Molecular Mechanics Simulation and Ftir Spectrocopy Optimization of Secondary Structure of Aβ (25-35) Peptide
Journal Title: Scientific Work - Year 2024, Vol 18, Issue 9
Abstract
Abstract In this study, we probed the secondary structure of a soluble Aβ (25-35) peptide in water solution by applying a molecular mechanics method as well as infrared spectroscopy. We have used Fourier Transformed Infrared Spectroscopy (FTIR) to examine the secondary structure of this peptide. The amide I bands of Ab (25-35) obtained from transmission-FTIR spectra consists of one main band at 1658 cm-1, at both concentrations used (200 mM and 1 mM). This band shows us that Ab (25-35) in aqueous solution was mostly organized into a a-helical structure (48 %). The contribution of the unordered structure was found to be about 12 %. The proportion of b-sheet and b-turn structures are slightly lower, 12-15 % and 13-14 %, respectively for both concentrations. FTIR spectra of the peptide in water solution (100 µM) after incubation for 12h showed Aβ peptide conformation is critically dependent on the environmental conditions used. The simulation approach reveals that the C-terminal octapeptide of this molecule preferably adopts an α-helical structure, while the N-terminal tripeptide may exist as a β-turn and unordered structures.
Authors and Affiliations
Gulyaz Najafova French-Azerbaijani University (UFAZ) under the Azerbaijan State Oil and Industry University Ph. D. student Gulshan Aghayeva Scientific Research Institute of Physics Problems at Baku State University
Keywords
Related Articles
- EP ID EP747388
- DOI 10.36719/2663-4619/106/45-52
- Views 8
- Downloads 0
Uşaqlarda nekrotik enterokolit zamanı müalicə taktikasının xüsusiyyətləri və reabilitasiyası
Xülasə Məqalədə uşaqlarda nekrotik enterokolit (NEK) zamanı müalicə taktikasının xüsusiyyətləri və reabilitasiyasına dair qısa məlumatlar verilmiş, son illər bu problemin öyrənilməsi üzrə əldə edilən uğurlar və təcrüb...
DIGITAL LEARNING INNOVATIONS
Abstract In recent years, there has been a lot of focus on digital learning, which is being used more and more to replace in-person instruction and distant learning. This essay describes digital learning at the outset...
Kənd təsərrüfatında yerüstü suvarma texnikalarının və üsullarının əhəmiyyəti
Xülasə Tədqiqatın məqsədi: yerüstü suvarma üsulunun tədqiq olunması, həmçinin tədqiq olunarkən lazım olan optimal suvarma rejimləri haqqında lazımi nəticələrin əldə olunması, bununla yanaşı, bu üsulun və bu üsula aid...
Uşaqlarda nekrotik enterokolitin etiologiyası və yayılması
Xülasə Məqalədə uşaqlarda nekrotik enterokolitin etiologiyası və yayılmasına dair qısa məlumatlar verilmiş və son illər bu problemin öyrənilməsi üzrə əldə edilən uğurlar və təcrübə paylaşılmışdır. Yenidoğulanlarda nek...
Kütləvi idman tədbirləri zamanı təhlükəsizliyin təmin edilməsində müasir informasiya texnologiyalarından və texniki vasitələrdən istifadənin hüquqi aspektləri
Xülasə Hazırkı məqalə kütləvi idman tədbirlərinin təşkil olunması və keçirilməsi zamanı ictimai təhlükəsizliyin təmin edilməsi institutu tətbiq edildikdə təcrübəyə gətirilən müasir informasiya texnologiyalarından və t...