Association of TP53 Arg72Pro polymorphism (rs1042522) with bladder cancer risk in the Ukrainian population
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 23, Issue
Abstract
Aim. To determine the frequency of TP53 polymorphic variants in bladder cancer patients and define possible association of this polymorphism with a bladder cancer in Ukrainians patients. Methods. The genotypes of TP53 gene at codon 72 were detected by PCR with allele specific primers. We investigated Arg72Pro polymorphism in 114 DNA samples of patients with bladder cancer. The PCR-amplified DNA products were subjected to electrophoresis in 3 % agarose. Results. The distribution of genotypes in group of patients with a bladder cancer was: Arg/Arg – 59.6 % (n=68), Arg/Pro – 40.4 % (n=46), Pro/Pro – 0 % (n=0). Genotype frequencies in patients (χ2=7.28, p=0.0007) weren’t in agreement with Hardy-Weinberg equilibrium. There were significant differences in the frequency of genotypes between the healthy individuals and the cancer group patients. Our result showed that patients with bladder cancer had a significantly higher frequency of Arg/Arg (F=42.7, p<0.05) and a lower frequency of Pro/Arg (F=40.9, p<0.05) compared to controls. Conclusions. Our study allows us to suggest that Arg/Arg polymorphic variant of TP53 is associated with the higher risk of bladder cancer development in the Ukrainian population (OR = 5,6, 95 % CI = 3.19 to 9.34, p < 0.0001). Keywords: TP53 gene, bladder cancer, polymorphism Arg72Pro, Ukrainian population.
Authors and Affiliations
Я. М. Міщук, Є. В. Харківська, С. В. Серга, С. Є. Шкляр, О. Е. Стаховський, Е. О. Стаховський, Ю. В. Вітрук, А. А. Кононенко, Л. І. Остапченко, І. А. Козерецька
Нерівномірний розподіл гаплогруп Y-хромосоми в обласних популяціях українців
Мета. Метою роботи було порівняти спектри частот гаплогруп Y-хромосоми серед українців із різних областей, виявити нетипові популяції і визначити їх особливості. Методи. Досліджено вибірку українців (n = 1141) з 12 облас...
Кілька слів про Т.Х. Моргана і М.М. Гришка та про генетику й епігенетику (з нагоди проведення ХІ Міжнародної наукової конференції «Фактори експериментальної еволюції організмів»)
Кілька слів про Т.Х. Моргана і М.М. Гришка та про генетику й епігенетику (з нагоди проведення ХІ Міжнародної наукової конференції «Фактори експериментальної еволюції організмів»)
Renewing DNA integrity by cell repair systems
The four of six main cell repair systems have been reviewed. Some of them have been studied by Nobel laureates of 2015 year in the field of chemistry. The common title of their work is “For investigation of DNA repair me...
Polymorphism upstream the coding region of the Ppd-D1 gene in Aegilops tauschii Coss.
Aim. Evaluate time of heading and flowering in Aegilops tauschii Coss. accessions, donor of the bread wheat D genome, that are differentiated by polymorphism at upstream the coding region of the Ppd-D1 gene. Method...
Аналіз локусів Glu-1 у зразків малопоширених видів пшениці та їх гібридів
Мета. Визначення алельного складу локусів Glu-1 у зразків малопоширених видів пшениці та їх гібридів із м’якою ярою пшеницею. Методи. ПЛР-аналіз. Результати. У наявних колекційних зразках малопоширених видів пшениці в ос...