Los pastos marinos ofrecen diversos servicios ecosistémicos como la estabilización del sustrato mejorando la calidad del agua. El objetivo de esta investigación fue analizar el estado de la pradera de pastos marinos del Parque Nacional Cahuita en relación con las variables físico química y las condiciones atmosféricas en dos periodos de tiempo. Se escogieron tres sitios con tres transectos a diferentes profundidades separados por 25 metros. En cada uno se muestrearon 11 parcelas separadas entre ellas por 5 m. Se utilizaron marcos de 50 x 50 cm para medir la cobertura. Las variables ambientales fueron suministradas por el IMN. Con el programa Statistica versión 14 se realizaron las pruebas de normalidad análisis no paramétricos de Kruskall-Wallis y Mann-Whitney para determinar la diferencia entre la cobertura de los sitios muestreados y fechas de muestreo. Con Arc Map 10.8 se realizó un mapa con gráficos circulares para obtener la cobertura. La salinidad presentó diferencias significativas en los tres sitios. La temperatura presentó diferencias significativas entre los dos periodos y entre los sitios T. testudinum fue la especie dominante y presentó los valores más altos en Punta Vargas y Punta Cahuita. Los pastos marinos han cambiado temporalmente en cuanto a la cobertura por especie probablemente en respuesta a las variaciones entre los tres diferentes sitios en que se realizaron los muestreos. Se recomienda realizar estudios de nitratos y fosfatos para conocer la afectación en este ecosistema.