Молекулярна організація 5S рДНК двох українських популяцій явора (Acer pseudoplatanus)
Journal Title: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів - Year 2016, Vol 14, Issue 2
Abstract
Мета. Генетична мінливість деревних порід все ще залишається мало дослідженою на молекулярному рівні. З огляду на порівняно низьку швидкість молекулярної еволюції у деревних багаторічних видів, для вивчення їх внутрішньовидового різноманіття слід обирати лише ті ділянки геному, які демонструють найвищу мінливість, напр., 5S рДНК. Відповідно, для оцінки потенціалу 5S рДНК в якості молекулярного маркера у деревних порід, було порівняно організацію цієї ділянки у представників двох географічно віддалених українських популяцій явора Acer pseudoplatanus. Методи. ПЛР-ампліфікація, клонування та розшифрування нуклеотидної послідовності МГС 5S рДНК A. pseudoplatanus. Результати. Встановлено, що у геномі A. pseudoplatanus присутній лише один клас повторів 5S рДНК довжиною 475 нп. Потенційні зовнішні елементи промотора РНК-полімерази ІІІ, які локалізуються у МГС, відрізняються від описаних у літературі для представників інших родин покритонасінних рослин. Рівень внутрішньогеномної подібності повторів 5S рДНК перевищує 99%, тоді як подібність МГС індивідуумів, які належать до різних популяцій явора становить лише 93,9-94,3%. Висновки. Висока швидкість молекулярної еволюції МГС 5S рДНК дозволяє використовувати порівняння цієї ділянки для оцінки генетичного різноманіття у популяціях A. pseudoplatanus.Ключові слова: 5S рДНК, молекулярна еволюція, внутрішньовидова мінливість, Acer.
Authors and Affiliations
O. O. Rusak, V. I. Petrashchuk, I. I. Panchuk, R. A. Volkov
Keywords
Related Articles
- EP ID EP613745
- DOI 10.7124/visnyk.utgis.14.2.691
- Views 81
- Downloads 0
Viktor Anatoliyovych Kunakh (to the 70th anniversary of his birth and 50th anniversary of research activity)
Complex analysis of total protein content in bread wheat containing GPC-B1 gene from Triticum turgidum SSP. dicoccoides
Aim. The purpose of our study was to determine the content of total protein in the F5 generation grains, the carriers of the Gpc-B1 gene from Triticum turgidum ssp. dicoccoides by two methods, which in turn would confirm...
Юрій Миколайович Мішкуров (до 80-річчя від дня народження)
Відділ генетики клітинних популяцій Інституту молекулярної біології і генетики НАН України: історія та головні наукові здобутки (до 30-річчя від часу заснування)
У статті коротко розглянуто основні віхи історії Відділу генетики клітинних популяцій, створеного у 1988 р. в Інституті молекулярної біології і генетики постановою Президії АН УРСР. Саме у цьому Відділі та його попередни...
Molecular organization of 5S rDNA in two ukrainian populations of sycamore (Acer pseudoplatanus)
Aim. The genetic variability of tree species has still not been studied enough at the molecular level. Considering the relatively low rate of molecular evolution in perennial tree species, it is necessary to use only tho...