[u][/u] Oksydacyjnie modyfikowane i deaminowane zasady DNA jako czynnik epigenetyczny
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2012, Vol 66, Issue 0
Abstract
Omawiane w pracy wyniki badań wskazują, że 5-metylocytozyna (5mC) może ulegać hydroksylacji do 5-hydroksymetylocytozyny (5hmC), a jej zawartość w genomie ssaków ocenia się na około 0,02–0,7% całkowitej zawartości cytozyny. Tak zmodyfikowana zasada jest związkiem pośrednim w procesie aktywnej demetylacji DNA i obecnie nazywa się ją „szóstą zasadą DNA”. Chociaż aktywna demetylacja DNA pozostaje nadal zjawiskiem słabo poznanym, to uważa się, że uczestniczą w tym procesie trzy grupy enzymów: • białka Tet katalizujące przemianę 5mC do 5hmC, która następnie może być utleniana do 5-formylocytozyny (5fC) i 5-karboksylocytozyny (5caC); • AID/APOBEC deaminujące 5mC (lub 5hmC) do tyminy lub 5-hydroksymetylouracylu (5hmU) błędnie parującego z guaniną; • glikozylaza TDG uczestnicząca w ścieżce naprawy DNA typu BER, która usuwa 5fC, 5caC i 5hmU zastępowane następnie cytozyną, czego efektem jest demetylowany DNA. Działanie glikozylazy TDG (i/lub innych glikozylaz DNA) prawdopodobnie poprzedzone jest deaminacją 5mC do tyminy, ponieważ substratem dla TDG są błędne pary G: T. Etap deaminacji zachodzi z udziałem białek rodziny AID/APOBEC. Możliwe jest współdziałanie TDG z wymienionymi deaminazami. Wydaje się, że obecność 8-oksyguaniny (8-oksyGua) w DNA ma nie tylko znaczenie mutagenne. Postulowana jest rola tej oksydacyjnie zmodyfikowanej zasady w regulacji ekspresji genów, poprzez udział w procesie relaksacji chromatyny. Możliwe jest, że 8-oksyGua występująca w specyficznych sekwencjach DNA może uczestniczyć w regulacji transkrypcji, co sugerowałoby epigenetyczne znaczenie obecności tak zmodyfikowanej zasady w DNA.
Authors and Affiliations
Jolanta Guz, Marek Jurgowiak, Ryszard Oliński
Keywords
Related Articles
- EP ID EP66690
- DOI -
- Views 159
- Downloads 0
Cathepsins: innate immune proteases that regulate viral entry into host cells
Cathepsins are group of endolysosomal proteases that regulate the mechanisms of innate and adaptive immunity, including cell adhesion and migration, antigen processing and presentation and resistance to several viral inf...
Kwasy mikolowe – rola biologiczna i potencjalne zastosowanie w wykrywaniu oraz różnicowaniu rodzaju Mycobacterium
Kwasy mikolowe stanowią jeden z podstawowych elementów strukturalnych ściany komórkowej bakterii z podrzędu Corynebacterineae. Związki te są długołańcuchowymi α-hydroksy ß-alkilo kwasami tłuszczowymi, a w ich obrębie wyr...
Charakterystyka wybranych mechanizmów molekularnych wpływających na farmakokinetykę i farmakodynamikę leków przeciwdepresyjnych
Na depresję cierpi ponad 350 milionów ludzi na świecie, a prognozowany jest dalszy wzrost liczby zachorowań. Potrzeba poznania mechanizmów rozwoju tej choroby oraz sposobów jej skutecznego zwalczania ciągle wzrasta. Lecz...
Mechanizmy molekularne w procesie zapłodnienia: rola czynnika męskiego
Zapłodnienie, czyli połączenie gamety męskiej i żeńskiej, to proces skomplikowany i wieloetapowy. Złożoność procesu zapłodnienia, mnogość czynników, które mają nań wpływ, jak i warunki w jakich zachodzi powodują, że pozo...
Hypothalamus-pituitary-thyroid axis activity and function of cardiac muscle in energy deficit
Frequently repeated statement that energy restriction is a factor that improves cardiovascular system function seems to be not fully truth. Low energy intake modifies the hypothalamus-pituitary-thyroid axis activity and...