ZNF304 gen ifadesinde artış ve CXCR4’de azalma ile prostat kanserinde anoikis değişebilir
Journal Title: Ege Tıp Dergisi - Year 2018, Vol 57, Issue 3
Abstract
Amaç: Prostat kanser hücre hattı (DU145) ve prostat normal epitel hücre hatları (RWPE) arasında anoikis mekanizmasını arttıracak veya inhibe edebilecek genlerin analizini yapmak ve kanser gelişiminde olası rolünü incelemek. Gereç ve Yöntem: İnsan prostat epitel hücre hattı (RWPE) ve prostat kanseri hücre hatları (DU-145) Amerikan Tip Kültür Koleksiyonu (ATCC)’den temin edildi. Hücre hatlarının çoğaltılmasında ve sürdürülmesinde RPMI 1640 (Biological Industries) besi ortamı kullanıldı. Transkriptom analizi için RNA izolasyonu yapılarak, kütüphane oluşturuldu, kütüphanenin kantitasyonunun ardından NextSeq500 (illumina) ile sekanslama yapıldı. Dizileme, haritalandırma, bağıl gen ifadeleri ölçümleri gibi biyoinformatik analizler Genomics Workbench v 8 (Qiagen) yazılımı kullanılarak GRCh38 referans sekansı ile yapılmıştır. Bulgular: RWPE Normal prostat epitel hücre kültürleri ile DU145 prostat kanser hücreleri karşılaştırıldığı zaman DU-145 prostat kanser hücre kültürlerinde, ZNF304, PYCARD ve Notch3 gen expresyonlarında anlamlı bir artış (p<0,05) görülürken, CXCR4, Pak3, SerpınB1 gen ekspresyonlarında anlamlı bir azalma (p<0,05) görülmüştür. Sonuç: DU145 prostat kanseri hücre hattında anoikis ile ilişkili önemli gen ekpresyonlarında artış ve azalma gözlemledik. Değişime bağlı olarak hücrelerin anoikisden kaçarak metastatik özellik kazanabileceğini düşündük.
Authors and Affiliations
Şule Ayla, Gülperi Öktem, Cüneyd Parlayan
Keywords
Related Articles
- EP ID EP460432
- DOI -
- Views 87
- Downloads 0
Left pulmonary artery obstruction due to a large congenital thymic cyst: A rare cause of pulmonary stenosis
Thymic cysts occur relatively rarely and account for only about 3% of all anterior mediastinal masses. They may be either congenital or acquired. They usually present in the first decade after the age of 2 years, possibl...
Autologous stem cell transplantation as a consolidation therapy in acute myeloid leukemia patients
Aim: Autologous stem cell transplantation (ASCT) is a treatment option as a consolidation therapy in acute myeloid leukemia (AML) patients. ASCT may improve disease free survival without effecting overall survival rates...
Spontaneous and rapid resolution of post-traumatic acute subdural hematoma
A-63-year old woman was brought to our clinic with signs of intracranial herniation due to acute subdural hematoma (ASDH) after being involved in a traffic accident. On admission, she had hemiparesis and anisocoria and s...
A novel predictor in acute kidney injury: Neutrophil to lymphocyte count
Aim: Acute Kidney injury (AKI) represents a clinical condition reflecting systemic inflammation. Neutrophil-to-lymphocyte ratio (NLR) is novel prognostic marker in various inflammatory conditions. In this retrospective c...
Sugammadex use in a patient with myastenia gravis
Myastenia gravis is an autoimmune disease involving the neuromuscular junction and patients receiving this diagnosis have a risk of developing postoperative respiratory failure. Similarly, the presence of chronic obstruc...