یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری
Journal Title: مجله علمی- پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی قم - Year 2017, Vol 11, Issue 7
Abstract
زمینه و هدف: سرطان پروستات ازجمله سرطان‌های شایع میان مردان است که ناهمگونی بسیار بالایی را در ویژگی‌های ژنتیکی و پاتولوژیکی از خود نشان می‌دهد. توضیح روابط تنظیمی بین mRNA و microRNA می‌تواند به شناسایی الگوی تنظیم بیان ژن در سرطان پروستات بدخیم کمک کند. در این مطالعه یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری بررسی گردید. روش بررسی: در مطالعه حاضر از داده‌های بیانی (ژن و microRNA) بیماران مبتلا به سرطان پروستات، به‌منظور بررسی شبکه اندرکنش ژنی تومور بدخیم پروستات استفاده شد. شبکه هم‌بیان ژنی وزن‌دار برای گروه‌بندی ژن‌ها و یافتن گروه‌های ژنی که همبستگی قابل‌توجهی با متغیر زمان عود بیوشیمیایی بیماری دارند، به کار برده شد. هدف‌های ژنی microRNAهای با تفاوت بیان از پایگاه‌های داده مبتنی بر پیشگویی و شواهد آزمایشگاهی گردآوری شد. با تلفیق آن با نتایج همبستگی پیرسون داده‌های بیانی ژن و microRNA، شبکه تنظیمی microRNA به دست آمد. یافته‌ها: دوگروه ژنی با همبستگی بالا با زمان عود بیوشیمیایی شناسایی شدند. یکی از این دو در مسیرهای تنظیم و تقسیم چرخه سلولی درگیر شده که جزء مسیرهای مشخصه سرطان است. تلفیق شبکه هم‌بیان با شبکه تنظیمی microRNA نشان داد اولاً این microRNAها، مسیرهایی را هدف قرار می‌دهند که در بدخیم شدن تومور پروستات نقش دارند و دوماً چندین عنصر کلیدی شامل microRNA و ژن را معرفی می‌کنند. نتیجه‌گیری: در مطالعه حاضر، جزئیات بیشتری از اجزای عملکردی کلیدی که باعث بدخیم‌شدن تومور پروستات می‌شوند به دست آمد. این جزئیات ممکن است فرصت‌های جدیدی را برای توسعه روش‌های جایگزین درمانی فراهم کند.
Authors and Affiliations
Mehdi Mehdi, Mohammad Reza Mohammad Reza, Bijan Bijan
Keywords
Related Articles
- EP ID EP467709
- DOI -
- Views 47
- Downloads 0
تأثیر آفلاتوکسین B1 بر پارامترهای هیستومورفومتریک بیضه در موش سوری نر بالغ
زمینه و هدف: آفلاتوکسین B1(AFB1)، میکوتوکسینی است که به‌وسیله قارچ آسپرژیلوس فلاووس و پارازینیکوس تولید میشود. AFB1 در بین چهار نوع AFB1، AFB2، AFB3 و AFN4، فراوان‌ترین و سمی‌ترین نوع در دنیا است. آفلاتوکسین،...
Comparison of Alphapinene and Donpezil Effects on Passive Avoidance Memory in Adult Male Rats
Background and Objectives: Alphapinene as one of the most important Components of essential oils, which has antioxidant and anti-cholinesterase activities. Oxidative stress directly affects the function of the brain and...
The Antifungal Effect of Silver, Copper Nanoparticles, and Their Combination and in combination with Amphotericin B against Candida albicans In Vitro and in Animal Model
Background and Objectives: Candida is a genus of yeasts and is considered as the most common cause of fungal infections in the medical world. In this research, the antifungal activity of silver nanoparticles, copper nano...
نقش آنتاگونیست‌های سروتونرژیک بر یادگیری و حافظه جهت‌یابی در موش‌های صحرایی نر مبتلا به استرس
چکیده زمینه و هدف: هیپوکامپ غنی از گیرنده‌های کورتیکوستروئیدی و سروتونرژیک است و نقش مهمی در حافظه و درک فضایی دارد. در این مطالعه به بررسی اثرات فلوکستین و سیپروهپتادین بر یادگیری و حافظه جهت‌یابی موش‌های صحرایی پرداخته...
تأثیر عصاره هیدروالکلی گل گیاه سنجد بر سطح سرمی استروژن و پروژسترون در موش‌های صحرایی ماده بالغ
زمینه و هدف: سنجد از دیدگاه طب سنتی دارای اثرات درمانی، برای بسیاری از بیماری‌ها است. شکوفه‌ها و گل‌های درخت سنجد موجب تحریک سیستم هورمونی، عصبی و امیال جنسی میشود. در این مطالعه تأثیر غلظت‌های مختلف عصاره گل سنجد بر می...