Molecular Mechanics Simulation and Ftir Spectrocopy Optimization of Secondary Structure of Aβ (25-35) Peptide
Journal Title: Scientific Work - Year 2024, Vol 18, Issue 9
Abstract
Abstract In this study, we probed the secondary structure of a soluble Aβ (25-35) peptide in water solution by applying a molecular mechanics method as well as infrared spectroscopy. We have used Fourier Transformed Infrared Spectroscopy (FTIR) to examine the secondary structure of this peptide. The amide I bands of Ab (25-35) obtained from transmission-FTIR spectra consists of one main band at 1658 cm-1, at both concentrations used (200 mM and 1 mM). This band shows us that Ab (25-35) in aqueous solution was mostly organized into a a-helical structure (48 %). The contribution of the unordered structure was found to be about 12 %. The proportion of b-sheet and b-turn structures are slightly lower, 12-15 % and 13-14 %, respectively for both concentrations. FTIR spectra of the peptide in water solution (100 µM) after incubation for 12h showed Aβ peptide conformation is critically dependent on the environmental conditions used. The simulation approach reveals that the C-terminal octapeptide of this molecule preferably adopts an α-helical structure, while the N-terminal tripeptide may exist as a β-turn and unordered structures.
Authors and Affiliations
Gulyaz Najafova French-Azerbaijani University (UFAZ) under the Azerbaijan State Oil and Industry University Ph. D. student Gulshan Aghayeva Scientific Research Institute of Physics Problems at Baku State University
Keywords
Related Articles
- EP ID EP747388
- DOI 10.36719/2663-4619/106/45-52
- Views 40
- Downloads 0
REKLAM MƏTNLƏRİNİN DİL VƏ ÜSLUB XÜSUSİYYƏTLƏRİ HAQQINDA
Xülasə Bu məqalədə reklam mətnlərinin linqvistik və üslub xüsusiyyətlərindən bəhs edilir. Müəlliflər reklam mətnlərini daha təsirli və yaddaqalan edən dil xüsusiyyətlərini təhlil edirlər. Xüsusilə, lüğət seçimi, allit...
The Military-Political Role of I Shah Ismail in the Establishment of the Safavid Empire
Abstract The 16th century is a historical period characterized by the beginning of a new phase in world history. This historical period ended with the political unification of national regions and the formation of ce...
LOGİSTİK STRATEGİYALARIN İŞLƏNMƏSİNİN NƏZƏRİ ƏSASLARI, KONSEPSİYALARI VƏ VƏZİFƏLƏRİ
Xülasə Logistika maddi texniki ehtiyatların axını və saxlanmasının səmərəliliyini planlaşdırma, həyata keçirmə və izləmə prosesidir. Bir məhsulun nəqliyyat, saxlama, gömrük rəsmiləşdirilməsi, qablaşdırma, paylama kimi...
AZƏRBAYCAN ORTA MƏKTƏBLƏRİNDƏ DİSTANT TƏHSİLİN İDARƏOLUNMASINDA DƏYİŞƏN PERSPEKTİVLƏR
Təqdim olunan məqalə Azərbaycanda ümumi təhsil məktəblərində distant təhsil sahəsində problemlərin aradan götürülmüəsi sahəsində müasir perspektivlər və yeni modellərin öyrənilməsindən bəhs edir. Məlumdur ki, distant təh...
ÜNSİYYƏT VƏ SÖZÜN GÜCÜ
Xülasə Dünyanın bütün dahiləri ünsiyyət zamanı sözün insan zehninə, ağlına, ruhuna və qəlbinə təsirini, sözün ən güclü faktor olmasını zaman-zaman vurğulayıblar. Söz istər pozitiv, istər neqativ anlamda insan həyatını...