Analizy molekularne DNA i RNA w wykrywaniu dziedzicznych predyspozycji do nowotworów
Journal Title: Postępy Nauk Medycznych - Year 2010, Vol 23, Issue 7
Abstract
Pojawienie się w użyciu wielofunkcyjnych robotów laboratoryjnych umożliwiło wykorzystanie ich do izolacji DNA i RNA, normalizacji stężeń rozcieńczania badanych próbek, przygotowania reakcji PCR itp. Równoczesny rozwój oprogramowania i komputeryzacja sprawiły, że dzisiaj istnieje możliwość całkowitej automatyzacji procesu przechowywania, dobrze opisanych, łatwych do odnalezienie próbek i ich testowania, łącznie z transferem wyników. Obecnie czołowe firmy oferują sekwenatory umożliwiające jednoczesne sekwencjonowanie 96 próbek w oparciu o elektroforezę kapilarną produktów otrzymanych metodą cykliczną z użyciem dideoksynukleotydów znakowanych barwnikami fluorescencyjnymi. Postęp w tej dziedzinie polegał na opracowaniu nowych żeli i „chemii” umożliwiających analizę sekwencji jednego fragmentu długości prawie 1000 zasad. Oferowane nowe aparaty (GSFLX machine 2007) oparte o równoczesne sekwencjonowanie w czasie rzeczywistym bardzo wielu stosunkowo krótkich fragmentów DNA (około 200 zasad), wykorzystują pirosekwencjonowanie z detekcją luminescencji powstającej przy udziale ATP, lucyferazy lucyferyny. Aparaty te pozwalają na analizę 100 mln zasad jednego dnia.Coraz częściej stosowane są metody PCR w czasie rzeczywistym z użyciem sond TaqMana (i modyfikacji tej metody zwanej w skrócie MGB). Do wykrywania rearanżacji w genach odpowiedzialnych za dziedziczne predyspozycje do nowotworów i innych chorób stosuje się technikę MLPA, która w oparciu o reakcję ligacji specyficznych sond i reakcję amplifikacji pozwala na ocenę liczby kopii eksonów. Na jej podstawie można wnioskować o delecjach bądź duplikacjach fragmentów lub całych genów. Oferowane gotowe zestawy sond dotyczą najważniejszych znanych genów silnie predysponujących do nowotworów takich jak: ATM, BRCA1, BRCA2, CHEK1, MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, APC, FANCA, FANCD2, PTCH, BMPR1A, SMAD4, TP53, CDH1, MEN1, NF1, NF2, STK11, SMARCB1, RB1, CDKN2A-CDKN2B, WT1.
Authors and Affiliations
Dagmara Dymerska, Pablo Serrano-Fernández, Joanna Trubicka, Bartłomiej Masojć, Grzegorz Kurzawski
Keywords
Related Articles
- EP ID EP53927
- DOI -
- Views 156
- Downloads 0
Błony, oporna na detergenty frakcja błon i tratwy lipidowe
W ciągu ostatnich 85 lat znajomość budowy błon komórkowych ewoluowała od dwuwarstwy lipidowej do aktualnego modelu błony będącej mozaiką dynamicznych, heterogennych domen. Nierozpuszczalna w detergentach frakcja błon (DR...
Percutaneous treatment of iatrogenic femoral artery pseudoaneurysms
Introduction. Percutaneous examinations and procedures are widely used in cardiology and interventional radiology. They enable accurate diagnosis and intravascular treatment of vascular diseases.Percutaneous procedures a...
Psychogenic movement disorders
Psychogenic movement disorders (PMDs) are characterized by abnormal motor behaviors. These may resemble organic tremor, dystonia, chorea, tics etc. The spread of movement is often nonanatomical. Distractibility reduces o...
Zastosowanie cytometrii przepływowej w immunohematologicznej ocenie krwinek czerwonych
Cytometria przepływowa (<i>flow cytometry</i> – FC) jest nowoczesną techniką badawczą i diagnostyczną, umożliwiającą charakterystykę jakościową i ilościową różnych populacji komó...
Codependency, traumatic events and posttraumatic stress symptoms in hospitalized and non hospitalized women from alcoholic families
Introduction :Codependency is defined as dysfunctional style of close relation with alcoholic. It is increasing risk of traumatic experiences and mental disturbances Aim: Assessment of the general heath, as so the freque...