano 24 linie rzepaku ozimego, wśród których znajdowały się zarówno formy zmutowane, jak i typu dzikiego. Na żelach agarozowych obserwowano produkty PCR specyficzne dla linii zmutowanych (produkt o wielkości 428 pz dla markera H3Dom oraz produkt o wielkości 506 pz dla markera H4Dom). Gdy zastosowano mniej restrykcyjne warunki reakcji, na żelach pojawiały się także dodatkowe prążki. Mimo to na podstawie uzyskanych wyników można było wybrać optymalne parametry reakcji. Dla markera H3Dom te parametry to: 1,25 mM Mg2+ i Ta = 60C, natomiast dla markera H4Dom optymalne parametry to: 1,25 mM Mg2+ i Ta = 65C.
Authors and Affiliations
Marcin Matuszczak, Stanisław Spasibionek, Irena Tokarczuk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP192717
- DOI -
- Views 73
- Downloads 0
Effect of dietary level and the period of feeding soybean and linseed oil in mixtures on rearing results, slaughter value and meat quality characteristics of broiler chickens
The feeding experiment has been carried out on three groups of ROSS 308 broiler chickens (K, D-1, D-2), 40 birds in each group (4 replicates of 10 birds). Starter mixtures were fed to the chickens for the first 3 weeks,...
Influence of extrusion parameters of oil expeller prototype on the oil temperature obtained from seeds of Camelina sativa L. [i][/i]
[i]Camelina sativa[/i] is an oil plant with fine seeds. Even though the fat content is not as high as in other oil plants cultivated in Poland, since it reaches 28–41%, it is an alternative to other oilseeds taking into...
Charakterystyka orzechów laskowych trzech odmian leszczyny uprawianej w Polsce
Celem pracy była charakterystyka fizykochemiczna oraz ocena stabilności oksydatywnej tłuszczu orzechów laskowych trzech odmian leszczyny uprawianej w Polsce: Kataloński, Webba Cenny i Cosford. W orzechach oznaczono zawar...
Importance of autumnal application of nitrogen and stabilized nitrogen fertilizers in winter rapeseed nutrition (Brassica napus L. convar. f. napus biennis)
In the years 2009/10 and 2010/11 we established small-plot experiments with stabilized nitrogen fertilizers Alzon (nitrification inhibitor) and UREAstabil (urease inhibitor) on the linear variety Californium of rapeseed...
Phenotypic changes in poppy plants (Papaver somniferum L.) after flowering and accumulation of morphine in poppy capsules. II. The study on accumulation of morphine in poppy capsules between the end of flowering and maturity
Due to the current law about preventing drug addiction, the Department of Genetics and Breeding of Oilseed Crops IHAR-PIB in Poznan undertook a study whose main objective was to determine the dynamic of morphine accumula...