ZNF304 gen ifadesinde artış ve CXCR4’de azalma ile prostat kanserinde anoikis değişebilir
Journal Title: Ege Tıp Dergisi - Year 2018, Vol 57, Issue 3
Abstract
Amaç: Prostat kanser hücre hattı (DU145) ve prostat normal epitel hücre hatları (RWPE) arasında anoikis mekanizmasını arttıracak veya inhibe edebilecek genlerin analizini yapmak ve kanser gelişiminde olası rolünü incelemek. Gereç ve Yöntem: İnsan prostat epitel hücre hattı (RWPE) ve prostat kanseri hücre hatları (DU-145) Amerikan Tip Kültür Koleksiyonu (ATCC)’den temin edildi. Hücre hatlarının çoğaltılmasında ve sürdürülmesinde RPMI 1640 (Biological Industries) besi ortamı kullanıldı. Transkriptom analizi için RNA izolasyonu yapılarak, kütüphane oluşturuldu, kütüphanenin kantitasyonunun ardından NextSeq500 (illumina) ile sekanslama yapıldı. Dizileme, haritalandırma, bağıl gen ifadeleri ölçümleri gibi biyoinformatik analizler Genomics Workbench v 8 (Qiagen) yazılımı kullanılarak GRCh38 referans sekansı ile yapılmıştır. Bulgular: RWPE Normal prostat epitel hücre kültürleri ile DU145 prostat kanser hücreleri karşılaştırıldığı zaman DU-145 prostat kanser hücre kültürlerinde, ZNF304, PYCARD ve Notch3 gen expresyonlarında anlamlı bir artış (p<0,05) görülürken, CXCR4, Pak3, SerpınB1 gen ekspresyonlarında anlamlı bir azalma (p<0,05) görülmüştür. Sonuç: DU145 prostat kanseri hücre hattında anoikis ile ilişkili önemli gen ekpresyonlarında artış ve azalma gözlemledik. Değişime bağlı olarak hücrelerin anoikisden kaçarak metastatik özellik kazanabileceğini düşündük.
Authors and Affiliations
Şule Ayla, Gülperi Öktem, Cüneyd Parlayan
Keywords
Related Articles
- EP ID EP460432
- DOI -
- Views 94
- Downloads 0
Knowledge and behavior of coiffeur employees about hepatitis in Aksaray city center
Aim: Taking the hepatitis B and hepatitis C prevalence in Turkey into account, the coiffeur employees may play a role in the spread of these diseases and our study aimed to determine the knowledge level and practices of...
New stem cells
Sayın Editör, Ocak ayında sonuçları açıklanan bir çalışma bilim dünyasında dikkatleri üzerine çekti. Bu çalışmada Obokata ve ark. (1), somatik hücrelerin düşük pH gibi düşük bir stres karşısında yeniden programlanarak pl...
A case of pseudotumor cerebri associated with idiopathic hypopara-thyroidism and vitamin B12 deficiency
Idiopathic hypoparathyroidism is a heterogeneous disorder rarely involved in the etiology of pseudotumor cerebri, and characterized by low levels of parathormone accompanying hypocalcemia, hyperphosphatemia and vitamin D...
Evaluation of etiologic factors and electrophysyologic findings in sciatic nerve injury
Aim: Our aim is to investigate the etiological factors and electrophysiological findings. of patients with sciatic nerve injury. Materials and Methods: In the study, the files of the patients who referred to our electro...
Results of active surveillance in low-risk localized prostate cancer patients
Aim: To evaluate the results of active surveillance in low-risk prostate cancer patients. Materials and Methods: Patients who have been diagnosed with low-risk localized prostate cancer and accepted the active surveillan...