Testowanie różnych warunków PCR dla analiz DNA rzepaku ozimego za pomocą dwóch dominujących markerów SCAR specyficznych dla mutacji w genie BnaA.FAD2
Journal Title: Rośliny Oleiste - Oilseed Crops - Year 2016, Vol 37, Issue 1
Abstract
Dzięki zastosowaniu mutagenezy uzyskano dwa mutanty rzepaku ozimego (Brassica napus L. var oleifera) o wysokiej zawartości kwasu oleinowego (HOR3–M10453 i HOR4–M10464). Dla tych mutantów opisano i opatentowano dwa dominujące markery SCAR (ang. sequence-characterized amplified regions) specyficzne dla punktowych mutacji w obrębie genu desaturazy BnaA.FAD2. Aby poprawić specyficzność tych markerów niezbędne były badania nad stężeniem jonów Mg2+ oraz temperaturą przyłączania starterów (Ta) podczas PCR. W tym celu przy użyciu obu markerów testowano 24 linie rzepaku ozimego, wśród których znajdowały się zarówno formy zmutowane, jak i typu dzikiego. Na żelach agarozowych obserwowano produkty PCR specyficzne dla linii zmutowanych (produkt o wielkości 428 pz dla markera H3Dom oraz produkt o wielkości 506 pz dla markera H4Dom). Gdy zastosowano mniej restrykcyjne warunki reakcji, na żelach pojawiały się także dodatkowe prążki. Mimo to na podstawie uzyskanych wyników można było wybrać optymalne parametry reakcji. Dla markera H3Dom te parametry to: 1,25 mM Mg2+ i Ta = 60C, natomiast dla markera H4Dom optymalne parametry to: 1,25 mM Mg2+ i Ta = 65C.
Authors and Affiliations
Marcin Matuszczak, Stanisław Spasibionek, Irena Tokarczuk
Keywords
Related Articles
- EP ID EP192717
- DOI -
- Views 105
- Downloads 0
Ocena odporności rzepaku ozimego na porażenie przez Leptosphaeria spp. i Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary w doświadczeniach przeprowadzonych w Małyszynie i Borowie, w latach 2007–2009
W pracy przedstawiono dwuletnie wyniki badań odporności odmian rzepaku ozimego na porażenie powodowane przez Leptosphaeria spp. i Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary. Ocenę przeprowadzono w Małyszynie (woj. lubuskie)...
Reakcja różnych typów hodowlanych odmian rzepaku ozimego na poziom stosowanej agrotechniki. I. Charakterystyka dojrzewających roślin rzepaku oraz jego plonowanie i układ elementów plonotwórczych
Podstawę pracy stanowią wyniki trzyletnich ścisłych doświadczeń polowych przeprowadzonych w latach 2005/6–2007/8 w dwóch miejscowościach: Zielęcin (N 52°10’ E 16°22’) i Łagiewniki (N 51°46’ E 17°14’). W doświadczeniach z...
Zmienność nasion różnych typów odmian lnu zwyczajnego Linum usitatissimum L.
Rola genów metalotionein i mikroorganizmów w reakcji rzepaku na działanie czynników stresowych
Investigation of phenotypic distance of F1 CMS ogura winter oilseed rape hybrids and parental lines using multivariate statistical methods
Breeding of oilseed rape cultivars in Poland is based on CMS ogura hybridization system. Effective selection of hybrid parental lines has decisive role in the advancement of hybrid breeding.The aim of this study was the...