Оцінка структурних особливостей взаємодії глазіовіаніну А з α-, β- та γ тубулінами людини
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Мета. Визначення особливостей ліганд-білкової взаємодії глазіовіаніну А з молекулами α-, β- і γ-тубулінів людини. Методи. Моделювання просторової структури цільових білків (I-Tasser) і лігандів, молекулярний докінг (CCDC Gold), обрахунок молекулярної динаміки (GROMACS). Результати. За допомогою програмного пакета CCDC Gold було виконано молекулярний докінг глазіовіаніну А у сайт ГТФ/ГДФ α-/β- і γ-тубуліну, а також у сайт зв’язування колхіцину. Отримані ліганд-білкові комплекси було досліджено із використанням молекулярної динаміки. Висновки. Показана здатність молекул тубуліну людини зв’язуватися з глазіовіаніном А, що дозволяє розглядати похідні цієї сполуки як перспективні ефектори тубуліну. Визначені показники енергій зв’язування ліганду і мішені підтверджують значно більшу афінність до молекул β-тубуліну, а також висунуто припущення, що зв’язування глазіовіаніну А з β-тубуліном може здійснюватися за двома альтернативними сайтами: 1) ГТФ/ГДФ-обмінним сайтом та 2) сайтом зв’язування колхіцину. Ключові слова: тубулін, зв’язування, глазіовіанін А, протипухлинна активність.
Authors and Affiliations
П. А. Карпов, С. І. Співак, О. В. Раєвський, О. Ю. Нипорко, С. П. Ожерєдов, Я. Б. Блюм
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618807
- DOI -
- Views 37
- Downloads 0
Methodological problems of biotic diagnostics of antropogenic transformation of forest ecosystems at the levels of organization of life
Aim. The purpose of the study was to identify and systematize the methodological problems of the diagnosis of anthropogenic transformation of forests by the levels of organization of life. Methods. Theoretical methods of...
Molecular genetic test system for diagnosis of x-linked agammaglobulinemia
Aim. Primary immunodeficiencies are disorders in which immune system is missing or does not function normally due to genetic disorders. X-linked agammaglobulinemia (XLA) is a rare genetic disorder in which don’t generate...
Thermodynamic prognosis of the efficiency of toxic metals extraction from solution by microorganisms and their genetic potential
Aim. Thermodynamic justification of pathways of microbial interaction with metals and development of theoretical foundations of novel biotechnologies for purification of industrial waste water from environmentally hazard...
Intravarietal intron-length polymorphism of β-tubulin genes in belorussian landraces of Linum usitatissimum L.
Aim. The aim of the work was to evaluate the possibilities of using the β-tubulin intron length (TBP, Tubulin Based Polymorphism) for genetic differentiation of ancient flax varieties (landraces), plants that was hi...
Біохімічний аналіз і оцінка сучасних однодомних сортів конопель Cannabis sativa L. за вмістом канабіноїдних речовин
Мета. Визначення особливостей формування канабіноїдних сполук у сучасних однодомних сортах конопель має як теоретичне, так і практичне значення. Методи. Для хроматографічного аналізу використали зразки рослин сучасних од...